徐赛娟
- 作品数:2 被引量:2H指数:1
- 供职机构:福州大学数学与计算机科学学院更多>>
- 发文基金:福建省自然科学基金更多>>
- 相关领域:自动化与计算机技术更多>>
- 构建时延基因调控网络的多数据源融合算法被引量:1
- 2013年
- 为了进一步提高基因调控网络构建的精确度,提出一种基于多数据源融合的时延基因调控网络构建算法.该算法基于递归模糊神经网络模型,使用时序互信息估计基因间的转录时延,并限制每个基因的潜在调控基因,从而有效提高建网的效率.在网络结构学习阶段,使用离散多目标粒子群优化(discrete multi-objective particle swarm optimization,dMOPSO)算法实现从时序基因表达数据和CHIP-chip数据共同构建基因调控网络.人工模拟数据和酵母菌细胞周期表达数据的实验结果表明该算法能正确选出潜在的调控基因,从而更加精确地构建基因调控网络.
- 徐赛娟郭红吕暾
- 关键词:基因调控网络递归模糊神经网络时延
- 基于递归模糊神经网络的多时延基因调控网络构建方法被引量:1
- 2012年
- 为了处理连续的时序基因表达数据,提出了一个基于递归模糊神经网络的多时延基因调控网络构建算法.该算法能直接用于分析连续的时序基因表达数据,避免离散化数据造成的信息损失.使用时序互信息估计基因间的转录时延,并限制每个基因的潜在调控基因,从而有效提高建网的效率和精确度.酵母菌细胞周期表达数据的实验结果表明该算法能正确选择潜在的调控基因,更加精确地构建基因调控网络.
- 徐赛娟郭红
- 关键词:基因调控网络递归模糊神经网络时延