韩平
- 作品数:2 被引量:11H指数:2
- 供职机构:南京医科大学更多>>
- 相关领域:理学自动化与计算机技术生物学更多>>
- H9N2亚型禽流感病毒HA基因氨基酸位点分析被引量:4
- 2008年
- 通过系统进化分析,分离自我国的56条全长序列H9N2亚型禽流感病毒株HA基因的氨基酸残基序列,结果表明我国病毒株在早期具有散在发生性,同属于欧亚种系,进化方向与香港人源病毒株明显不同。采用codeml程序检测到HA基因,共有5个阳性选择位点(2T,3T,197T,233Q,380R),除380R外,均位于HA1肽链上,阳性选择位点位于主要的受体结合位点附近,对此需密切监测H9N2亚型禽流感,以防其关键位点的突变。分析蛋白质基序,也发现H9N2禽流感突破种间屏障感染人,可能与病毒株糖基化位点的突变有关。
- 宋晓峰韩平黄凤玲
- 关键词:H9N2亚型禽流感病毒HA基因进化分析
- 最优支持向量机用于HIV-1蛋白酶抑制剂的QSAR建模被引量:7
- 2007年
- 为了建立HIV蛋白酶抑制剂QSAR的优良模型,本文采用粒子群优化法搜索支持向量机的多参数复杂模型空间,以此形成最优支持向量机。通过与传统的梯度下降法、网格搜索法等模型选择方法的比较,采用并行计算的基于PSO算法的最优支持向量机法在模型精度及稳定性、搜索效率等方面都有优良的性能,实例测试也表明所建QSAR模型,有良好的泛化能力,所建模型对研究HIV药物有重要促进作用。
- 宋晓峰韩平
- 关键词:支持向量机粒子群算法构效关系