刘思情
- 作品数：6 被引量：22H指数：2
- 供职机构：中国科学院水生生物研究所更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金美国国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学农业科学更多>>
- 鳅超科鱼类若干基因的进化及分子系统发育分析
- 鳅超科(Cobitoidea)是鲤形目（Cypriniformes）鱼类中重要的类群之一，种类多，形态差异大，分布广泛。本研究以鳅超科鱼类为研究对象，对线粒体基因COI、ND4、ND5和核基因RH1、RAG1、EGR2B...
- 刘思情
- 鳅超科鱼类ND4和ND5基因序列分析及其系统发育意义
- ＜正＞ND4和ND5是线粒体基因组中编码NADH脱氢酶亚基4和亚基5的两个蛋白质编码基因。本研究以鳅超科鱼类为研究对象,新测定了7个物种的ND4和ND5基因全序列,结合从GenBank下载的15个物种的15条序列进行分析...
- 刘思情唐琼英张家波刘焕章
- 文献传递
- 基于ND4和ND5基因序列分析的鳅超科鱼类系统发育关系被引量：12
- 2010年
- ND4和ND5是线粒体基因组中编码NADH脱氢酶亚基4和亚基5的两个蛋白质编码基因。该研究以鳅超科鱼类为研究对象,新测定了10个物种的ND4和ND5基因全序列以及中间的3个tRNA基因共212bp的序列,结合从GenBank下载的15个物种的15条序列进行序列比较和系统发育关系分析。结果显示:鳅超科鱼类ND4基因全长1380～1387bp,以ATG为起始密码子,终止密码子为不完全终止信号;ND5基因全长1821～1839bp,同样起始密码子为ATG,终止密码子为TAA或TAG;ND4和ND5基因之间插入了3个tRNA基因,分别编码携带组氨酸、丝氨酸、亮氨酸的tRNA。ND4和ND5基因(包含3个tRNA基因)中A、T、G、C的平均含量分别为30.4%、27.3%、14.2%、28.1%,A+T(57.7%)的含量高于G+C(42.3%)的含量。转换与颠换比(Ti/Tv)平均值为1.586。选取斑马鱼和鲤鱼作为外类群,采用最大简约法(MP)、最大似然法(ML)和贝叶斯推断法(BI)进行系统发育树的重建。三种方法的系统发育分析结果都显示:花鳅亚科、条鳅亚科、沙鳅亚科、平鳍鳅科及Vaillantellidae分别构成单系;它们的系统发育关系为:(Vaillantellidae+(沙鳅亚科+(花鳅亚科+(条鳅亚科+平鳍鳅科)。这与线粒体全基因组和某些核基因(如RAG1基因)的研究结果类似,且支持率较高,表明ND4和ND5基因用于鳅超科鱼类的系统发育分析是可行的;但是该研究的结果有别于其他线粒体基因的分析结果,如基于cytb和D-loop基因进行的系统发育分析表明,条鳅亚科和花鳅亚科聚为姐妹群,再和平鳍鳅科聚在一起。这种差异可能是由于使用的基因长度差异造成的,长度越长,信息量越大,所反映的系统发育结果可能更加接近真实情况。
- 刘思情张家波唐琼英刘焕章
- 关键词：系统发育
- 基于线粒体细胞色素b基因的黑鳍鳈(Sarcocheilichthys nigripinnis)生物地理学过程分析被引量：10
- 2013年
- 黑鳍鲸（Sarcocheilichthys nigripinnis）为广泛分布于东亚地区的小型淡水鱼类，是生物地理学研究的良好材料。该研究以线粒体细胞色素b（Cytb）基因序列为分子标记，对中国8个水系20个采样点的黑鳍鲸共142尾个体进行遗传变异及生物地理学过程分析。遗传多样性分析结果表明，142条Cytb基因序列共检测出56个单倍型，总体单倍型多样性较高（h=0．971），而核苷酸多样性较低（a=0．0212），平均遗传距离较小（2．2％）。分子系统发育树结果表明，黑鳍鲸种群分为7个谱系，以秦岭为界可分为南、北两大支系，北方支系分化时间较早（谱系I）而南方支系分化程度较高（谱系II～VII）。该研究结果进一步揭示了克氏鲸（sczerskii）的物种形成过程，估算其祖先在较晚近时期（～1．03Ma）由黄河水系的黑鳍鲸分化而来。谱系生物地理学分析显示，黑鳍鲸的各地理种群表现为由北向南逐渐演化的趋势，地理隔离可能是限制该物种扩散和基因交流的主要原因。分子钟分析显示，分化时间发生于0．95～3．92Ma。种群历史动态结果则推测黑鳍鲸经历过种群扩张，且该过程可能与更新世冰期与间冰期的更迭相关。
- 刘思情唐琼英李小娟刘焕章
- 关键词：细胞色素B基因地理隔离
- 条纹小鳃种群遗传分析及其亲缘地理学格局
- 为了研究海峡两岸淡水鱼类的种群遗传变异及其亲缘地理格局,我们采集了条纹小鲃(Puntius semifasciolatus)在闽江水系、珠江水系及台湾南部水系等9个水系的14个地理种群共计151个样本,利用线粒体细胞色素...
- 刘思情刘焕章
- 关键词：细胞色素B基因亲缘地理学
- 文献传递
- 条纹小鲃种群遗传分析及其亲缘地理学格局
- 为了研究海峡两岸淡水鱼类的种群遗传变异及其亲缘地理格局，采集了条纹小鲃在9个水系的14个地理种群共计151个样本，利用线粒体细胞色素b基因(cytb)全序列作为分子标记，分析了条纹小鲃种群的遗传多样性、遗传结构、分化时间...
- 刘思情刘焕章
- 关键词：细胞色素B基因亲缘地理学种群分化
- 文献传递
