王向红
- 作品数:27 被引量:76H指数:4
- 供职机构:温州大学物理与电子信息学院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金浙江省自然科学基金中国博士后科学基金更多>>
- 相关领域:理学自动化与计算机技术生物学机械工程更多>>
- 二维蛋白质分子的热力学性质研究被引量:1
- 2002年
- 采用二维正方形格点模型 ,用完全计算法研究了蛋白质分子的热力学性质 .发现体系的配分函数 Z与链长 N存在关系 :ln Z=a N + b,其中 a,b仅与温度、相互作用有关 .总简并度 g0 (m)与链长 N存在关系 :g0 (m) =a· γN ,其中 a=0 .0 9,γ=2 .72 .同时计算了蛋白质分子在自然状态构象间的平均距离 ,发现当链长 N较大时 ,平均距离趋于 1.6 7.
- 王向红陶前夏阿根支义英
- 关键词:蛋白质分子热力学性质简并度氨基酸分子结构
- 刚体的惯量主轴和主转动惯量被引量:2
- 1994年
- 本文通过矩阵和坐标变换给出了求刚体对任一点的惯量主轴及主转动惯量的一般方法,从理论上证明刚体对任一点的惯量主轴的存在性,并讨论了刚体的对称性与惯量主轴的关系。
- 王向红
- 关键词:惯量主轴刚体对称性
- 概率布尔网络动态特性及其结构分析被引量:1
- 2009年
- 从网络灵敏度和概率布尔网络基因状态间的转化2个方面分析、研究了概率布尔网络的动态特性,把网络灵敏度的概念从布尔网络引入到概率布尔网络中,得出了概率布尔网络灵敏度的计算方法.最后从网络结构方面进一步分析概率布尔网络的动态特性,把概率布尔网络分解为基础布尔网络,从而利用结构简单明了的布尔网络分析结构更为复杂的概率布尔网络及其稳态分布,并以实例说明该方法.
- 官铬钢刘文斌王向红
- 关键词:基因调控网络动态特性稳态分布
- 蛋白质分子的HNP格点模型被引量:5
- 2004年
- 从 6 0种球形蛋白质的结构出发 ,采用Miyazawa Jernigan相互作用矩阵 ,计算了蛋白质分子中氨基酸之间的相互作用能 .发现构成蛋白质分子的 2 0种氨基酸可分成疏水 (Hydrophobic ,H)、中性 (Neutral,N)、亲水(Hydrophilic ,P)基团 .在计算它们之间相互作用能的基础上 ,建立了蛋白质分子的HNP格点模型 .用这个模型计算了二维蛋白质分子在自然态 (Nativestate)时的构象性质 .同时研究了氨基酸序列为HHNHNPNHPP HPNPPHPHPPHHPHNH的折叠过程 ,得到其基态能量为 - 6 4 89RT .
- 王向红章林溪赵得禄
- 关键词:蛋白质分子氨基酸相互作用能折叠过程
- 二维HP格点模型中的紧密高分子链构象及其热力学性质的研究被引量:12
- 2002年
- 采用二维HP模型用精确计数法和MonteCarlo方法研究了链长为N(≤ 2 2 )的紧密高分子链的构象和热力学性质 .发现不同HP序列的紧密高分子链的平均自由能和平均配分函数与链长N存在关系 :〈F〉=aN+b , ln〈Z〉=a′N +b′ .同时发现对于可折叠成基态且简并度为 1的紧密高分子链 ,其平均自由能和平均配分函数与链长N也存在相似的关系 .在HP模型中对于链长为N的紧密高分子链 ,存在着 2 N + 1 个不同的HP序列 .我们发现可以折叠成基态且简并度为 1的蛋白质分子的HP序列数目NS 为NS =a× 2 N+ 1 (a =0 0 2 5 ) ,对应的HP序列中 ,疏水基团 (H)数目的含量为 4 0 %~ 6 0 %的序列出现的几率最大 .同时在这些紧密高分子链中有些具有相同的结构 ,发现结构的‘简并度’为 3 3~ 4 0 (10≤N≤ 16 ) .在紧密高分子链折叠过程中 ,折叠的初期能量下降比较快 ,折叠的中期能量下降比较缓慢 。
- 章林溪金进生王向红叶高翔赵得禄
- 关键词:构象热力学性质MONTECARLO方法折叠
- 基于哈密顿因子的蛋白质结构类研究
- 2011年
- 应用图论的哈密顿路模型研究了蛋白质结构类型,统计来自PDB的α型、β型、α+β型、α/β型单链蛋白质结构的哈密顿因子并进行方差分析,统计结果表明蛋白质结构不同类型的哈密顿因子存在显著差异,p值为0.0313.研究为蛋白质结构类研究提供了新的思路.
- 史小红董亚非刘文斌王向红
- 关键词:方差分析
- 纳米复合体系中环形高分子链的构型
- 2018年
- 采用分子动力学模拟方法对纳米复合体系中环形高分子链的构型及纳米粒子的集聚行为进行了研究.在不同纳米粒子/高分子链吸附能作用下,复合体系中纳米粒子表现出3种集聚行为:直接接触集聚、均匀分散以及高分子与纳米粒子间的桥接集聚.同时考虑了环形高分子链的刚性强度,得到了环形高分子链的3个构型:中间吸附、马鞍型吸附和轨道绕行型吸附.研究发现,增强环形高分子链的刚性将有助于促进纳米复合体系中纳米粒子间的分散.
- 宋青亮王向红
- 关键词:分子动力学构型
- DNA计算的研究进展被引量:14
- 2006年
- DNA计算是近年来出现的一种新的自然计算方法,因为其具有高度的并行性和海量的存储能力,引起了科学家的关注.本文将主要从DNA计算模型、布尔电路的模拟、基于DNA的大规模数据库及其在生物信息学中的应用等几个方面,介绍DNA计算近年来的研究和发展状况.最后,我们对DNA计算研究的前景和今后的发展方向进行了展望.
- 刘文斌朱翔鸥王向红陈丽春
- 关键词:DNA计算遗传算法生物信息学
- 用反射式光纤位移传感器测定杨氏弹性模量被引量:3
- 2003年
- 根据反射式光纤位移传感器的工作原理,利用其前坡线性部分对微小量进行测量。对杨氏弹性模量E用反射式位移传感器与传统的光杠杆法测量进行比较,得出无论从操作方面还是数据的精确度方面都说明了光纤传感器法大大优于光杠杆法。进而探讨用光纤传感器测量微小位移的可行性。
- 凌银海王向红姚旭雷陈涨涨
- 关键词:杨氏弹性模量反射式光纤位移传感器物理实验
- 三粒子纠缠相干态的隐形传态(英文)被引量:20
- 2003年
- 提出了一个利用一个两粒子最大纠缠相干态和一个三粒子纠缠相干态作为量子信道进行三粒子纠缠相干态隐形传态的方案 该方案只需线性光学操作和双模光子数测量 计算结果表明 ,应用本方案的设置 ,隐形传态成功的概率与所用的相干态的平均光子数有关 。
- 郑亦庄王向红郭光灿
- 关键词:隐形传态量子信道平均光子数量子光学