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北京市某区1例人感染H7N9禽流感病毒的HA和NA基因特征分析被引量：1: 2020年; 目的了解北京市某区1例人感染H7N9禽流感病毒基因特征,为禽流感病例的早期发现、疫情控制提供参考。方法提取病例临床样本病毒核酸,反转录扩增后进行病毒血凝素基因(hemagglutinin, HA)、神经氨酸酶基因(neuraminidase, NA)序列测定。获得的病毒序列与全球流感共享数据库中H7N9禽流感病毒株进行序列分析,比较该病毒与北京市既往发现株和其他省市毒株同源性,构建系统发育树,并对部分耐药位点和糖基化位点进行分析。结果北京市某区1例H7N9禽流感病毒为低致病性禽流感。HA、NA与北京既往发现的29株毒株氨基酸同源性为97.2%~100%和96.8%~100%,基于系统进化分析与之最为相近的疫苗株为A/Hunan/02650/2016。HA蛋白受体结合位点发生了G186V、Q226L突变,HA和NA的糖基化位点均未发生变化。结论该区出现的H7N9病毒与北京地区既往发现H7N9毒株具有高度同源性,部分氨基酸位点存在变异,但未发生耐药突变。; 吴杨牛桓彩庄鹏李东迅刘重程李飒舒高林潘阳; 关键词：禽流感

2015年北京市昌平区致泻性大肠埃希菌耐药性及脉冲场凝胶电泳分型研究被引量：6: 2017年; 目的了解2015年北京市昌平区致泻性大肠埃希菌耐药状况并对其进行脉冲场凝胶电泳(PFGE)分型研究。方法药敏实验按照美国临床实验室标准化协会(CLSI)推荐的K-B纸片法进行24种抗生素的敏感性分析;PFGE实验参照PulseNet PFGE实验方法。结果药敏结果显示,致泻性大肠埃希菌对头孢比肟、亚胺培南完全敏感;对阿米卡星、妥布霉素、米诺环素耐药率极高,分别为94.6%、97.3%和97.3%。耐药谱分析显示,致泻性大肠埃希菌同时耐受抗生素种类为2~7种。PFGE分析发现,33株致泻性大肠埃希菌具有31种PFGE带型,菌株之间的相似系数为68.0%~100.0%,其中2株ETEC和2株EPEC有一致的PFGE带型。结论昌平区引起腹泻的致泻性大肠埃希菌耐受抗生素的种类多、多重耐药严重且PFGE带型呈高度多态性。; 李东迅彭华闻艳红徐代庆吴杨庄鹏舒高林; 关键词：致泻性大肠埃希菌耐药性脉冲场凝胶电泳

2015年北京市昌平区沙门菌临床菌株分子特征及耐药性被引量：3: 2017年; 目的了解2015年北京市昌平区沙门菌耐药状况及分子特征。方法药敏实验按照美国临床实验室标准化协会推荐的K-B纸片法对14种抗生素进行敏感性分析;脉冲场凝胶电泳(PFGE)实验参照Pulse Net推荐的PFGE实验方法。结果药敏结果显示,大部分沙门菌对萘啶酸耐药,对四环素类抗生素耐药或处于耐药和敏感之间。耐药谱分析显示,大部分沙门菌同时对2、3种抗生素类药物耐受。PFGE分析发现,25株沙门菌具有18种PFGE带型,菌株之间的相似系数为54%~100%。结论昌平区引起腹泻的沙门菌耐受抗生素的种类多且PFGE带型呈多态性。; 李东迅彭华闻艳红徐代庆吴杨庄鹏舒高林; 关键词：沙门菌耐药性脉冲场凝胶电泳

多重巢式PCR应用于1起聚集性发热疫情的病原诊断被引量：3: 2018年; 目的增强实验室对突发发热疫情的快速诊断能力,完善、优化聚集性发热的病原检测方法。方法采用多重巢式PCR扩增法,对1起聚集性发热疫情样本进行病原筛查,同时对扩增产物测序,进行BLAST比对,进行血清型分型,比较不同引物的扩增效果。结果采集7份病例咽拭子标本,以呼吸道病毒核酸多重联检试剂盒进行14种病毒筛查,其中4份为腺病毒阳性,阳性率为57.1%。采用3组巢式引物进行扩增,腺病毒阳性样本6份,均为腺病毒3型;测序成功的5株核苷酸、蛋白质序列同源性均为100.0%。第3组巢式引物扩增、分析效果较好,阳性率为71.4%。结论成品试剂盒可进行不明原因发热疫情的病原筛查;多重巢式PCR扩增法可增加病毒检出率,对病毒分型和序列分析。; 吴杨高进玺庄鹏李东迅刘重程舒高林牛桓彩; 关键词：呼吸道感染腺病毒基因分型

2016年北京市昌平区A组乙型溶血性链球菌及相关菌株检测和分析被引量：5: 2018年; 目的对2016年北京市昌平区猩红热病原学监测结果进行分析。方法利用qPCR方法与传统划线分离方法检测病例携带A组乙型溶血性链球菌(GAS)的阳性率,对分离出的GAS进行emm分型。利用16S rRNA和梅里埃VITEK 2 Compact全自动细菌鉴定及药敏分析系统对检测出的非GAS菌株进行鉴定。结果 2016年昌平区采集的132份病例样本中,通过平板划线分离检出GAS 13株(阳性率9.85%),通过qPCR检出GAS 19株(阳性率14.39%)。分离出的GAS的emm型别为emm1和emm12。分离出可培养的非GAS菌种63株,分属于5个不同菌属,共计13种菌种。结论昌平地区GAS的emm型别较为单一,利用qPCR方法比平板划线分离方法更敏感,检测出的阳性GAS率更高。通过分离咽拭子中其他菌株,同时使用16S rRNA方法和梅里埃VITEK 2 Compact全自动细菌鉴定及药敏分析鉴定,两者阳性率有差异,16S rRNA方法更准确。; 吴杨赵炳岩高进玺张阳庄鹏李东迅舒高林; 关键词：实时荧光定量

北京市2018年1起流行性腮腺炎暴发的腮腺炎病毒基因特征被引量：4: 2019年; 目的了解北京市某区1起流行性腮腺炎(流腮)暴发的腮腺炎病毒(MuV)基因特征。方法对该起暴发中的疑似流腮病例采集咽拭子标本,开展MuV核酸检测和病毒分离,进行SH基因分型、亲缘关系和变异分析。结果本起疫情共分离出8株MuV毒株,其SH核苷酸序列完全相同,均为F基因型。所有分离株与北京市历年MuV毒株之间核苷酸序列差异为1-17个(0.3%-5.4%),属于同一个分支。结论北京市优势MuV毒株仍为F基因型,但型内差异较大,需加强流腮的持续性病毒学监测。; 舒高林吴杨张阳赵炳岩庄鹏高进玺陈萌; 关键词：流行性腮腺炎腮腺炎病毒基因型

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庄鹏