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猪全基因组范围ETS基因家族成员的鉴定、进化与表达分析被引量：1: 2020年; ETS转录因子家族在动物中广泛存在,参与细胞分化调控、细胞周期控制、细胞凋亡等多个生物学过程。文章采用生物信息学方法系统分析猪ETS家族成员进化关系和调控图谱,结合RNA-Seq数据分析其组织表达规律。研究利用Pfam鉴定ETS保守结构域序列检索猪(Sus scrofa)蛋白序列,最终在猪基因组上鉴定得到23个ETS家族基因。分析ETS家族基因、蛋白一级结构和高级结构及亚细胞定位预测。基于最大似然法,构建ETS家族系统发育树发现,可分为11个子家族,子家族成员保守结构域、基因结构、理化性质相似。通过生信分析构建由ETS家族、靶基因和miRNA构成的基因调控网络,筛选出40个"ETS家族基因-miRNA-靶基因"前馈回路。转录表达谱提示ETS家族基因在成年公猪和母猪28种不同类型组织中均有表达,且ETS1基因在免疫组织(淋巴、脾脏)和外周血单核细胞中高表达,SPIC基因在免疫组织(淋巴、脾脏)高表达。研究结果为揭示ETS家族成员生物学功能奠定基础。; 王志鹏周萌周萌郭媛媛王涛刘胜伟王涛丁坤闫晓红杨里昂; 关键词：系统发育树表达谱基因调控网络

鸡全基因组转录因子预测与分析: 2016年; 转录因子是真核细胞基因表达调控网络的核心基因。本研究利用隐马尔可夫模型,在鸡基因组上共识别720个转录因子基因,分布在28条常染色体、Z染色体以及7个连锁群。在基因组上呈非均匀分布。发现有554个转录因子位于1 515个QTL内,包括影响外貌性状、健康性状、生理性状和生产性能性状。; 王志鹏景军红周萌郭媛媛李婕; 关键词：全基因组转录因子

鸡全基因组选择信号筛选研究进展被引量：3: 2016年; 人工选择对家鸡驯化及品种形成具有重要作用,基因组上留有选择痕迹。随着基因组技术和选择信号检测方法完善,在基因组上检测选择信号成为进化生物学领域研究热点。文章主要描述选择信号定义,总结检测选择信号的重要统计方法,分析鸡基因组选择信号检测结果,以期为鸡全基因组领域研究提供参考。; 王志鹏景军红周萌; 关键词：基因组

林甸鸡蛋品质性状的遗传参数估计被引量：2: 2017年; 为提高林甸鸡蛋品质性状的选育效果,实验选择300日龄林甸鸡,基于动物模型利用REML方法对蛋重(EW)、蛋黄重(YW)、蛋黄比例(AY)、蛋壳重(ESW)、蛋壳强度(ESS)、蛋壳厚度(EST)、蛋白高度(AH)、哈氏单位(HU)、纵径(ELL)、横径(ESL)和蛋形指数(ESI)等11个主要性状进行遗传参数估计。结果表明:除ESS性状的遗传力较低外(h^2=0.15),其余蛋品质性状都属于中等或高等遗传力性状;EW与描述鸡蛋内部特征的YW、AH,以及描述鸡蛋外部特征的ESW、ELL、ESL等性状存在显著的正遗传相关(P<9.1E-4),且遗传相关较高;ESW、ESS和EST 3个性状间呈显著正遗传相关。; 景军红周萌陈耀峰李玉茂李辉王志鹏; 关键词：蛋品质

代谢组学在家养动物遗传育种中的应用被引量：7: 2019年; 代谢组学是使用分析化学技术对生物样品(如乳液、血浆、血清等)中的大量小分子代谢物进行全面鉴定和定量分析,已经广泛应用于生物医学、营养学、作物学和畜牧学研究中。最初,代谢组学主要应用于畜牧生产中的非遗传学研究。目前,随着生理基因组学、生理遗传学研究的增多,越来越多的研究者开始利用代谢组学的技术和方法开展动物遗传育种研究。本文综述了代谢组学检测技术与平台特点及代谢组学在动物遗传学与基因组中的应用,着重总结了动物代谢分子遗传参数估计、品系(品种)间代谢图谱差异、代谢组全基因组关联分析、筛选影响重要经济性状的生物标记等领域的研究进展,讨论了代谢组学研究还需亟待解决的问题。本文通过综述代谢组学在动物育种中的研究进展,旨在为进一步利用代谢组学技术开展动物重要经济性状的遗传基础研究提供参考。; 周萌周萌毛瑞涵郭静王志鹏; 关键词：代谢组学家养动物遗传学动物育种

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周萌