孙凯
- 作品数:8 被引量:4H指数:1
- 供职机构:西南民族大学生命科学与技术学院更多>>
- 发文基金:四川省科技攻关计划四川省应用基础研究计划项目更多>>
- 相关领域:农业科学生物学更多>>
- 牦牛病毒性腹泻病毒全基因测序及生物信息学分析被引量:1
- 2013年
- 从牦牛(Yak)体内分离出牛病毒性腹泻/黏膜病病毒(BVDV/MDV),参考GenBank中已收录的BVDV-Ⅰ型的全基因组序列,设计了19对引物,通过RT-PCR方法,对牛病毒性腹泻病毒牦牛株进行克隆及测序,得到其全基因组序列(Gen-Bank登录号:JQ799141),序列全长12214nt,其中5′-UTR长288nt,3′-UTR长232nt。将牦牛株BVDV全基因序列与Gen-Bank中登录的其他8株BVDV病毒全基因序列进行同源性比对及系统进化分析,结果表明,牦牛株BVDV与BVDV-Ⅰ型毒株出于同一分支,但与其他8株BVDV毒株全基因序列同源性均不高,有可能属于新的独立基因型或基因亚型,仍需进一步研究证实。
- 王研刘亚刚王荣孙凯
- 关键词:全基因序列分析生物信息学分析
- 奶牛注射猪瘟苗后对其产奶量的影响研究
- 2010年
- 随机抽取正产奶的黑白花奶牛4头,测得其连续3天的头平日产量为14.625kg,然后每头颈部皮下注射10头份的猪瘟组织苗,连续测得其头平日产奶量为14.7kg.为进一步验证结论,在华宁公司牛场进一步扩大了数量,延长了时间,选择30头怀孕母牛(直检),随机分为试验组和对照组,每组15头,试验组每头颈部皮下注射10头份猪瘟苗,对照组不注射.两组在相同的饲养条件下,全程实行机械化挤奶,测定时间为一个产奶周期(305天).计数登记后进行统计处理.结果显示注苗组头平产奶量为5956公斤,比对照组的头平5766公斤高出190公斤,提高3.29%.表明给奶牛注射猪瘟苗后不仅不影响产奶量,而且有所提高.
- 刘亚刚马蓉余琼任永刚蒋朝龙杨晓农李健刘斌王盼盼孙凯
- 关键词:奶牛
- 牦牛病毒性腹泻病毒E1基因的原核表达
- 2010年
- 以牦牛BVDV基因组DNA为模板,运用聚合酶链反应成功扩增出牦牛BVDV E1基因,将其插入到pET-28a及pET-32a原核表达载体,构建重组表达质粒pET-28a-E1和pET-32a-E1并分别转化至Rosetta(DE3)和BL21(DE3)宿主菌中,IPTG诱导表达,经SDS-PAGE检测,pET-28a-E1和pET-32a-E1在宿主菌Rosetta(DE3)和BL21(DE3)中均表达出约40KU的融合蛋白,结果分析表明E1基因在两个宿主中都获得了高效表达,表达出的蛋白大小与预期结果相符.
- 王盼盼刘亚刚孙凯王文伯胡炳峰于吉锋冯英阳
- 关键词:牦牛牛病毒性腹泻病毒E1基因原核表达
- 鸭浆膜炎的诊治及提升产蛋的有效措施被引量:1
- 2011年
- 彭州某私人鸭场饲养的2800多只樱桃谷鸭,因患传染性浆膜炎,加之断料、换料的应激和管理不善,致使产蛋率由85%下降至50.2%,并且蛋的品质大幅降低,经诊断治疗并采取相应补救措施后,疾病很快得到了控制,蛋的品质和产蛋率大幅提升,特此报道以供借鉴.
- 刘亚刚马蓉孙凯任永刚王研王盼盼
- 关键词:传染性浆膜炎
- 牦牛病毒性腹泻病毒E2基因的克隆鉴定及原核表达被引量:1
- 2011年
- 运用聚合酶链式反应,以牦牛BVDV基因组DNA为模板扩增出牦牛BVDVE2基因。为研究E2蛋白的抗原性,将E2基因插入到pET-32a原核表达载体,构建重组表达质粒pET-32a-E2,并转化至BL21(DE3)宿主菌中,利用IPTG诱导表达。经SDS-PAGE检测,pET-32a-E2在宿主菌BL21(DE3)中表达出约58kD的融合蛋白,结果表明E2基因在BL21(DE3)宿主菌获得了高效表达,表达蛋白大小与预期相符。Western-blotting结果显示E2蛋白具有良好抗原性。这对以后研究E2蛋白功能等具有十分重要的意义。
- 孙凯刘亚刚王妍王盼盼胡炳峰王文伯
- 关键词:牦牛E2基因牛病毒性腹泻病毒原核表达
- 牦牛病毒性腹泻/粘膜病病毒全基因的测序、表达与生物信息学分析
- 牛病毒性腹泻/粘膜病(Bovine Viral Diarrhea/Mucosal Disease, BVD/MD)是一种全球性病毒性传染病,可感染牛、羊、兔、鹿等多种动物,对养牛业的危害最为严重。1983年,王清江等首次...
- 孙凯
- 关键词:全基因序列分析生物信息学分析
- 文献传递
- 牦牛病毒性黏膜病病毒P125基因的克隆及序列分析
- 2012年
- 试验参考GenBank中发表的牛病毒性腹泻病毒(bovine viral diarrhea virus,BVDV)毒株基因组序列设计了5对引物,利用PCR扩增出预期的3475 bp目的片段;将扩增产物连接至pMD19-T载体,经质粒PCR鉴定及双酶切鉴定获得阳性重组质粒并进行核苷酸序列测定。经BLAST同源性分析表明,牦牛BVDV P125基因与BVDV-Ⅰ型的NADL毒株P125基因的同源性为63.4%。系统分析结果表明,牦牛P125基因与BVDV标准毒株P125基因在遗传进化与亲缘关系上均较远,这可能是因为环境诱变的结果或该毒株具有新的遗传衍化来源。
- 刘亚刚孙凯王研王盼盼胡炳峰王文伯
- 关键词:牦牛牛病毒性腹泻病毒克隆测序生物信息学分析
- 牦牛病毒性黏膜病病毒结构蛋白核苷酸的序列测定与分析
- 2012年
- 对首次从牦牛体内分离出的BVDV进行结构蛋白的研究与分析具有重要的理论价值和学术意义,本研究参考GenBank中发表的BVDV毒株的基因组序列设计四对对引物,利用PCR扩增出预期的2700bp目的片段.扩增产物克隆至pMD19-T Vector,经质粒PCR鉴定及酶切鉴定获得阳性重组质粒并对其进行测序.测序结果经DNNMAN同源性比较分析,克隆得到的结构蛋白基因与NADL株同源性最高,但核苷酸同源性仅为70.1%,推导氨基酸同源性仅为74.4%,证明牦牛株BVDV结构蛋白基因存在较大的变异.生物信息学分析表明结构序列中有片段高度疏水,蛋白基因推导氨基酸序列亲水性与抗原性成平行相关,亲水性和抗原性与标准毒株很相似.
- 刘亚刚孙凯王妍王盼盼王荣胡炳峰王文伯
- 关键词:克隆测序生物信息学分析