艾观华
- 作品数:7 被引量:11H指数:3
- 供职机构:中国药科大学更多>>
- 相关领域:生物学更多>>
- 与整合素αvβ3受体具有高亲和力的多肽
- 本发明属于生物工程制药、蛋白质多肽类药物及生物医学工程领域,涉及对整合素受体αvβ3具有高亲和力的多肽及其应用,多肽序列为:Arg-Trp-Arg或Arg-Lys-Tyr。本发明的多肽比传统的RGD肽对于整合素αvβ3具...
- 顾月清艾观华董雪牛淼淼
- 文献传递
- 采用基于结构的药效团模型和分子对接方法用于发现新的表皮生长因子受体抑制剂被引量:3
- 2014年
- 表皮生长因子受体与其配体结合后可以诱导细胞的分化与增殖。该受体位于细胞表面,与配体结合后能够活化该受体细胞内的酪氨酸激酶。酪氨酸激酶能够使许多细胞内的底物磷酸化后引起细胞增殖、DNA合成和fos及jun癌基因的表达,所以表皮生长因子受体是肿瘤治疗的潜在靶标。一些表皮生长因子受体抑制剂作为潜在的药物用于肿瘤的治疗。然而,一些上市的药物表现出某些副作用,因而限制了其使用。为了发现改进疗效的新的表皮生长抑制剂,基于表皮生长因子晶体复合物采用DS软件中的受体-配体药效团产生模块,一个高相关性的药效团模型被构建。该药效团模型包括3个氢键受体和1个疏水特征。然后,基于药效团和对接虚拟筛选用于筛选商业数据库,用于获得新的表皮生长抑制剂。最后,具有高对接打分的两个化合物被挑选出来作为新的候选抑制剂。该研究结果的报道,提供了一种基于一组蛋白-配体复合物的晶体结构来产生药效团去用于虚拟筛选的方法,这个研究也认为该方法对于合理的理解结构和理化特性提供了重要的信息。
- 艾观华顾月清
- 关键词:表皮生长因子药效团抑制剂分子对接
- 基于蛋白质序列预测蛋白质-蛋白质相互作用位点研究进展被引量:4
- 2011年
- 生物分子之间的相互作用是生命过程的分子基础,其中蛋白质分子之间的相互作用占有极其重要的地位。因此研究蛋白质相互作用对于理解生命的分子机理、探讨致病微生物的致病机理,以及研究新药提高人们的健康水平具有重要的作用。文章对蛋白质-蛋白质相互作用数据库和蛋白质-蛋白质相互作用位点的序列特征和蛋白质-蛋白质结合位点预测最先进的方法进行介绍。蛋白质-蛋白质相互作用位点的残基在调节物理结合过程中具有重要的意义,例如这些残基参与酶抑制剂相互作用的抑制效应,通过抗体-抗原相互作用的最初免疫反应,和细胞中信号蛋白的调节等。当前,各种各样的方法被用于预测蛋白质-蛋白质相互作用位点的预测中,并通过整体的构建蛋白质-蛋白质作用网络,从残基水平去理解蛋白质结合现象。
- 艾观华周建红方慧生
- 关键词:蛋白质相互作用
- 蛋白质结构从头预测方法研究进展被引量:4
- 2011年
- 蛋白质结构从头预测是不依赖模板仅从氨基酸序列信息得到天然结构。它的关键是正确定义能量函数、精确选用计算机搜索算法来寻找能量最低值。基于此,本文系统介绍了能量函数和构象搜索策略,并列举了几种比较成功的从头预测方法,通过比较得出结论:基于统计学知识的能量函数是近年来从头预测发展的主要方向,现有从头预测的构象搜索都用到Monte Carlo法。这表明随着蛋白质结构预测研究的深入,能量函数的构建、构象搜索方法的选择、大分子蛋白质结构的从头预测等关键性问题都取得了突破性进展。
- 周建红艾观华方慧生陈凯先
- 关键词:能量函数ROSETTA
- 与整合素αvβ3受体具有高亲和力的多肽
- 本发明属于生物工程制药、蛋白质多肽类药物及生物医学工程领域,涉及对整合素受体αvβ3具有高亲和力的多肽及其应用,多肽序列为:Arg-Trp-Arg或Arg-Lys-Tyr。本发明的多肽比传统的RGD肽对于整合素αvβ3具...
- 顾月清艾观华董雪牛淼淼
- 文献传递
- RNAProbeDesigner:mRNA探针特异性序列搜索方法
- 2012年
- mRNA不仅是生物体内蛋白质合成的"图纸",还参与生命活动的很多调节过程。随着分子影像技术的发展,mRNA探针在医药领域的应用越来越广泛。探针的特异性是衡量探针效果的重要指标。本文基于BLAST的序列搜索方法,根据目标mRNA中的每个片段与细胞中其他RNA的相似程度,筛选可用于特异性识别mRNA的寡核苷酸片段,并将该方法编写为一套自动化的mRNA探针特异性序列的搜索程序——RNAProbeDesigner。选取4种蛋白的mRNA对该程序进行测试,结果显示,该程序搜索出的片段中,有部分结果在以往的文献中已被报道用于相应探针的设计,从而证明了该方法的可靠性。
- 刘子朋艾观华李向真徐晓燕张莹李娟方慧生
- 关键词:BLAST探针设计
- 采用SVM评估蛋白质-蛋白质相互作用的成药性
- 艾观华
- 关键词:蛋白质-蛋白质相互作用支持向量机