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鼻咽癌EMT相关基因的筛选及生物信息学分析被引量：2: 2010年; 目的利用生物信息学方法挖掘鼻咽癌上皮间充质转化(epithelial-mesenchymal transition,EMT)发生的潜在分子机制。方法从公共基因芯片数据库GEO(gene expression omnibus)中寻找并下载鼻咽癌的相关基因芯片数据,并使用Genclip软件对下载的数据进行分析,寻找鼻咽癌公共基因芯片数据中与EMT相关的基因,并用生物信息学方法对筛选出来的基因作进一步分析。结果在公共的鼻咽癌芯片数据中找到35个与EMT相关的差异表达基因,这些基因功能大致与细胞组分、细胞粘附、通信、信号转导、分化、运动、迁移以及细胞表面受体相关的信号转导等有关,这些功能往往都被认为与肿瘤的侵袭和转移有关。结论利用生物信息学的方法能有效分析基因芯片数据并获取生物内在信息。鼻咽癌EMT是由于多种基因表达改变所致,这为确定鼻咽癌早期转移诊断标志与预后的预示开辟了新的思路。; 陈靖樊英李佳黄仲曦姚开泰; 关键词：鼻咽癌 EMT 生物信息学 GEO

论教学中师生交流关系的建构被引量：1: 2012年; 师生间的有效沟通是促进教学的前提条件,为了更好的提高教学效果,本文探讨了师生间的有效沟通方式。本文认为,师生多接触,多了解学生,尊重学生,平等、真诚的对待每一个学生,发现他们的优点并赞赏它,采用换位思考,使得师生进行有效的沟通,可以促进教学效果提高。; 樊英; 关键词：有效沟通

鼻咽癌细胞系候选癌基因的筛选被引量：5: 2010年; 目的:利用SNP芯片和基因表达谱芯片数据筛选鼻咽癌细胞系CNE1、CNE2、HONE1中的候选癌基因。方法:SNP芯片检测DNA拷贝数,基因表达谱芯片检测3个鼻咽癌细胞系与人永生化鼻咽上皮细胞系NP69基因表达水平,Ensembl database将SNP数据、基因表达谱数据和人类基因组中已知的DNA拷贝数改变数据整合,筛选候选癌基因,生物信息学进一步分析功能。结果:筛选出候选癌基因102个,包含许多功能群,参与各种信号通路。结论:为癌基因的筛选提供了一种研究方法;筛选鼻咽癌细胞系中候选癌基因,对其的进一步研究有助于认识鼻咽癌的发病机制,为鼻咽癌的诊断和治疗提供理论基础。; 樊英李佳黄仲曦姚开泰; 关键词：鼻咽肿瘤基因表达谱芯片

携人PTHLH基因慢病毒表达载体的构建: 2012年; 目的构建携带人甲状旁腺相关激素(PTHLH)基因的慢病毒表达载体pGC-FU/PTHLH。方法酶切载体pGC-FU,根据人PTHLH基因合成特定引物,扩增目的基因片段,将其克隆到pGC-FU质粒(含EGFP基因)上,菌落PCR鉴定及测序分析重组载体,使用Lipofectamine 2000诱导转染pGC-FU、pHelper1.0和pHelper2.0载体三质粒进入293T细胞包装慢病毒,并用带PTHLH的慢病毒感染293T细胞和鼻咽癌CEN1细胞确认慢病毒包装是否成功。结果菌液PCR产物琼脂糖凝胶电泳鉴定显示,与理论预计值阳性转化子735bp,阴性转化子198bp基本相吻合;PCR鉴定阳性的克隆进行测序和比对分析,结果完全匹配,进一步鉴定载体构建成功。分别将质粒包装系统共转染293T细胞,包装产生空白对照慢病毒(pGC-FU)和过表达PTHLH的慢病毒(pGC-FU/PTHLH);或用携带PTHLH和EGFP基因的病毒上清感染CNE1细胞,48h后,倒置荧光显微镜下观察293T和CNE1细胞,均可见绿色荧光,转染成功。结论成功构建携人PTHLH基因慢病毒表达载体,为进一步研究PTHLH基因在鼻咽癌转移中的作用及鼻咽癌发病分子机制奠定了基础。; 樊英李佳陈靖黄仲曦姚开泰; 关键词：慢病毒载体

鼻咽癌细胞株可能相关瘤基因/抑瘤基因的初步筛选和PTHLH的过表达研究: 鼻咽癌(Nasopharyngeal carcinoma,NPC)是一种上皮源性恶性肿瘤,绝大多数属于低分化鳞状细胞癌,恶性程度高,早期易发生淋巴结和全身远处转移,具有相当高的死亡率。鼻咽癌的地区分布极不均衡,在我国南方...; 樊英; 关键词：鼻咽癌瘤基因抑瘤基因细胞增殖; 文献传递

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樊英