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吴娜
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6
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供职机构:
中国科学院上海应用物理研究所
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中国科学院知识创新工程重要方向项目
国家自然科学基金
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相关领域:
文化科学
生物学
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合作作者
李宾
中国科学院上海应用物理研究所
胡钧
中国科学院上海应用物理研究所
樊友杰
宁波大学理学院物理系
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作者
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李宾
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吴娜
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樊友杰
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2012
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化学因素对基于DNA折纸界面上的核酸适配体与凝血酶相互作用影响的研究
2013年
核酸适配体(aptamer)与DNA折纸都是由DNA分子折叠而成,两者具有得天独厚的相似性与相容性。本文将aptamer修饰在DNA折纸界面预先设定的位置上,通过原子力显微镜成像手段,在单分子水平上研究了化学因素对DNA折纸界面上的aptamer与凝血酶(thrombin)反应的影响。实验结果表明:修饰固定在DNA折纸界面上的aptamer与thrombin间的结合能力与缓冲液、某些金属离子及其浓度相关,发现HEPES缓冲液是一种比较适合基于DNA折纸的aptamer与thrombin反应的化学反应环境,在此缓冲体系中加入一定浓度的Mg2+和K+是保持反应体系稳定性及其DNA空间构型的有效途径。该研究结果有助于加深对aptamer的三维结构以及与靶分子间的对应识别关系的理解,对DNA折纸与aptamer在生物分子识别的研究和应用方面将起到一定的借鉴作用。
樊友杰
吴娜
李宾
关键词:
原子力显微镜
核酸适配体
凝血酶
化学因素
单个生物分子反应实时原位表征方法
本发明公开了一种单个生物分子反应实时原位表征方法。该方法包括如下步骤:将反应物I固定于DNA折纸设计位点,然后对修饰有反应物I的DNA折纸进行原子力显微镜成像,之后加入与所述反应物I对应结合的反应物II,并持续扫描成像收...
吴娜
李宾
胡钧
一种涉及DNA折纸的方法及其结构和应用
本发明公开了一种涉及DNA折纸的方法及其结构和应用。本方法包括步骤:1)制备末端修饰反应物I的DNA折纸订书钉链,并且使该订书钉链末端和该反应物I之间含有一连接体;2)将步骤1)所得的订书钉链和脚手架链进行自组装;3)加...
吴娜
李宾
胡钧
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一种涉及DNA折纸的方法及其结构和应用
本发明公开了一种涉及DNA折纸的方法及其结构和应用。本方法包括步骤:1)制备末端修饰反应物I的DNA折纸订书钉链,并且使该订书钉链末端和该反应物I之间含有一连接体;2)将步骤1)所得的订书钉链和脚手架链进行自组装;3)加...
吴娜
李宾
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单个生物分子反应实时原位表征方法
本发明公开了一种单个生物分子反应实时原位表征方法。该方法包括如下步骤:将反应物I固定于DNA折纸设计位点,然后对修饰有反应物I的DNA折纸进行原子力显微镜成像,之后加入与所述反应物I对应结合的反应物II,并持续扫描成像收...
吴娜
李宾
胡钧
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一种基于DNA折纸的生物分子亲和常数测定方法
本发明公开了一种基于DNA折纸的生物分子的亲和常数测定方法。所述生物分子包括能够彼此结合与解离的反应物Ⅰ和反应物Ⅱ,该方法包括(1)将反应物Ⅰ连接于DNA折纸订书钉链末端,然后和脚手架链进行自组装形成DNA折纸;(2)加...
樊友杰
李宾
吴娜
胡钧
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