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牦牛瘤胃元基因组文库中木聚糖酶基因的分析被引量：6: 2011年; 【目的】了解牦牛瘤胃微生物木聚糖酶多样性及其降解特征,为木聚糖降解提供新的基因资源。【方法】根据对已构建的瘤胃微生物元基因组细菌人工染色体(BAC)克隆文库高通量测序结果的注释,筛选其中编码木聚糖酶的基因并进行多样性分析;对其中一个木聚糖酶基因及其连锁的木糖苷酶基因进行克隆表达和酶学性质表征,分析其协同作用。【结果】共筛选到14个木聚糖酶基因,均编码GH10家族木聚糖酶,其氨基酸序列之间的相似性为20.5%-91.3%;其中7个木聚糖酶基因所在的不同的DNA片段(contig)上存在木糖苷酶基因,编码的木糖苷酶属于GH43或GH3糖苷水解酶家族。将其中一对连锁的木聚糖酶(Xyn32)和木糖苷酶基因(Xyl33)分别克隆、表达和纯化。纯化后的木聚糖酶比活为1.98 IU/mg,但不具有阿魏酸酯酶活性;木糖苷酶比活为0.07 U/mg,且具有α-阿拉伯呋喃糖苷酶活性。体外实验证明,木糖苷酶Xyl33对与之连锁的木聚糖酶Xyn32的木聚糖降解具有协同作用。; 王敏陈富荣张山朱雅新东秀珠黄力田瑞华董志扬戴欣; 关键词：牦牛瘤胃细菌人工染色体(BAC)文库木聚糖酶

双向凝胶电泳分析感染禽脑脊髓炎病毒鸡脑组织蛋白表达图谱被引量：2: 2008年; 本研究采用双向凝胶电泳分离接毒组(感染AEV)和对照组(不接毒)的鸡脑组织全蛋白,经过银染后,用Image ScannerⅡ光密度扫描仪获取凝胶图像,并用Image Master 2D Platinum软件进行差异蛋白分析。对蛋白斑点编辑后,接毒组中检测到793个蛋白点,对照组中检测到827个蛋白点,两张图谱的匹配蛋白点数为614个,凝胶匹配率为75.8%。差异蛋白分析后,发现在接毒组中有16个蛋白点表达量显著下调,这些蛋白质成份可能与组织细胞病变有关,它们将为认识禽脑脊髓炎的发病机理提供线索。; 孟佩俊刘丽华张丽萍王嘉慧陈富荣何翠赵娜; 关键词：蛋白质组双向凝胶电泳禽脑脊髓炎

瘤胃木质纤维素降解菌及降解酶基因的研究进展被引量：9: 2010年; 反刍动物瘤胃是公认的木质纤维素高效降解的天然反应器,对瘤胃微生物的研究已成为开发生物能源的热点领域之一。目前的研究手段已经从传统的依赖分离培养从瘤胃中获得木质纤维素降解菌,并对降解菌中的木质纤维素降解酶逐一分析,发展到通过基因组/元基因组学技术,直接从瘤胃中发现并获得大量新的木质纤维素降解酶基因/基因簇,进而探讨其降解的分子机理。已有的研究结果表明,瘤胃微生物降解木质纤维素的过程非常复杂,涉及大量不同种类的微生物及基因/基因簇,随着新分析技术的建立和完善,对这些微生物和基因的研究已取得了诸多进展。本论文综述了近期有关该方向的研究进展。; 陈富荣朱雅新东秀珠刘丽华黄力戴欣; 关键词：瘤胃

禽脑脊髓炎病毒与其他小RNA病毒基因组序列比较分析: 2008年; 利用生物信息学方法对在基因文库中有完整注释信息的禽脑脊髓炎病毒(AEV)和其他小RNA病毒进行了基因组结构比较,发现小RNA病毒基因组结构的共性和个性;利用DNAMAN 5.0软件对小RNA病毒进行了基因组和蛋白多序列比对,并建立了蛋白质系统进化树。结果表明,AEV与甲肝病毒(HAV)的基因组结构最为相似;它们的基因组序列和蛋白序列的同源性最大,蛋白系统进化树的构建更进一步证明AEV与HAV的亲源关系最近;另外,经多序列比对发现猪肠道病毒A、鸭小RNA病毒TW90A型与猿猴小RNA病毒1型三者之间具有最大的序列同源性,并处于同一个进化树分枝,因此,建议将它们划分为一个新的小RNA病毒属,同时也为其他小RNA病毒科属种的划分提供了参考。; 刘丽华孟佩俊王嘉慧陈富荣赵娜何翠; 关键词：小RNA病毒禽脑脊髓炎病毒基因组

禽脑脊髓炎病毒VP1、VP3、VP0基因表达载体的构建被引量：2: 2009年; 根据AEV-NH937基因组全序列设计3对引物,应用RT-PCR方法,扩增出AEV的外壳蛋白VP1、VP3、VP0基因,将它们克隆于pUCm-T载体上进行序列分析。结果显示,AEV-NH937病毒株VP1基因全长810 bp、编码270个氨基酸,VP3基因全长735 bp、编码245个氨基酸,VP0基因全长726 bp、编码242个氨基酸;与Calnek疫苗株相比,AEV-NH937病毒株VP1、VP3、VP0基因的核苷酸同源性分别为90.62%、93.88%、95.45%,氨基酸同源性分别为88.89%、97.96%、98.35%。将VP1、VP3、VP0基因分别插入载体pcDNA4/His Max构建表达重组质粒并转入宿主菌DH5α中,使基因得以表达。; 王嘉慧刘丽华陈富荣; 关键词：禽脑脊髓炎病毒克隆

牦牛瘤胃微生物元基因组BAC文库的筛选与分析: 反刍动物瘤胃是公认的木质纤维素高效降解的天然反应器,对瘤胃微生物的研究成为开发生物能源的热点领域之一。其研究手段已经从传统的依赖分离培养从瘤胃中获得木质纤维素降解菌,并对降解菌中的木质纤维素降解酶逐一分析,发展到通过基因...; 陈富荣; 关键词：瘤胃; 文献传递

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陈富荣