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刘丹

作品数：12 被引量：44H指数：4
供职机构：北京市朝阳区疾病预防控制中心更多>>
相关领域：医药卫生环境科学与工程更多>>

合作作者

文献类型

  • 12篇中文期刊文章

领域

  • 11篇医药卫生
  • 1篇环境科学与工...

主题

  • 3篇病毒
  • 2篇多位点序列分...
  • 2篇血清
  • 2篇血清群
  • 2篇血清型
  • 2篇药敏
  • 2篇沙门菌
  • 2篇耐药
  • 2篇奈瑟菌
  • 2篇脑膜
  • 2篇脑膜炎
  • 2篇脑膜炎奈瑟菌
  • 2篇腹泻
  • 2篇HA基因
  • 1篇电泳
  • 1篇毒力
  • 1篇毒力基因
  • 1篇毒效
  • 1篇毒株
  • 1篇新型冠状病毒

机构

  • 12篇北京市朝阳区...
  • 1篇中国疾病预防...
  • 1篇辽宁润基生物...

作者

  • 12篇刘丹
  • 8篇高艳
  • 7篇赵剑虹
  • 4篇孙灵利
  • 4篇焦洋
  • 4篇顾琳
  • 3篇王恒伟
  • 3篇张玉松
  • 3篇段杉
  • 2篇黄平
  • 1篇张晓曦
  • 1篇王珊
  • 1篇李丽
  • 1篇王晨
  • 1篇宋衍燕
  • 1篇唐承军
  • 1篇罗凤基
  • 1篇曾照丽
  • 1篇朱琳
  • 1篇郝民

传媒

  • 3篇中国卫生检验...
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年份

  • 2篇2024
  • 2篇2023
  • 1篇2022
  • 2篇2021
  • 2篇2020
  • 1篇2018
  • 2篇2014
共 12 条 记 录，以下是 1-10
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排序方式：
2017年—2020年北京市朝阳区健康人群携带脑膜炎奈瑟菌分子特征分析
2023年
目的 对北京市朝阳区健康人群携带的脑膜炎奈瑟菌进行血清基因型和多位点序列分型研究,了解菌群病原学特征。方法 收集2017年—2020年北京市朝阳区健康人群咽拭子标本中分离的21株脑膜炎奈瑟菌,进行生化鉴定和种特异性基因复核,并采用real-time PCR方法进行血清基因分群,采用多位点序列分型方法对菌株进行分子分型,使用MEGA5.1软件构建系统进化树,分析分离株与全球高致病性克隆群的关系。结果 经鉴定21株菌均为脑膜炎奈瑟菌,血清群结果为B群11株,X群3株,不可分群7株。21株脑膜炎奈瑟菌共有16种序列型,其中14株属于4个已定义的克隆群,cc4821 (8株)、cc5(2株)、cc198(2株)、cc175 (2株),7株为无序列群,分别是ST-7962(2株)、ST-5586(3株)、ST-5613(1株)、ST-5863(1株)。基于管家基因序列的系统发生树,结果表明分离株ST型别多样化,存在全球高致病性克隆群cc4821和cc5,以B群cc4821为优势克隆。划为无序列群的2株B群的ST-7962分离株与cc4821关系较近,可能与B群分离株ST-4897(cc4821)存在局部进化。结论 2017年—2020年北京市朝阳区健康人群分离的脑膜炎奈瑟菌主要为B群,各年散在分布,且存在高致病性克隆,需加强关注脑膜炎奈瑟菌的菌群变迁,及早发现疫情,对公众的健康潜在危害应予以关注,并为免疫政策提供参考。
刘丹段杉高艳赵剑虹
关键词：脑膜炎奈瑟菌多位点序列分型血清群
北京市朝阳区2008年-2016年健康人群不同血清群脑膜炎奈瑟菌抗生素体外敏感性分析被引量：4
2018年
目的了解北京市朝阳区健康人群脑膜炎奈瑟菌血清群分布特征和对抗生素敏感性变化趋势。方法 2008年-2016年脑膜炎奈瑟菌血清型别鉴定,纸片扩散法、E-test浓度梯度扩散法,进行11种抗生素敏感性检测和分析。结果 75株Nm菌株中B群44.0%(33/75)、NG群17.3%(13/75)、A群14.7(11/75)、Y群9.3%(7/75)、W135群9.3%(7/75)、C群4.0%(3/75)和X群1.3%(1/75)。75株菌美罗培南、阿奇霉素、米诺环素、头孢曲松均敏感;复方新诺明、环丙沙星、萘啶酸、氯霉素、利福平、青霉素耐药率依次为96.0%、80.0%、76.0%、13.3%、10.7%、2.67%。氨苄西林敏感率为88.0%(66/75),中介率为12.0%(9/75)。不同年份、不同血清群菌株对11种抗生素耐药程度不同,出现多重耐药性,三重耐药率为53.3%。结论健康人群脑膜炎奈瑟菌B群携带率最高,NG群占一定比例;对磺胺类和喹诺酮类药物具有较高耐药性,对青霉素类药物敏感性下降,出现耐药菌株。
郝民王恒伟宋衍燕刘丹
关键词：脑膜炎奈瑟菌血清型药敏
健康人群致泻性大肠埃希菌耐药性及多位点序列分型分析被引量：1
2023年
目的通过分析健康人群致泻性大肠埃希菌(Diarrheagenic Escherichia coli,DEC)携带率、耐药性及多位点序列分型(multilocus sequence typing,MLST),探究其病原学特征。方法收集2018年北京市朝阳区健康人群粪便标本809份,进行细菌分离培养,采用聚合酶链式反应(Polymerase Chain Reaction,PCR)法检测六种DEC特异毒力基因(aggR、eae、bfpA、ipaH、lt、st、stx1、stx2、afaD)。应用微量肉汤稀释法对检测出的DEC进行26种常用药物的敏感试验。对所有DEC菌株进行MLST分析。结果共检出38株DEC分布于各年龄组,检出率为4.70%。主要型别为肠道致病性大肠埃希菌(EPEC)、弥散粘附性大肠埃希菌(DAEC)、肠聚集性大肠埃希菌(EAEC)。药敏结果显示,38株DEC对卡那霉素、阿米卡星、亚胺培南、美罗培南全部敏感,对三代头孢、三代喹诺酮类抗生素耐药率较低。对四环素耐药率最高(76.32%),氨苄西林次之(65.79%),对复方新诺明、磺胺异恶唑、萘啶酸耐药率超过50.00%,多重耐药率超过60%。产超广谱β-内酰胺酶(ESBLs)表型的比例为21.05%。MLST型别多样,ST10、ST38、ST1092和ST131为相对主要型别,携带率分别为13.16%(5/38)、13.16%(5/38)、10.53%(4/38)和7.89%(3/38)。结论北京市朝阳区健康人群各年龄组均有DEC检出,为条件致病菌对多种抗生素产生耐药,MLST型别多样,存在全球广泛关注的ST131型别。
刘丹孔德春顾琳张淑高艳
关键词：致泻性大肠埃希菌耐药性多位点序列分型
酶底物法与过滤培养法检测非饮用水中嗜肺军团菌的比较被引量：5
2020年
水体中嗜肺军团菌可引起军团菌病。酶底物法定量检测水体中嗜肺军团菌是一种新方法。文中应用酶底物法与过滤培养法检测非饮用水中嗜肺军团菌,使用SPSS软件进行统计分析。两种方法灵敏度分别为89.29%(25/28)和64.29%(18/28)。定性结果经McNemar检验,差异无统计学意义(P=0.092),定量结果具有相关性(皮尔逊相关系数为0.718,P=0.000)。结果显示,酶底物法和过滤培养法对非饮用水中嗜肺军团菌的检出结果具有一致性。酶底物法灵敏度更高,操作流程简单,具有很好的应用前景。
高艳李啸段杉刘丹顾琳赵剑虹孙灵利
关键词：酶底物法嗜肺军团菌非饮用水
腹泻患儿粪便中沙门菌的血清型、药敏分析及脉冲场凝胶电泳分子分型研究被引量：12
2020年
目的研究2019年北京市朝阳区0~10岁腹泻患儿粪便中分离出的沙门菌的血清型、脉冲场凝胶电泳(pulsed field gel electrophoresis,PFGE)分子分型研究及耐药特点。方法对分离自腹泻患儿病例的47株沙门菌进行血清分型,采用微量肉汤稀释法进行27种抗生素的药敏实验;采用PFGE脉冲场凝胶电泳进行指纹图谱分型研究。结果47株沙门分为8种血清型,优势血清型有2种,分别为肠炎沙门菌23株占48.94%,鼠伤寒沙门菌14株占29.79%。47株沙门菌对磺胺异恶唑耐药率(57.45%)最高,其次为氨苄西林(48.94%)和链霉素(48.94%)。23株肠炎沙门菌可分成8个PFGE指纹图谱,14株鼠伤寒沙门菌可分成13个PFGE指纹图谱。结论北京市朝阳区0~10岁儿童食源性沙门菌血清主要为肠炎沙门菌和鼠伤寒沙门菌,各血清型的耐药性有所不同,PFGE指纹图谱呈多样性。
顾琳高艳刘丹焦洋段杉张越
关键词：食源性疾患沙门菌血清型药敏实验脉冲场凝胶电泳
北京市朝阳区腹泻人群沙门菌基因组特征分析
2024年
目的 用全基因组测序技术分析2021年北京市朝阳区人源39株沙门菌血清型、耐药基因和毒力基因携带情况。方法 应用常规检测法,对2021年北京市朝阳区疾病预防控制中心微生物检验科检出的39株沙门菌进行血清分型和药敏实验;同时对分离菌株进行全基因组测序,应用SeqSero、CARD和VFDB数据库分别进行血清型、耐药性和毒力基因携带情况的预测,对常规检测法和全基因组序列分析法得到的血清型数据进行比较;分析耐药基因和毒力基因的携带情况。结果 2021年北京市朝阳区腹泻患者粪便中检出的沙门菌血清型主要为肠炎沙门(51.28%)和鼠伤寒沙门菌i相变种(17.95%);39株沙门菌共检测到10类44种耐药基因,多重耐药外排泵蛋白抗性基因MdtK和多重耐药调控基因SdiA携带率100%;VFDB数据库毒力因子预测共发现120种3867个毒力因子。20株肠炎沙门菌中检出的毒力因子种类、数目高于其他血清型沙门菌。结论 全基因组测序有助于沙门菌罕见血清型的鉴定。2021年北京市朝阳区沙门菌多重耐药情况严重,携带的耐药基因和毒力因子种类多且复杂,在疾病防控工作中需要持续监测。
黄平高艳刘丹赵剑虹
关键词：全基因组测序沙门菌耐药基因毒力基因
2013年北京市首例输入性D_9基因型麻疹毒株的分离和鉴定被引量：6
2014年
目的分离并鉴定北京市输入性D9基因型麻疹毒株。方法使用Vero／SLAM细胞，对可疑麻疹输入性病例的咽拭子和尿液标本进行麻疹毒株的分离培养。用反转录-聚合酶链反应扩增麻疹病毒核蛋白（N）基因羧基末端676个核苷酸片段，对扩增产物进行核苷酸序列测定和分析，并以羧基末端450个核苷酸片段构建基因亲缘关系树，进行遗传距离及核苷酸同源性分析。结果该病毒分离株BJCYl3026—2和世界卫生组织D9基因型代表株Victoria.AUS（维多利亚．澳大利亚）12．99在基因亲缘性关系树上同属一个分支，核苷酸同源性为95．8％，氨基酸同源性为96％；和其他23个基因型代表株的核苷酸和氨基酸同源性分别在88．1％-95．6％和90．7％～96．7％。和中国大陆目前所使用的麻疹疫苗株沪。相比对，其核苷酸和氨基酸同源性分别为91．1％和90．O％；和中国目前流行的麻疹病毒绝对优势本土基因型H，。基因型代表株相比对，其核苷酸和氨基酸同源性分别为89．4％和91．3％。结论该输人性病例的病毒分离株为麻疹病毒D9基因型。
高艳赵剑虹王恒伟张玉松张士尧焦洋刘丹王珊顾琳韩庆华李书明罗凤基
关键词：麻疹病毒亲缘性分析病毒监测
2009—2019年北京市朝阳区甲型H1N1流感病毒HA基因特征分析被引量：3
2022年
目的分析北京市朝阳区2009—2019年甲型H1N1流感病毒(H1N1)血凝素(hemagglutinin,HA)基因特征,了解朝阳区H1N1变异情况,为评估流感疫苗有效性提供依据。方法从GenBank数据库和GISAID平台下载2009—2019年流感疫苗推荐株以及各分支主要流行株和代表株序列,与北京市朝阳区46株H1N1北京分离株的HA基因序列进行系统进化分析和氨基酸变异分析。利用MEGA 5.0软件邻接法(neighbor-joining,NJ)构建系统进化树并查看氨基酸变异位点,同时采用NetNGlyc 1.0在线软件分析HA基因潜在的糖基化位点。结果北京市朝阳区46株H1N1分离株HA基因分别属于Clade 7、Clade 8、6B、6B.1、6B.2及6C等分支。除2009年以外,2012—2019年H1N1北京市朝阳区分离株与对应年度疫苗株比较接近,同源性为90%以上。各年份H1N1北京市朝阳区分离株在4个抗原决定簇区均有氨基酸变异发生,近年H1N1北京市朝阳区分离株所在的6B.1分支序列均有S74R(Cb区)、S164T(Sa区)共同氨基酸变异;除了6B.1A2分支,其余6B.1分支序列均增加1个糖基化位点162 NQTY,其中6B.1新分支同时在162位点(Sa区)上发生氨基酸共同变异导致其糖基化位点162 NQTY转变为162 NQSY;其中,A/Beijing-Chaoyang/SWL465/2019北京市朝阳区分离株的受体结合部位发现氨基酸共同变异位点,分别位于190螺旋的D/V187A位和220环的R223Q位。结论2009—2019年北京市朝阳区H1N1分离株的HA基因不断发生变异,总体与对应年度疫苗株比较接近,但仍有抗原决定簇和受体结合部位发生氨基酸变异、糖基化位点增加,提示持续监测H1N1的HA基因的必要性,并可为流感疫苗筛选和疫情防控提供参考。
赵剑虹韩桃利张玉松焦洋刘丹高艳房琼琼孙灵利
关键词：甲型H1N1流感病毒HA基因进化分析
过氧化氢干雾消毒机对室内环境物体表面消毒效果观察被引量：6
2021年
目的观察过氧化氢干雾消毒机对室内物体表面消毒效果。方法采用载体定量杀菌试验方法,观察某过氧化氢干雾消毒机对实验室内物体表面消毒效果。结果该过氧化氢干雾消毒机以30 mL/min流量(过氧化氢浓度81 mg/m^(3))总运行240 min,对载体上金黄色葡萄球菌杀灭对数值>3.00;该消毒机以流量90 mL/min(过氧化氢浓度为190 mg/L)总运行240 min,对载体上嗜热脂肪杆菌芽孢杀灭对数值>3.00。结论该过氧化氢干雾消毒机对金黄色葡萄球菌和细菌芽孢杀灭效果可达到消毒要求。
朱琳刘丹张洪江唐承军
关键词：芽孢金黄色葡萄球菌
2007—2019年北京市朝阳区甲型H3N2流感病毒HA基因特征分析
2024年
目的了解北京市朝阳区甲型H3N2亚型流感病毒HA基因变异情况,为评估疫苗有效性提供基础数据。方法从全球流感共享数据库(GISAID)下载2007—2019年世界卫生组织推荐流感疫苗株及各分支代表株序列,与本研究H3N2亚型分离株的HA基因序列进行系统进化、氨基酸变异分析和疫苗效力评估。结果2015年及之前的H3N2亚型流感多数属于3C.3a分支,2016年开始以3C.2a分支为主,2017年以3C.2a2为主,并进化至3C.2a3,2019年又转换为3C.3a1亚分支;2009年、2013年和2015年存在3C.2和3C.3分支共流行的现象。抗原决定簇A~D区共计存在54个氨基酸变异位点;受体结合部位的130环、190螺旋和220环区域均有氨基酸位点发生变异;各年均有发生糖基化位点的缺失/增加/转换,多数发生在HA1区域。预测流感疫苗效力(VE)为5.00%~47.00%(PepitopeMax值:0~0.2105)。结论北京市朝阳区2007—2019年H3N2流感病毒HA基因进化具有多样性和复杂性,且有可能发生了抗原漂移,部分年份流行株与推荐疫苗株匹配性较差,提示持续监测H3N2亚型流感病毒HA基因变异的必要性。
孙灵利刘丹高艳赵剑虹张玉松韩桃利
关键词：血凝素疫苗效力
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