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郑晶晶
作品数:
3
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供职机构:
中国科学院软件研究所
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发文基金:
国家自然科学基金
国家高技术研究发展计划
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相关领域:
自动化与计算机技术
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合作作者
张鹏
中国科学院软件研究所
王婷
广州中国科学院软件应用技术研究...
张云泉
中国科学院计算技术研究所
詹科
中国科学院软件研究所
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张鹏
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2016
1篇
2015
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一种DNA读序数据FASTQ文件并行压缩和解压缩方法
一种DNA读序数据FASTQ文件并行压缩和并行解压缩方法,针对DNA读序数据FASTQ文件的压缩与解压缩,利用循环双缓冲队列、循环双内存映射和内存映射并结合数据分块处理、多线程流水并行压缩解压缩处理、读写顺序二维数组等技...
郑晶晶
王婷
张常有
詹科
文献传递
基于Pthreads的并行DSRC压缩算法设计与实现
2015年
高通量测序仪产生大量的DNA数据,FASTQ是被广泛使用的存储DNA数据的数据格式。对FASTQ格式的数据进行压缩处理,能有效地节省存储空间。DSRC算法具有压缩比高的优点,因此对DSRC算法进行并行能提高压缩FASTQ格式的DNA数据的效率。基于Pthreads,实现了并行DSRC算法。测试结果表明,当使用4线程时加速比达到3.5。
詹科
张云泉
王婷
郑晶晶
张鹏
关键词:
数据压缩
DSRC
一种DNA读序数据FASTQ文件并行压缩和解压缩方法
一种DNA读序数据FASTQ文件并行压缩和并行解压缩方法,针对DNA读序数据FASTQ文件的压缩与解压缩,利用循环双缓冲队列、循环双内存映射和内存映射并结合数据分块处理、多线程流水并行压缩解压缩处理、读写顺序二维数组等技...
郑晶晶
王婷
张常有
詹科
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