马裴裴
- 作品数：9 被引量：109H指数：5
- 供职机构：中国农业大学动物科技学院更多>>
- 发文基金：国家高技术研究发展计划转基因生物新品种培育专项国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 母猪繁殖力性状影响因素分析及遗传参数估计被引量：49
- 2012年
- 母猪繁殖力是影响种猪场经济效益的重要因素。文章对纯种大白猪、长白猪、杜洛克猪的8491窝产仔记录进行统计分析,建立固定效应模型对总产仔数、健仔数、初生窝重、弱仔数、死胎数、木乃伊胎数和畸形胎数共7个繁殖性状进行最小二乘分析,分析胎次、配种季节、品种对母猪繁殖性能的影响,同时比较了纯繁和杂交的效果。利用动物模型REML(约束最大似然)方法估计繁殖性状的遗传力和遗传相关。结果表明,胎次、配种季节和品种对总产仔数、健仔数、初生窝重影响极显著(P<0.001),胎次和品种对弱仔数影响极显著(P<0.001),但配种季节对弱仔数影响不显著。胎次对死胎数影响显著(P<0.05),而配种季节和品种对死胎数影响不显著,胎次、配种季节和品种对木乃伊胎、畸形胎数影响不显著。长白♂×大白♀交配组合具有最高的总产仔数、健仔数和初生窝重。繁殖性状遗传力估计结果显示,长白猪初生窝重的遗传力最高,为0.227。其余性状遗传力均在0.2以下,为低遗传力性状。3个品种母猪的健仔数与初生窝重、总产仔数与健仔数之间的遗传相关达0.96以上。研究结果为降低非传染性因素造成的种母猪产仔数低的问题以及种猪场对母猪繁殖力的选育提高提供了参考数据和理论依据。
- 沈君叶俞英王茜马裴裴朱士恩史文清王雅春张勤
- 关键词：母猪繁殖性状影响因素
- 奶牛产奶性状与乳房炎相关基因CpG含量及分布特征的比较分析被引量：8
- 2012年
- DNA甲基化是表观遗传学的重要组成部分,基因启动子区及第一外显子区的CpG甲基化通常抑制该基因的表达,而去甲基化则促进基因表达。已有的研究发现荷斯坦牛的乳房炎指标SCC(Somatic cell count)与产奶量呈较强负相关。文章分析并比较了这两类性状的相关基因的启动子区、第一外显子、下游2 000 bp序列中CpG含量及分布特征。结果表明,乳房炎相关基因的启动子、第一外显子中CpG含量显著低于产奶性状相关基因,而两类性状基因下游2 000 bp序列中CpG含量无显著性差异。另外,文中提出了两个量化基因序列中CpG特征的指标,一个是CpG平均距离,用来衡量序列中的CpG分布;另一个是条件概率p(G|C),用以量化序列中二核苷酸CpG随碱基C出现的可能性,并对两类基因的启动子和第一外显子区域的这两个指标做了统计检验。研究结果对产奶性状与乳房炎相关基因的DNA甲基化调控研究奠定了基础。
- 解小莉俞英袁志发杨洁马裴裴李迪超尉守科安峰封晓静张沅
- 关键词：DNA甲基化
- 使用联合参照群体提高中国荷斯坦牛缺失基因型填充和全基因组预测准确性
- 马裴裴丁向东Lund S. Mogens张勤苏国生
- 关键词：中国荷斯坦牛
- 中国荷斯坦牛乳房炎易感性及抗性的全基因组关联分析被引量：12
- 2013年
- 本研究首先通过SAS 9.1分析2 093头北京地区中国荷斯坦牛体细胞数(SCC)的变化规律,依据SCC将牛只划分为乳房炎易感牛(Case)及抗性牛(Control);再基于Case-control设计进行全基因组关联分析。通过染色体水平的Bonferroni校正,共检测到6个SNPs与乳房炎易感性及抗性显著相关。其中19号染色体检测出的显著SNP(ARS-BFGL-NGS-78516,P=5.200 65e-05)在其200kb范围内共有3个基因(PRKRIP1、ARHGAP23和TBX21)与炎症反应密切相关。研究结果为奶牛乳房炎易感性及抗性的分子遗传基础研究提供了数据。
- 王晓解小莉王胜钱梦樱马裴裴张沅孙东晓刘剑锋丁向东姜力王雅春张毅张胜利张勤俞英
- 关键词：中国荷斯坦牛易感性SCC全基因组关联分析
- 中国荷斯坦牛SCC变化规律及其与产奶性状之间的关系被引量：37
- 2010年
- 本研究旨在分析北京地区中国荷斯坦牛测定日体细胞数的变化规律及其与产奶性状之间的关系,推断适于中国荷斯坦牛隐性乳房炎的判定标准。通过对北京地区76个荷斯坦牛牛场63510头母牛的DHI数据进行整理筛选,按每毫升奶中体细胞数(SCC)情况,用SAS8.2将其划分为12个子数据集及8个累积数据集。首先用Excel对12个子数据集的SCC和产奶性状作图,然后用Matlab的Spline函数对12个子数据集及8个累积数据集做泌乳期的SCC曲线。除乳脂率外,12个子数据集的SCC均值与各产奶性状均值的变化趋势相关显著,随着SCC的增长,产奶量、乳蛋白量和乳脂量逐渐下降,乳蛋白率逐渐上升(P<0.001)。累计数据集作图发现,SCC<20万与SCC<10万的差异较大,而SCC<50万与SCC<40万差异较小。结果表明,为有效降低隐性乳房炎发病率,北京地区中国荷斯坦牛牛群宜以10万～50万SCC作为隐性乳房炎划分标准。
- 马裴裴俞英张沅张勤王雅春孙东晓张毅
- 关键词：体细胞数产奶性状隐性乳房炎
- 利用全基因组连锁不平衡估计中国荷斯坦牛有效群体大小被引量：6
- 2012年
- 有效群体大小是群体遗传学研究的一个重要内容,有助于我们更清楚地了解群体的遗传变异、进化和复杂性状的遗传机制等。随着高密度SNP标记的出现,越来越多的研究利用SNP标记间连锁不平衡估计有效群体大小。文章采集北京地区中国荷斯坦牛2 093个样本,并利用牛SNP芯片(Illumina BovineSNP50,含5 4001 SNPs)进行基因型测定,估计不同世代中国荷斯坦牛的有效群体大小。质量控制标准设定为SNP检出率0.95,最小等位基因频率>0.05,样本检出率0.95,哈代温伯格平衡检验显著性水平P<0.0001。经过质量控制,共1 968个样本和38 796个SNPs用于连锁不平衡分析。文章选取SNP间距0.1、0.2、0.5、1、2、5、10、15(Mb),估计中国荷斯坦牛在4世代之前有效群体大小。结果表明,中国荷斯坦牛的有效群体呈逐代下降趋势,至4世代前,中国荷斯坦牛平均有效群体为45头左右。
- 尼桂琰张哲姜力马裴裴张勤丁向东
- 关键词：中国荷斯坦牛
- SCC与乳房炎及产奶性状关系的研究进展
- DHI(Dairy Herd Improvement)是牛场管理和育种工作的基础,测定内容主要包括产奶量、乳脂率、乳蛋白率、体细胞数等。奶牛饲养管理人员可以根据DHI报告全面了解牛群的饲养管理状况。DHI报告是对牛场饲养...
- 马裴裴何阳花俞英
- 文献传递
- 中国荷斯坦牛炎症相关基因与体细胞评分的关联分析
- 奶牛乳房炎是引起现代奶业经济损失的一大原因。由于导致乳房炎的原因较复杂，目前对抗乳房炎的选育取得的进展缓慢。体细胞评分(SCS)是乳房炎育种的常用指标。随着全基因组SNP芯片的广泛使用，对SCS进行全基因组关联分析逐渐成...
- 马裴裴俞英刘剑锋杨沽张勤丁向东孙东晓张沅
- 关键词：中国荷斯坦牛体细胞
- 利用全基因组连锁不平衡估计中国荷斯坦牛有效群体大小
- 有效群体大小是群体遗传学研究的一个重要内容，有助于更清楚地了解群体的遗传变异、进化和复杂性状的遗传机制等。随着高密度SNP标记的出现，越来越多研究利用sNP标记间的连锁不平衡估计有效群体。
- 尼桂琰张哲姜力马裴裴张勤丁向东
- 关键词：中国荷斯坦牛
