刘梦露
- 作品数:5 被引量:10H指数:2
- 供职机构:江西师范大学更多>>
- 发文基金:江西省自然科学基金国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:生物学农业科学更多>>
- 濒危羊踯躅子代幼苗遗传多样性的SSR分析被引量:3
- 2019年
- 利用本课题组此前开发的20对多态性较高的羊踯躅SSR引物,分析来自3个省份的4个羊踯躅野生幼苗自然居群(共64个株系)的遗传多样性和遗传结构,以期为羊踯躅保护提供科学依据。结果显示:(1)20对SSR引物共扩增出314个等位基因,每个SSR位点的平均等位基因数为15.700,多态信息含量PIC和有效等位基因数N_e的均值分别为0.850和4.457。(2)羊踯躅幼苗自然居群的基因多样性指数H和Shannon多样性指数I的均值分别为0.717和1.557,其中江西金溪(JX)居群的遗传多样性最丰富,浙江磐安(PA)的最低。(3)基于无限等位基因模型(IAM)分析发现,羊踯躅幼苗种群的基因流N_m和遗传分化系数F_(st)分别为1.372和0.155;AMOVA分析表明,羊踯躅幼苗种群的86.0%变异发生于居群内,仅有14%变异发生在居群间。(4)遗传距离法聚类NJ分析和Structure分析结果基本一致,分别聚为3大类和4大类。综合比较分析发现,羊踯躅幼苗种群中的各个遗传多样性相关的指标参数均低于成年自然居群,表明生境片段化已对羊踯躅的生存构成了极大的威胁。
- 董丽敏戴亮芳白李唯丹刘梦露谢建坤罗向东
- 关键词:SSR濒危植物
- 濒危植物羊踯躅全基因组SSR标记开发与鉴定研究(英文)被引量:2
- 2018年
- 该研究利用基于全基因组限制性酶切位点简化基因组测序技术(RAD-seq技术),开发濒危植物羊踯躅(Rhododendron molle G.Don)全基因组SSR标记,并对3个群体共63份羊踯躅材料进行验证鉴定,为进一步研究羊踯躅的遗传多样性和群体遗传结构以及保护利用提供技术支持。结果显示:(1)羊踯躅基因组测序获得原始数据7.653Gbp,过滤后为7.513Gbp;经组装发现,羊踯躅171.534Mbp的基因组分布在498 252contigs中。(2)通过SSR检测,在11 961SSR位点中获得了11 687对SSR分子标记,并且二核苷酸为基序的重复类型最丰富,达51.76%。(3)随机选取128对SSR标记在6个羊踯躅株系中进行PCR扩增,获得20对高多态性的SSR标记。(4)用所选的20对多态性SSR标记对3个群体共63份羊踯躅材料进行验证分析发现,这些多态性SSR标记位点的等位基因数为4~16个,期望杂合度(He)为0.489~0.908。研究表明,羊踯躅的SSR丰度适中,且二核苷酸为羊踯躅中最丰富的重复序列,该实验进一步证明RAD-seq技术是一种经济有效的基因测序方法,实验中开发的SSR引物将有助于进一步研究羊踯躅和其他近缘种的群体结构和多样性。
- 刘梦露戴亮芳程马龙张金李海燕谢建坤罗向东
- 关键词:濒危物种微卫星标记多态性
- 一种濒危羊踯躅离体组织培养繁殖与保存的方法
- 本发明公开了一种濒危羊踯躅离体组织培养繁殖与保存的方法,建立了羊踯躅组织培养过程中最佳快速繁殖体系和保存体系,包括最适宜的外植体的选择方法,高效的多重灭菌方法,羊踯躅离体生长繁殖与保存的最适宜培养基组份以及不定芽生根、驯...
- 罗向东刘梦露戴亮芳刘李珠杨雪琴余尚耘
- 文献传递
- 濒危羊踯躅自然居群的遗传多样性和遗传结构分析被引量:6
- 2016年
- 利用12对微卫星(SSR)分子标记对涉及6省8个羊踯躅自然居群193个体的遗传多样性和遗传结构进行分析,探讨羊踯躅遗传多样性水平与分化程度的可能原因,为羊踯躅的保护提供科学依据。结果显示:(1)12对SSR引物共扩出260个等位基因,每个位点的平均等位基因数为21.667,平均有效等位基因数(Ne)为5.425,平均多态信息含量(PIC)为0.900;物种水平的Shannon多样性指数(I)为1.768,基因多样性指数(H)为0.777。(2)江西金溪(JX)的羊踯躅居群的遗传变异最丰富,福建政和(ZH)的遗传多样性水平最低。(3)基于无限等位基因模型(IAM)的遗传分化系数(F_(st))为0.142,基因流(N_m)为1.522;AMOVA分析显示羊踯躅居群内变异(87.71%)大于居群间变异(12.29%)。(4)遗传距离法聚类NJ分析和Structure分析均表明,8个自然群体被分为三大类群;Mantel检测发现,羊踯躅遗传距离与地理距离无显著相关性。研究表明,羊踯躅最好以就地保护为主,应优先保护江西金溪(JX)居群,同时增加对福建政和(ZH)和湖北京山(JS)居群的保护权重。讨论了羊踯躅较高遗传多样性和中等程度分化的可能原因。
- 程马龙戴亮芳罗向东刘梦露周毅程彦秋谢建坤
- 关键词:SSR濒危植物保护
- 一种濒危羊踯躅离体组织培养繁殖与保存的方法
- 本发明公开了一种濒危羊踯躅离体组织培养繁殖与保存的方法,建立了羊踯躅组织培养过程中最佳快速繁殖体系和保存体系,包括最适宜的外植体的选择方法,高效的多重灭菌方法,羊踯躅离体生长繁殖与保存的最适宜培养基组份以及不定芽生根、驯...
- 罗向东刘梦露戴亮芳刘李珠杨雪琴余尚耘
- 文献传递