陈佳林
- 作品数：5 被引量：8H指数：2
- 供职机构：中山大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金广东省自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学农业科学医药卫生更多>>
- MS-RDA的改进及在白背飞虱的应用研究被引量：4
- 2013年
- 甲基化敏感性代表性差异分析方法 (MS-RDA)适用于特异、低丰度基因组DNA甲基化的筛查与鉴定,已大量应用于哺乳动物的疾病发生和植物发育机理方面的研究,但昆虫中尚未发现该方法的应用。从DNA提取、酶切、扩增子制备、消减杂交等方面对该方法进行了改进,并在水稻重要害虫白背飞虱上得到成功应用,获得了4条与雌、雄性别相关联的特异性甲基化差异条带,其中有3条序列已被GenBank收录,登陆号分别为JX847621、JX624161、JX472453,经BLAST比对,有3条未发现同源性序列,属于功能未知的新基因;同时还获得了2条与长短翅型相关联的特异性甲基化差异条带,也已被GenBank收录,登陆号分别为JX514031、JX472454,同源性分析发现与多种动物的18S核糖体和28S核糖体RNA基因序列高度相似,因此有关核糖体基因的甲基化可能对白背飞虱的翅型分化起到一定的调控作用。
- 周晓穗陈佳林张梅王方海
- 关键词：DNA甲基化白背飞虱
- 昆虫JHE基因中与甲基化相关的CpG位点及CpG O/E值分析
- DNA甲基化主要发生在CpG位点的胞嘧啶上,且CpG位点发生甲基化以后,其甲基化的胞嘧啶容易发生突变,即由C转变为T,故CpG O/E值(CpG 位点的实际值与期望值之间的比值)与基因的甲基化水平存在一定的关联.本研究以...
- 张梅陈佳林周晓穗王方海
- 关键词：DNA甲基化CPG
- MSAP在水稻害虫白背飞虱中的应用研究被引量：6
- 2015年
- 甲基化敏感的扩增多态性分析方法 (MSAP)是在扩增片段长度多态性技术基础上建立起来的主要用来检测样品基因组DNA甲基化情况的一种方法,特别适用于全基因组范围内检测CCGG位点的胞嘧啶甲基化情况,在高等动物和许多植物上已广泛应用,但尚未有在昆虫中应用该方法的报道。从DNA提取、酶切基因组DNA用量、酶切和接头连接时间、电泳图谱显影方法等方面对MSAP方法进行了改进,并在水稻重要害虫白背飞虱上得到成功应用。这为将来在其它昆虫中使用该方法研究基因组DNA甲基化情况提供了一定借鉴和指导价值。且通过比较白背飞虱雌雄性别间和长短翅型间的MSAP图谱,发现雌雄性别间和长短翅型间的基因组DNA甲基化式样都存在明显的差异,说明DNA甲基化可能参与了性别和翅型分化的调节。
- 张梅陈佳林周晓穗梁士可李广宏王方海
- 关键词：DNA甲基化白背飞虱性别分化
- 去甲基化药物对白背飞虱生长发育的影响
- DNA甲基化是广泛存在于真核生物基因组中的一种主要的表观遗传修饰方式,参与机体的许多生物学过程,如基因组印迹、X染色体失活、染色质完整性的维持等.去甲基化药物,如胞苷类似物5-氮杂胞苷等,主要是通过特异性抑制甲基转移酶而...
- 陈佳林张梅周晓穗王方海
- 关键词：白背飞虱DNA甲基化5-氮杂胞苷生长发育
- 昆虫JHE基因结构及与甲基化相关的CpG O/E值分析
- 2014年
- 本研究选择西方蜜蜂Apis mellifera、黑腹果蝇Drosophila melanogaster、致倦库蚊Culex quinquefasciatus和家蚕Bombyx mori 4种昆虫为例,以降解保幼激素的特异性酯酶(juvenile hormone esterase,JHE)为研究对象,首先运用NCBI的Spidey在线软件将各昆虫的JHE基因与其相应的基因组序列作比对,分别确定各昆虫JHE基因的上游2000 bp的具体序列和外显子及内含子区域。发现西方蜜蜂JHE基因含有7个外显子和6个内含子,而其余三种昆虫的JHE基因均含有6个外显子和5个内含子。接着,分别统计基因各区域的CpG,G,C位点的占有量,并计算出CpG O/E值(CpG位点的实际值与期望值之间的比值),发现各区域CpG O/E平均值的大小依次为:基因上游2000 bp区>内含子区>外显子区,基因上游2000 bp区的CpG O/E平均值大于1.0,而第1到第4外显子的CpG O/E平均值均只有0.8左右。表明在昆虫JHE基因中,若有CpG甲基化位点发生,应主要发生在第1到第4外显子区域。
- 张梅周晓穗陈佳林梁士可李广宏王方海
- 关键词：DNA甲基化基因结构CPG外显子
