李顺
- 作品数：8 被引量：22H指数：3
- 供职机构：遵义师范学院更多>>
- 发文基金：重庆市自然科学基金国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 乌江网箱养殖丁鱥细菌的分离与分子鉴定被引量：5
- 2009年
- 利用微生物学常用的细菌分离、纯化方法从丁鱥中分离出9株菌株,编号分别为Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ、Ⅴ、Ⅵ、Ⅶ、Ⅷ、Ⅸ.分别扩增出9株菌株的16S rRNA基因约600 bp的片段,并对其测序,将测序结果输入到NCBI(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/)中,用BLAST工具对序列进行同源性比对分析,并利用MEGA4绘制系统进化树.结果表明:9株菌株的16S rRNA基因测序结果分别与不动杆菌(Acinetobacter)、嗜水气单胞菌(Aeromonas hydrophi-la)、希瓦氏菌(Shewanella baltica)、不动杆菌(Acinetobacter)、希瓦氏菌(Shewanella baltica)、霍乱弧菌(Vibriocholerae)、枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)、杀鲑气单胞菌(Aeromonas salmonicida)、肺炎克雷伯氏菌(Klebsiellapneumoniae)的16S rRNA基因的核苷酸序列同源,同源性分别为96%,99%,99%,97%,98%,98%,99%,98%,98%.9株菌株的系统进化树明显分为3支,Ⅰ和Ⅳ聚为一支,Ⅶ独聚一支,Ⅱ、Ⅲ、Ⅴ、Ⅵ、Ⅷ、Ⅸ聚为一支,其中Ⅱ和Ⅷ相聚,Ⅲ和Ⅴ相聚后再与Ⅵ相聚,最后与Ⅸ相聚.
- 李顺王庆容
- 关键词：丁鱥细菌分子鉴定
- 猪4个候选印记基因的分离、定位、印记状况和组织表达分析
- 基因组印记是指子代中来自父母双方的等位基因的差异表达,即有些基因只有父源的等位基因有表达活性,而母源等位基因则处于沉默状态；反之,有的基因只表达母源等位基因,而父源等位基因保持沉默,具有这种现象的基因称为印记基因。研究表...
- 李顺
- 关键词：印记基因基因定位组织表达谱
- 文献传递
- 猪COPG2和MEST克隆、印记状况和组织表达分析被引量：1
- 2010年
- 【目的】为了在猪中找到更多新的候选印记基因并分析它们在哺乳动物之间的保守性,以期为猪分子遗传育种提供基础分子生物学信息和分子标记。【方法】以长白与荣昌猪杂交F1代一月龄个体为研究对象,通过比较生物学的方法,克隆COPG2和MEST全长cDNA,并分析基因的序列特点,然后利用IMpRH(法国农业科学院的辐射杂种克隆板)分析COPG2和MEST在猪染色体上定位信息。通过RT-PCR产物直接测序方法分析了这些基因在一月龄F1代个体11个不同组织(心、胃、肌肉、肾脏、肺、肝、小肠、膀胱、舌头、脾和脂肪)的印记状况,并进一步利用Real-timePCR方法,分析其在一月龄F1代个体11个不同组织的表达情况。【结果】克隆得到2817bp COPG2和2219bp MEST序列。其中COPG2包括2616bp完整CDS(coding sequenc,编码序列)区域,分析表明其编码含871个氨基酸的蛋白质,MEST包括981bp完整CDS区域,编码326个氨基酸的蛋白质。IMpRH分析结果表明,猪COPG2和MEST都位于猪18号染色体上并且与标记CL365941紧密连锁,LOD值分别为14.32和8.5。印记分析表明COPG2在11个组织中呈双等位表达,MEST在心脏、胃、肌肉、肾、肺、膀胱、舌头和脂肪中表达父方等位基因,但在肝脏、小肠和脾脏中呈双等位表达。荧光定量结果显示COPG2和MEST总的表达量在一月龄个体各组织间存在着显著性差异(P<0.01),其中COPG2和MEST在肾脏中表达量均高于其它各组织(P<0.01)。【结论】在哺乳动物之间,COPG2序列较为保守但是印记状况却缺乏保守性;MEST序列和印记状况均较为保守,但MEST在猪中印记状况具有组织特异性。此外,染色体定位信息和印记状况证实了在猪的18号染色体上有由COPG2和MEST构成的新的印记域。
- 李顺蒋曹德石萍董然然魏晋田家伟
- 关键词：克隆染色体定位
- 猪IFIT1基因的克隆、生物信息学和组织表达分析被引量：5
- 2011年
- 采用cDNA末端快速扩增(RACE)方法,对荣昌猪IFIT1基因进行克隆测序,利用生物信息学方法分析其结够和功能,并用Real-ti me PCR方法分析初生个体和1月龄个体11个不同组织(肺、心、肾、舌头、膀胱、卵巢、脾、肝、肌肉、胃和小肠)的表达情况.结果表明:IFIT1基因cDNA序列为1971 bp(GenBank登录号:HQ679904),包含5 UTR48 bp,全部CDS序列1437 bp和3 UTR487 bp,编码478个氨基酸,相对分子质量为55 232.9×103,等电点为6.18.其二级结构以α-螺旋和无归卷曲为主,三级结构具有典型的三角四肽和螺旋转角螺旋重复结构.荧光定量结果显示IFIT1表达量在初生个体和1月龄个体各组织间均存在着显著性差异(p<0.01),初生个体在脾脏中的表达量高于其它各组织(p<0.01),1月龄个体在肌肉中的表达量高于其它组织(p<0.01).
- 董然然李顺蒋曹德
- 关键词：IFIT1基因克隆生物信息学
- 动物肾上腺皮质发育异常基因的生物信息学分析
- 本文采用生物信息学方法和工具对GenBank中的猪、牛、家犬、小家鼠、人、白猴的肾上腺皮质发育异常基因的核酸和氨基酸序列进行了比对、分析和建模，进而对其分子结构、理化性质、亚细胞定位、蛋白质转肽、跨膜结构、疏水型、分子系...
- 李顺蒋曹德
- 关键词：生物信息学核酸序列氨基酸序列
- 文献传递
- 2种改进的未知细菌DNA提取方法被引量：11
- 2009年
- [目的]研究细菌DNA的提取方法，为未知细菌的研究提供方法支持。[方法]从DNA的纯度、基因组DNA的酶切效果、16SrRNA基因扩增等方面比较了细菌DNA的2种提取方法。[结果]方法Ⅰ提取的DNA的纯度（OD260／OD280）为1．51-1．65，6个样品的平均值为1．56。方法Ⅱ提取的DNA的纯度（0D260／OD280）为1．25～1．41，6个样品的平均值为1．33。方法隈取的DNA纯度较高，但其试验步骤稍微繁琐。方法Ⅱ的试验步骤稍微简单，但试验时间较长。2种方法均提取到长度大于21kb）的细菌基因组DNA。对2种方法提取的DNA进行PCR扩增都得到长度约600bp的条带，效果较好。[结论]2种方法提取的DNA质量均较高，都可以直接用于RFLP、PCR等研究。
- 王庆容李顺宋培勇杨秀荣
- 关键词：细菌DNA提取聚合酶链反应
- 防治嗜水气单胞菌鱼病的中草药配方
- 一种防治嗜水气单胞菌鱼病的中草药配方，它的配方组成：黄连90-150克、大黄90-150克、黄芩90-120克、板蓝根80-110克、连翘80-110克、紫苏80-110克、石菖蒲80-100克、五倍子80-100、生姜...
- 王庆容宋培勇曾燕玲杨秀荣徐晓舒魏福伦李顺罗霞
- 文献传递
- 斑点叉尾鮰可疑病原细菌的分离鉴定及系统发育分析
- 2010年
- 用传统的微生物学分离培养方法,从斑点叉尾鮰(Ictalurus punctatus)的鳃、肠和肝等器官共分离到16株可疑病原细菌(编号为WJ01～16),以提取的基因组DNA为模版,扩增出约600bp大小的16SrDNA片段,测序并与GenBank数据库中的已知序列进行比对。16株细菌中,9株同源性在98%以上,5株在95%以上,2株为92%。系统发育分析表明,16株细菌明显地聚为3支。
- 宋培勇王庆容李顺杨秀荣
- 关键词：斑点叉尾鮰病原细菌RDNA系统发育分析
