蒋晓虹
- 作品数:6 被引量:25H指数:3
- 供职机构:福州市疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金:福建省科学技术厅重点项目福州市科技计划项目更多>>
- 相关领域:医药卫生更多>>
- 2016-2018年福州市诺如病毒聚集性暴发疫情的病原学特性分析被引量:8
- 2020年
- 目的了解福州市2016-2018年诺如病毒(norovirus,NV)聚集性暴发疫情特点及病原学基因特性。方法将2016-2018年福州市疾病预防控制中心实验室收到的疑似NV引起的急性胃肠炎患者标本,应用实时荧光定量聚合酶链反应(quantitative real-time PCR)进行NV特异性核酸片段检测,选取部分毒株进行VP1区域基因扩增并将产物进行测序,应用分析工具进行NV的基因序列比对,绘制进化树并进行种系进化分析。结果福州市共报告NV聚集性暴发疫情46起,共采集患者标本282份,检测到阳性标本164份。其中NV GⅠ型7份,GⅡ型146份,GⅠ+GⅡ型11份。从阳性标本中选择出部分样本进行亚型分型,在21份标本中基因亚型为GⅠ.6亚型的2份,GⅡ.2亚型9份,GⅡ.3亚型4份,GⅡ.4亚型2份,GⅡ.6亚型2份,GⅡ.17亚型2份。结论2016-2018年福州市NV聚集性疫情主要由GⅡ型所致,GⅡ.2亚型为福州地区优势毒株,存在多个亚型的NV流行且具有遗传多样性。
- 姚栩蒋晓虹蒋晓虹张彩云张彩云
- 关键词:诺如病毒暴发疫情病原学基因型
- 福州市柯萨奇病毒A10型VP1区基因特征分析被引量:2
- 2016年
- 目的了解福州地区流行的柯萨奇病毒A10型(CV-A10)的VP1区基因特征及种系进化分布。方法采集临床诊断为手足口病患者的咽拭子或肛拭子样本,通过real—time PCR法确定样本的肠道病毒型别。选取部分CV—A10的临床样本,利用RD细胞进行病毒分离,RT—PCR扩增肠道病毒的VPl基因片段,并进行序列测定,利用DNAStar和MEGA5.1软件进行核苷酸和氨基酸同源性分析并构建亲缘进化树。结果检测出的1951份肠道病毒阳性样本中,肠道病毒71型(EV-A71)、柯萨奇病毒A16型(CV-A16)、CV-A10的阳性率分别为24.1%,16.7%,9.4%,不同肠道病毒阳性率差异有统计学意义。福州市CV-A10型各分离株的核苷酸和氨基酸同源性分别为94.0%~99.9%和97.7%~100.0%,与CV—A10原型株(Kowalik株)的同源性分别为76.4%~76.7%和91.9%~93.3%。亲缘进化树的分析结果显示福州地区CV-A10分离株属于D亚型。结论CV-A10是引起福州地区手足口病的常见病原体之一,本次分离到的CV—A10病毒株均属于D基因型。
- 姚栩蒋晓虹谢迺鸿张彩云关振华张晓阳
- 关键词:手足口病VP1区基因亚型
- 福州市柯萨奇A6型流行情况及VP1区基因特征分析被引量:7
- 2018年
- 目的了解福州市柯萨奇病毒A6型(Cox A6)的流行情况及VP1区基因特征及种系进化分布。方法采集临床诊断为手足口病患者的咽试子或肛拭子标本,通过real-time PCR法选取部分重症患者柯萨奇病毒A6型阳性标本,采用RD细胞分离病毒,RT-PCR扩增VP1基因片段并测序,利用DNAStar和Mega 5. 1软件进行核苷酸和氨基酸同源性分析并构建亲缘进化树。结果检出的3 237份肠道病毒阳性样本中,肠道病毒71型(EV71)、柯萨奇病毒A组16型(Cox A16)、Cox A6的阳性率分别为22. 0%、14. 4%、23. 9%,不同肠道病毒阳性率差异有统计学意义(P <0. 05)。福州市CVA6型分离株的核苷酸和氨基酸同源性分别为96. 3%~100%和97. 4%~100%,与原型株CV-A6/Gdula的同源性分别为81. 6%~83. 5%和94. 1%~95. 7%。进化树的分析结果显示,福州市Cox A6分离株属于D基因型。结论 Cox A6是引起福州市手足口病的主要病原体之一,本次分离得到的Cox A6病毒株均属于D基因型。
- 谢迺鸿姚栩陈智伟蒋晓虹张彩云张晓阳
- 关键词:手足口病VP1区基因亚型
- 福州市手足口病病原构成及肠道病毒71型VP1基因特征分析被引量:1
- 2016年
- 目的探讨福州地区手足口病(HFMD)病原谱构成及肠道病毒71型(EV71)的基因特征。方法采集临床诊断为手足口病患者的咽拭子或肛拭子标本1 235例,通过real-time PCR法确定所有标本的肠道病毒型别。获取EV71型分离株,并对VP1基因片段进行测序,利用DNAStar和Mega 5.1软件进行核苷酸、氨基酸同源性分析并构建系统发生树。结果共检测出932份肠道病毒阳性标本,其中EV71、柯萨奇A16型(Cox A16)和其他肠道病毒的阳性率分别为34.5%(426/1 235)、9.8%(121/1 235)、31.2%(385/1 235)。40株EV71型分离株的VP1基因核苷酸同源性为91.0%~100.0%,氨基酸同源性为95.0%~100.0%。40株病毒基因在系统发生树上与C4基因亚型最为相近,属于C4a基因亚型。结论 EV71是引起福州地区手足口病流行的主要病原体,EV71型病毒株均属于C4a基因亚型,与同期中国大陆EV71参考株基因型相似。
- 蒋晓虹姚栩关振华谢迺鸿张彩云张晓阳
- 关键词:手足口病肠道病毒71型VP1区
- 福州市人感染H7N9流感病毒基因特性分析
- 2018年
- 目的了解福州市人感染H7N9流感病毒基因特性及进化分布。方法对2013-2016年福州市流感监测网络实验室从监测哨点医院采集的不明原因肺炎病例中人感染H7N9流感病毒核酸检测阳性的标本进行病毒分离,选取部分H7N9禽流感病毒株进行基因组基因序列测定,使用DNAman.exe分析软件进行基因序列比对,并对病毒关键位点的氨基酸变异情况进行分析,绘制遗传进化树进行进化分布分析。结果血凝素(HA)和神经氨酸酶(NA)基因进化树分析结果显示福州市人感染H7N9禽流感病毒株与以上海、浙江为代表的长三角分支相近。7株毒株中均出现可导致宿主特异性改变、病毒传播力、致病力、毒力及复制能力增强的相关致病位点突变。病毒的HA蛋白受体结合区均发生G186V和Q226L这2个关键氨基酸位点的变异,HA蛋白裂解位点序列均为PEIPKGR↓GLF,含有2个碱性氨基酸。7株病毒的NA蛋白茎杆区69~73位氨基酸均出现缺失。病毒的M2蛋白均发生S31N突变。结论福州市人感染H7N9病毒株具有遗传多样性及复杂性,呈现致病力增强、对金刚烷胺类药物耐药等特点,在监测工作中应加强病原学的监测和遗传变异特性的研究。
- 姚栩蒋晓虹张彩云谢迺鸿陈玲玲
- 关键词:基因特征
- 福州市2014—2017年外环境标本禽流感病毒监测分析被引量:7
- 2019年
- 目的了解福州市禽类外环境禽流感病毒污染分布,为人感染禽流感流行预警和疫情防控提供依据。方法应用实时荧光定量PCR技术对2014-2017年间采集的1 612份标本进行A型及H5、H7和H9 3种亚型禽流感病毒核酸检测,分析禽流感病毒污染情况。结果 1 612份标本中,检出595份流感病毒A型核酸阳性标本,阳性率36.9%;各亚型阳性率:H9亚型为16.6%(267份)、H7为9.1%(147份)和H5为2.9%(47份),其他亚型阳性率14.0%(225份);每年第1、4季度流感病毒A型核酸阳性率最高,达21.7%~64.2%和15.4%~50.0%;宰杀或摆放禽肉案板表面标本流感病毒A型核酸阳性率最高,达52.6%。结论福州市禽类外环境中流感病毒A型污染较普遍,以H9亚型阳性率最高,混合型占一定比例,同时存在H5、H7和H9亚型之外的其它亚型,需持续监测。不同季节禽类外环境中流感病毒A型核酸阳性率有所差异,冬春季相对较高,是防控的重点。
- 张彩云姚栩陈艳陈艳蒋晓虹
- 关键词:禽流感病毒卫生监测实时荧光定量PCR