王鑫
- 作品数：4 被引量：13H指数：2
- 供职机构：剑桥大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家高技术研究发展计划黑龙江省杰出青年科学基金更多>>
- 相关领域：生物学自动化与计算机技术更多>>
- 可变剪接与疾病的生物信息学研究概况被引量：10
- 2011年
- 可变剪接是真核基因转录后期的重要调控机制,它使得同一条蛋白质编码基因能够产生多种转录体,极大的扩展了遗传信息的应用.研究发现,可变剪接与人类疾病有着密切的联系.错误的剪接会导致疾病,增加疾病的易感性与病变程度,甚至直接导致癌变.现对可变剪接调控机制与疾病的生物信息学研究进展进行综述.
- 王科俊吕俊杰冯伟兴王鑫
- 关键词：可变剪接疾病癌症生物信息学
- 一种基于综合信息的剪接位点识别方法被引量：2
- 2011年
- 为提高剪接位点识别的精度,提出一种基于综合信息的剪接位点识别方法.通过分析供体位点与受体位点的剪接信号、剪接序列、位点附近序列的二级结构,以及剪接因子作用过程等特征,分别为供体位点与受体位点建立信号模型和序列模型;应用Vienna软件中的Mfold包预测每个剪接位点附近序列最稳定的二级结构,将传统的四字符核酸表转化为八字符核酸表,每个序列用八字符进行描述,用结合了结构信息的序列对信号模型和序列模型进行训练学习;最后用训练好的模型进行剪接位点的识别.实验结果证明:该方法对剪接位点的识别取得了很好的效果,其识别精度可达95%以上.
- 王科俊吕俊杰冯伟兴王鑫
- 关键词：生物信息学剪接位点可变剪接
- 一种新的非翻译区剪接位点识别方法
- 2012年
- 为提高非翻译区剪接位点识别的精度,提出一种统计概率与支持向量机相结合的识别方法 .该方法主要分为两个阶段,第一阶段应用统计学方法对非翻译区(UTR)序列进行描述,将序列中各碱基之间的相关性、位置特异性、保守性等特征用概率形式描述,以概率参数作为第二阶段支持向量机的输入向量,第二阶段应用带有多项式核函数的支持向量机(SVM)对剪接位点进行识别.通过对人类5′UTR剪接位点数据集进行测试,结果表明:该方法对非翻译区剪接位点的识别取得了很好的效果.
- 吕俊杰王科俊冯伟兴王鑫
- 一种新的真核基因剪接位点识别方法被引量：1
- 2011年
- 剪接位点识别是基因组分析的关键步骤.为提高真核基因剪接位点识别的精度,提出一种融合多种信息的方法.在采用序列信息与剪接位点信号信息的基础上,增加剪接调控元件信息,并引入结构信息,针对供体位点与受体位点的不同特点,为其建立不同的识别模型.实验结果表明:该方法对剪接位点的识别具有较好的效果,其识别精度可达95%以上.
- 王科俊吕俊杰冯伟兴王鑫贺波
- 关键词：调控元件结构信息
