刘永晶
- 作品数：4 被引量：0H指数：0
- 供职机构：哈尔滨医科大学更多>>
- 发文基金：黑龙江省博士后基金国家自然科学基金黑龙江省自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生自动化与计算机技术更多>>
- 基于miRNA-TF调控网络识别乳腺癌亚型关键调控子
- 2017年
- 目的挖掘乳腺癌各亚型关键调控子并评估其预后能力。方法整合TCGA数据库中乳腺癌样本基因表达、拷贝数变异和DNA甲基化数据,分亚型筛选癌症相关基因。以此为基础,挖掘各亚型的四类motif,将同亚型四类motif合并构建各亚型miRNA-TF调控网络。随后,挖掘每个网络hub节点,并对其预后能力进行评估。结果各调控网络中的10个hub miRNA分别为乳腺癌亚型关键调控子。结论基于miRNA-TF调控网络能有效识别出乳腺癌亚型预后相关生物标志物。
- 韩晓乐赵宁刘永晶严自创张强周元帅张瑞许艳
- 关键词：MIRNA
- Identifying the impact of miRNA-TF co-regulatory motifys on the dosage effect of PCGs and lncRNAs in prostate cancer
- Integrated analysis of copy number alteration and gene expression revealed that,a copy number amplification/de...
- 刘永晶张强严自创韦云真吴成许艳
- A comparative analysis reveals the dosage sensitivity and regulatory patterns of lncRNA in breast cancer
- In recent years,the research on lncRNA is increasing sharply,cumulative reports have suggested that lncRNA is ...
- 朱银领刘永晶张强严自创常志强许艳
- 基于CNV区域网络识别神经胶质瘤的重要功能区域
- 2013年
- 目的:基于基因拷贝数变异(CNV)区域网络识别神经胶质瘤的重要功能区域。方法:运用独特的计算样本的共相关性值的方法,使CNV数据与基因数据产生联系;基于蛋白质互作关系,在CNV区域与基因之间搭建桥梁,构建CNV区域网络;分析网络拓扑性质,识别出神经胶质瘤的重要功能CNV区域。结果:本文共识别出了11个与神经胶质瘤相关的候选重要功能CNV区域,通过功能注释和通路分析,确认了识别到的区域与神经胶质瘤有重要联系。结论:通过基因与表型之间的联系,利用已知表型基因在同源、功能、互作、结构域上的特征将CNV区域与基因联系起来,通过基因的功能可以了解到CNV区域的功能,对于疾病的预测和诊断有重要的意义。
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- 关键词：神经胶质瘤
