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山羊ZP3基因的cDNA克隆、序列分析及组织表达研究被引量：1: 2015年; 对高繁金堂黑山羊和低繁藏山羊ZP3基因c DNA进行克隆、序列分析,并采用Real-time PCR技术对其在发情前期母羊卵巢组织的表达进行研究.结果表明:山羊ZP3基因编码区全长为1269bp,共编码422个氨基酸,两品种间有2处碱基差异,但未导致氨基酸的差异.山羊的ZP3基因在卵巢表达量高,与其他组织差异极显著(P<0.01),但两个品种间差异不显著(P>0.05).说明ZP3基因主要在卵巢中表达,但可能不是影响山羊多羔性状的主基因.; 刘霜卢建远马力夏威胡亮罗斌杨珂伟字向东; 关键词：山羊 ZP3 克隆

基于RNA-Seq技术的牦牛体外受精胚胎发育转录组分析被引量：14: 2018年; 【目的】探明不同发育阶段牦牛体外受精(IVF)胚胎的转录组差异,了解差异表达基因(DEG)在功能、分类和代谢通路的差异,为揭示牦牛早期胚胎发育调控机制,促进牦牛胚胎体外生产技术的发展提供理论基础。【方法】以IVF技术生产的牦牛2-细胞、4-细胞、8-细胞、桑椹胚和囊胚5个发育阶段的胚胎为样本分别提取总RNA,采用Smart-Seq2扩增技术构建5个测序文库,应用Hi SeqTM 2500高通量测序技术进行转录组测序,对获得的有效序列进行功能注释及相关生物信息学分析。【结果】牦牛IVF后的卵裂率和囊胚率分别为69.3%和26.2%。2-细胞、4-细胞、8-细胞、桑椹胚和囊胚5个发育阶段的牦牛胚胎Clean reads为47 355 570—50 855 888条,其中有85.65%—90.02%的reads能比对到牦牛参考基因组序列上;8-细胞的胚胎比对上的转录本最多(14 893),而囊胚比对上的转录本最少(9 827)。牦牛胚胎转录本主要有5种可变剪接类型,转录起始区域可变剪接(TSS)和转录结束区域可变剪接(TTS)所占比例最大;牦牛2-细胞、4-细胞、8-细胞、桑椹胚和囊胚基因组分别有116601、234 131、196 420、70 841和94 840个位点存在单核苷酸多态性(SNP)。在4-细胞、8-细胞、桑椹胚、囊胚期开始表达的基因分别有1 221、1 116、142和564个;随着胚胎发育的进行,BMP15、KIT、GDF9、STAT3、ZP3和ZP4等母源基因的表达量逐渐减少,而SARS、IL18、ACO2、TXN2、ATP5B、PCGF4、UBE3A、MAPK13、SNURF和JUP等胚胎基因的表达量则逐渐增加。以|log2ratio|≥1且Q-value<0.05为筛选标准,在2-细胞和4-细胞胚胎、4-细胞和8-细胞胚胎、8-细胞胚胎和桑椹胚以及桑椹胚和囊胚比对中分别筛选到6 922、7 601、8 071和10 555个DEGs。GO分析表明,4个发育阶段的DEGs归类注释都涉及生物过程(BP)、细胞组分(CC)和分子功能(MF)3大类62个二级条目。通过KEGG pathway数据库分析,2-细胞和4-细胞期胚胎的DEGs参与到; 字向东罗斌夏威郑玉才熊显荣李键钟金城朱江江张正帆; 关键词：牦牛体外受精胚胎转录组 RNA-SEQ

不同收集方法及添加半胱氨酸、肝素钠对黄牛卵母细胞体外成熟及发育的影响: 2018年; 试验旨在研究不同卵母细胞收集方法及添加半胱氨酸、肝素钠对黄牛卵母细胞体外成熟及体外受精的影响。以黄牛为研究对象,采用两种方法(抽卵法和割卵法)抽取卵泡中的卵母细胞,比较两种方法获取的卵母细胞成熟率,结果发现,抽卵法获得的卵母细胞成熟率显著高于割卵法(P<0.05)。将获取的卵母细胞分为4组:A组(对照组,只添加基础成熟培养液)、B组(基础成熟培养液+200μmol/L半胱氨酸)、C组(基础成熟培养液+20μg/mL肝素钠)、D组(基础成熟培养液+200μmol/L半胱氨酸+20μg/mL肝素钠),结果发现,D组的卵母细胞成熟率显著高于A、B、C组(P<0.05),B、C组间卵母细胞成熟率无显著差异(P>0.05),但两组卵母细胞成熟率均显著高于A组(P<0.05);A组卵母细胞卵裂率均显著低于B、C、D组(P<0.05),B、C、D组间卵母细胞卵裂率无显著差异(P>0.05);D组囊胚率显著高于其他3组(P<0.05)。结果表明,抽卵法获得卵母细胞效率显著高于割卵法,肝素钠及半胱氨酸对黄牛卵母细胞体外成熟和体外受精都有促进作用,且同时添加两种物质对体外成熟的效果更佳。; 夏威漆丹许晴叶思捷蒋涛; 关键词：肝素钠半胱氨酸体外成熟体外受精

犏牛体外受精胚胎的发育转录组分析被引量：2: 2018年; 本研究旨在探讨犏牛早期胚胎发育调控机制,为提高犏牛胚胎体外生产效率提供理论基础。以娟珊牛精子体外受精(IVF)牦牛卵母细胞获得的2-、4-、8-细胞、桑椹胚和囊胚5个阶段的杂种胚胎分别提取总RNA,采用Smart-Seq2扩增、构建测序文库,应用RNA-Seq技术进行高通量测序分析。对HiSeqTM2500测序所得的Raw Reads进行数据过滤后,得到5个发育阶段的犏牛早期胚胎的Clean Reads为47 791 850~63 332 216条,有80.00%~91.13%比对上参考基因的序列。4-细胞期表达的基因数最多(15 400),而桑椹胚表达的基因数最少(9 604)。以log2ratio≥1,Q-value<0.05为阈值,获得2-~4-细胞、4-~8-细胞、8-细胞~桑椹胚及桑椹胚~囊胚4个发育阶段的差异表达基因(DEGs)分别为3 690、6 332、8 965和10 298个。GO分析表明,4个发育阶段的DEGs归类注释都涉及生物过程(BP)、细胞组分(CC)和分子功能(MF)3大类67个二级条目。KEGG分析表明,牦牛早期胚胎发育过程中DEGs富集的主要通路有剪接体(Spliceosome)、神经活性配体-受体互作(Neuroactive ligand-receptor interaction)、细胞因子及其受体相互作用(Cytokine-cytokine receptor interactions)、泛素介导的蛋白水解(Ubiquitin mediated proteolysis)、RNA转运(RNA transport)等通路。本研究利用RNA-Seq技术对犏牛体外受精胚胎在发育不同阶段转录组进行了分析,获得了众多差异基因和有关通路的富集,为完善犏牛胚胎体外生产技术提供了理论基础。; 字向东刘霜夏威熊显荣黄林张正帆李志雄李键钟金城王利朱江江; 关键词：犏牛体外受精胚胎转录组 RNA-SEQ

基于可见/近红外光谱技术的新鲜茶叶叶片含水率快速测定被引量：3: 2018年; 提出了利用可见/近红外光谱技术检测新鲜茶叶叶片中含水量的方法.首先采集350~2500nm波段范围内177个新鲜茶叶叶片的光谱反射率信息,作为X变量.将不同预处理后的光谱数据建立偏最小二乘(partial least squares,PLS)模型,再利用回归系数法(regression coefficients,RC)提取全波段光谱中的特征波长并建立基于特征波长的预测模型.结果显示,利用全谱段光谱信息建立的模型中,未经预处理建立的模型最优,建模集和预测集中决定系数(coefficient of determination,R^2)分别是0.9039和0.8856,均方根误差(root mean square error,RMSE)分别是0.0092和0.0120,剩余预测偏差(residual predictive deviation,RPD)是2.9659;基于特征波长的模型中,也是未经预处理建立的模型最优,建模集和预测集中R^2分别是0.9070和0.8199,RMSE分别是0.0107和0.0151,RPD是2.3701.结果表明,可见-近红外光谱技术结合特征波长提取进行新鲜茶叶叶片中含水率检测是可行的.; 张筱蕾夏威唐善虎; 关键词：茶叶光谱含水率偏最小二乘

山羊卵巢中BMP15、GDF9和BMPR1B基因的表达量研究被引量：18: 2016年; 山羊产羔数是影响山羊产业的重要性状,因此高产羔数是增加经济效益的有效方式。本文旨在筛选出影响高繁金堂黑山羊多胎主效基因,并探讨影响这两品种山羊多羔性状的分子调控机制。以发情前期的5只高繁金堂黑山羊和5只低繁藏山羊的卵巢组织为材料,提取总RNA,通过RT-PCR技术合成c DNA,采用实时荧光定量PCR技术,检测金堂黑山羊和藏山羊卵巢组织BMP15、GDF9和BMPR1B基因表达量。金堂黑山羊和藏山羊GDF9和BMPR1B基因mRNA在卵巢中的表达量差异不显著,而BMP15基因mRNA在卵巢中的表达量差异显著(P<0.05)。说明卵巢中BMP15基因的表达量与金堂黑山羊多羔性状相关。; 刘霜郑杰卢建远马力夏威胡亮罗斌任陶任称罗尔日字向东; 关键词：山羊卵巢 BMP15

山羊B4GALNT2基因的cDNA克隆及组织表达研究被引量：3: 2016年; 根据绵羊β-1,4-N-乙酰氨基半乳糖转移酶2(B4GALNT2)(登录号:KC175557)的mRNA序列设计引物,通过RT-PCR技术对高繁金堂黑山羊和单胎藏山羊卵巢组织B4GALNT2基因c DNA进行克隆、序列分析;采用Real-time PCR技术对发情前期山羊卵巢、子宫、输卵管、垂体、肝脏组织中的B4GALNT2基因的表达进行研究。结果表明:山羊B4GALNT2基因编码区全长为1 521 bp,共编码506个氨基酸,2个品种间有6处碱基差异,导致4处氨基酸差异。B4GALNT2基因mRNA在2个山羊品种卵巢、子宫、输卵管、垂体、肝脏中均有表达,在金堂黑山羊子宫和输卵管的表达量显著高于藏山羊(P<0.05)。说明B4GALNT2基因在动物进化中比较保守,与山羊多羔性状的相关性有待进一步研究。; 刘霜卢建远马力夏威胡亮罗斌杨珂伟字向东; 关键词：山羊克隆

动物遗传学教学改革与创新被引量：4: 2021年; 动物遗传学是生物学领域中最基本的学科之一,也是动物良种繁育的重要理论基础,更是动物育种学的理论基础和畜牧兽医学科重要的专业基础课程。而动物遗传、育种学长久以来为畜牧业的健康发展做着不可或缺的贡献。为了让学生更快地学会专业知识、掌握一些遗传技术、增强育种工作能力,笔者从动物遗传学教学内容的重组与优化、教材选择、理论教学与实验教学相平衡及完善教学考核及评价制度等方面展开了改革与创新。; 夏威夏威李俊杰; 关键词：动物遗传学教学改革教学创新网上教学实验教学

“以学生为中心”的动物遗传学教学改革探讨被引量：6: 2020年; 动物遗传学是畜牧、兽医学科重要的专业基础课,学习该课程可为后期专业课学习、动物生产实践与创新提供必要的知识储备,然而课堂教学中的"沉默"和"单声道"现象普遍存在,不能引起学生的兴趣。笔者首先分析该现象的潜在原因,通过采用鼓励学生参与研创课题、组织课程专题汇报、注重课堂设计、开展综合实验教学、调整课程考核形式及提高学习过程管理等以学生为中心的教学方法,充分调动学生学习动物遗传学的自主能动性,激发学生的学习兴趣,培养学生自学、实践及创新能力,取得了良好的教学效果,以期为动物遗传学实现新时代教学目标的改革提供参考。; 熊燕熊燕林亚秋李思宁夏威; 关键词：动物遗传学以学生为中心教学改革课堂设计

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