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王荣兴

作品数：12 被引量：1H指数：1
供职机构：桂林电子科技大学更多>>
相关领域：文化科学自动化与计算机技术更多>>

合作作者

文献类型

  • 11篇专利
  • 1篇期刊文章

领域

  • 1篇自动化与计算...
  • 1篇文化科学

主题

  • 9篇剪接
  • 4篇位点
  • 4篇RNA-SE...
  • 4篇测序
  • 2篇数据索引
  • 2篇数组
  • 2篇双端
  • 2篇索引
  • 2篇子序列
  • 2篇字符
  • 2篇字符串
  • 2篇最长公共子序...
  • 2篇物理化学
  • 2篇物理化学性质
  • 2篇物种
  • 2篇线程
  • 2篇向量
  • 2篇向量表示
  • 2篇鲁棒
  • 2篇鲁棒性

机构

  • 12篇桂林电子科技...

作者

  • 12篇王荣兴
  • 1篇易新河
  • 1篇张文辉

传媒

  • 1篇湖南工业职业...

年份

  • 6篇2024
  • 1篇2023
  • 4篇2022
  • 1篇2016
共 12 条 记 录，以下是 1-10
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排序方式：
一种双端成对的剪接位点预测方法
本发明公开了一种双端成对的剪接位点预测方法，该方法通过获取双端成对的剪接位点样本序列作为基准数据集和独立数据集；将碱基序列通过基于序列本身、物理化学性质等多种特征提取方式进行编码；组合多种特征作为一个多通道多维的向量表示...
张艳菊许峻玮齐王璟王荣兴
文献传递
一种基于GPU的最大精确匹配并行查找算法
本发明公开了一种基于GPU的最大精确匹配并行查找算法，旨在于加速第三代RNA测序数据比对算法耗时最多的种子过程。首先，在CPU上对转录组创建FM索引，构建并采样参考基因组后缀的最长公共前缀数组，将它们从CPU内存复制到G...
王荣兴张艳菊
一种基于注意力机制的剪接位点预测及解释性方法
本发明公开了一种基于注意力机制的剪接位点预测及解释性方法，该方法提出结合注意力机制的卷积神经网络模型，精准识别剪接位点，并基于模型，提出可视化权重解释分析方法，在五个物种上建立了有效的预测模型。独立测试集的结果证明了在涉...
张艳菊许峻玮齐王璟王荣兴
一种基于GPU并行计算的第三代测序RNA-seq比对方法
本发明公开了一种基于GPU并行计算的第三代测序RNA‑seq比对方法，该方法通过获取包含目标序列和查询序列的数据集，然后对查询序列即第三代测序的RNA‑seq进行数据纠错；以及数据索引和播种；再对播种得到的种子进行链算法...
张艳菊李琪王荣兴齐王璟
文献传递
一种基于WFA算法的第三代测序RNA-seq比对方法
本发明公开了一种基于WFA算法的第三代测序RNA‑seq比对方法，该方法通过获取包含目标序列和查询序列的数据集；然后对参考基因组进行索引；以及区域选择和图映射；查找k长子字符串的最长公共子序列LCSk，再进行锚点过滤和锚...
张艳菊李琪王荣兴齐王璟
文献传递
一种用于加速第三代RNA测序数据比对的最大精确匹配并行查找算法
本发明公开了一种用于加速第三代RNA测序数据比对的最大精确匹配并行查找算法，适用于对以“索引‑种子‑链接”为设计思想的比对算法进行加速。该算法首先对基因组的参考序列进行BWT变换，构建对应的FM索引；然后计算基因组参考序...
王荣兴张艳菊
一种基于GPU并行计算的第三代测序RNA-seq比对方法
本发明公开了一种基于GPU并行计算的第三代测序RNA‑seq比对方法，该方法通过获取包含目标序列和查询序列的数据集，然后对查询序列即第三代测序的RNA‑seq进行数据纠错；以及数据索引和播种；再对播种得到的种子进行链算法...
张艳菊李琪王荣兴齐王璟
基于生物序列顺式作用调控元件的在线预测网站构建方法
本发明公开了一种基于生物序列顺式作用调控元件的在线预测网站构建方法，该方法适用于将针对生物序列进行机器学习训练所得模型构建成在线预测网站。随着人工智能技术的不断发展，机器学习算法蓬勃发展，并且成功地被应用于多个领域。特别...
张艳菊王荣兴
一种双端成对的剪接位点预测方法
本发明公开了一种双端成对的剪接位点预测方法，该方法通过获取双端成对的剪接位点样本序列作为基准数据集和独立数据集；将碱基序列通过基于序列本身、物理化学性质等多种特征提取方式进行编码；组合多种特征作为一个多通道多维的向量表示...
张艳菊许峻玮齐王璟王荣兴
一种基于WFA算法的第三代测序RNA-seq比对方法
本发明公开了一种基于WFA算法的第三代测序RNA‑seq比对方法，该方法通过获取包含目标序列和查询序列的数据集；然后对参考基因组进行索引；以及区域选择和图映射；查找k长子字符串的最长公共子序列LCSk，再进行锚点过滤和锚...
张艳菊李琪王荣兴齐王璟
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