罗纯
- 作品数:13 被引量:93H指数:6
- 供职机构:中国热带农业科学院南亚热带作物研究所更多>>
- 发文基金:公益性行业(农业)科研专项广东省自然科学基金中央级公益性科研院所基本科研业务费专项更多>>
- 相关领域:农业科学生物学更多>>
- 柿EST-SSR标记在柿属植物中的通用性研究被引量:3
- 2014年
- 公共数据库和柿转录组测序产生的大量EST序列为开发新的SSR标记提供了有效资源。我们在前期利用这些数据开发出112个EST-SSR标记,此次研究选用其中11个标记对柿属(Diospyros L.)15个种20份试材进行了标记通用性检测。结果表明,所有引物均能扩增出产物,多态性引物比率达100%,并且UPGMA聚类结果可靠,说明柿EST-SSR标记在近缘种中可以通用。上述通用性标记为柿属植物遗传多样性研究提供了标记资源。
- 罗纯张青林罗正荣
- 关键词:EST-SSR标记
- 部分柿属植物TRAP标记反应体系的建立与引物筛选被引量:2
- 2014年
- 为了建立柿属植物目标区域扩增多态性(TRAP)标记技术体系,对影响TRAP-PCR的Mg2+、dNTPs、Taq DNA聚合酶、固定引物和随机引物浓度比5个因素进行了优化。确定优化的反应体系为:模板DNA 40 ng,buffer 1×,Mg2+1.4 mmol/L,dNTPs 0.2 mmol/L,固定引物和随机引物浓度比为11∶1,Taq酶0.5 U,反应总体积为15μL。利用柿属植物EST数据库信息设计锚定引物10条,与11条随机引物组合共110对引物。利用这些引物对柿属植物6个基因型进行TRAP-PCR扩增,其中84个引物组合能扩增出清晰条带,占引物总量的76.36%;36个引物组合表现出良好的多态性扩增,并在20份柿属植物中进行了引物验证。
- 罗纯吴迪张青林罗正荣
- 关键词:柿属植物TRAP反应体系优化引物筛选
- 杧果MiLCYB2基因启动子的克隆与序列分析被引量:3
- 2015年
- 【目的】了解杧果Mi LCYB2基因的表达调控规律。【方法】应用染色体步移方法克隆了991 bp的Mi LCYB2基因启动子序列。【结果】用在线软件Plant CARE分析表明,该序列除含有启动子基本元件,如TATA-BOX、CAAT-BOX外,还含有ABA、GA、Auxin、SA、Me JA多种植物激素响应元件,以及参与生理周期调控、MYBHv1结合位点和光响应元件等一些其他的调控序列,推测Mi LCYB2基因的表达受多种植物激素、光照、生理周期、MYBHv1转录因子等的调控。【结论】杧果Mi LCYB2基因启动子的分离与序列分析为进一步探究杧果类胡萝卜素基因的调控机制提供了新的理论基础。
- 许文天马小卫武红霞罗纯姚全胜周毅刚王松标
- 关键词:杧果启动子
- 基于转录组的芒果MYB家族基因的鉴定及分析被引量:7
- 2017年
- MYB家族作为植物中较大的转录因子家族之一,参与调控植物的多种生理活动。本研究基于芒果果实转录组测序结果,鉴定出71个MYB家族蛋白,其中包含1个4R-MYB蛋白、3个R1R2R3-MYB蛋白、60个R2R3-MYB蛋白和7个MYB相关蛋白。进化树及基序分析表明:除个别蛋白外,相同类型的MYB蛋白均聚在一起,且相近分支的MYB蛋白具有相同或相似的基序。60个全长MYB家族蛋白中,大部分为不稳定蛋白,且均为不含跨膜结构和信号肽的亲水性蛋白,亚细胞定位分析均定位于细胞核。进化树分析发现芒果R2R3-MYB蛋白与拟南芥有较高的保守性。R2R3-MYB蛋白保守域分析发现,R2和R3结构域均有多个氨基酸保守不变。GO分析发现芒果R2R3-MYB蛋白共注释到生物学过程、细胞组分和分子功能3大类功能的15个亚类。
- 郑斌武红霞王松标马小卫许文天罗纯姚全胜
- 关键词:芒果生物信息学
- Irwin杧果果皮着色与相关酶活性的关系被引量:2
- 2016年
- 以Irwin杧果为试材,研究外黄内黑复合纸双层果袋对生长发育过程中果皮叶绿素、类胡萝卜素、花青苷、类黄酮含量与相关代谢酶活性变化影响及相关性。结果表明,随着果实发育成熟,花青苷含量在果实发育中呈低—高—低的变化趋势。套外黄内黑双层袋显著降低了果皮叶绿素、类胡萝卜素、花青苷和类黄酮含量;PAL活性在果实发育60d就达到最高,随后降低,完熟时降至最低;CHI活性随着果实的发育成熟有所降低,DFR活性前期变化平缓,在完熟时升至最高;UFGT随果实发育成熟降至最低;外黄内黑复合纸袋显著抑制了PAL、CHI、DFR和UFGT活性。果皮花青苷、类黄酮与CHI呈极显著正相关,类黄酮与UFGT呈显著正相关。说明Irwin杧果皮着色可能是各种色素与CHI和UFGT等作用的结果。
- 武红霞许文天罗纯姚全胜王松标马小卫詹儒林
- 关键词:杧果套袋色素酶活性
- 第二代测序技术在植物遗传研究中的应用被引量:5
- 2015年
- 第二代测序技术,又称"新一代测序技术",其较Sanger测序具有通量高、测序成本低和测序时间短等特点。介绍了以454、Illumina/Solexa和SOLi D为代表的第二代高通量测序技术的基本特性及其在植物全基因组、转录组和miRNA测序等领域的研究进展,并对新一代高通量测序技术的发展趋势进行了展望。
- 罗纯张青林罗正荣
- 关键词:高通量测序转录组测序
- 不同芒果种质果实品质性状多样性分析被引量:24
- 2014年
- 对保存于中国热带农业科学院南亚热带作物研究所芒果种质圃的33份种质,采用方差分析、相关性分析和主成分分析方法,研究了芒果果实13个品质性状(可溶性固形物、可滴定酸、类胡萝卜素、果糖、葡萄糖、蔗糖、总糖、总酚、抗氧化能力、钾、钙、镁、铁)的多样性.结果表明,芒果果实品质性状变异非常丰富,变异系数在16.05% ~70.24%之间,变异幅度以铁含量最小、蔗糖含量最大.一些果实品质性状之间存在显著或极显著的相关性,但多数品质性状具有相对独立性.主成分分析表明,13个品质性状可综合为6个主成分,累积贡献率达86.63%.其中,葡萄糖、果糖、总酚、DPPH、钙、铁、钾、镁8个性状是果实内在品质的主要性状.
- 石胜友马小卫许文天周毅刚武红霞姚全胜罗纯王松标
- 关键词:芒果果实品质主成分分析
- 杧果TRAP标记反应体系的优化与引物筛选被引量:1
- 2015年
- 为了建立杧果目标区域扩增多态性(TRAP)标记技术体系,对影响该反应体系的Mg2+、dNTPs、固定引物浓度、随机引物浓度以及Taq DNA聚合酶等5个因素进行优化。确定优化的反应体系总体积为15μL,包括模板DNA 40ng、1×buffer、Mg2+1.4mmol/L、dNTPs 0.2mmol/L、固定引物0.8μmol/L、随机引物0.04μmol/L、Taq酶1.7U。利用杧果公共数据库抗病基因相关序列设计锚定引物13条,与7条随机引物组合共91对引物。利用这些引物对杧果品种进行TRAP-PCR扩增,其中66个引物组合能扩增出清晰条带,且表现出良好的多态性,占引物总量的72.53%。
- 罗纯武红霞姚全胜王松标许文天马小卫
- 关键词:杧果TRAP引物筛选
- 避雨栽培对芒果开花结果期生态因子及光合作用的影响被引量:14
- 2015年
- 【目的】探讨避雨栽培对芒果开花结果期生态因子及光合作用的影响,为我国南方多雨地区芒果高产、优质栽培提供参考依据。【方法】以避雨和露地栽培的3年生热农1号芒果为试材,采用温湿度记录仪测定其花期的温度和湿度日变化,利用光合测定系统测定其花期、果实生长期叶片的净光合速率(Pn)及其他主要生态因子的日变化,应用灰色系统理论分析芒果避雨栽培条件下不同生育阶段的净光合速率与其他主要生态因子的关联度。【结果】避雨栽培条件下,芒果花期冠层日均温度较露地高0.2~1.3℃,日均相对湿度较露地低1.7%~12.0%;花期和果实生长期的Pn与露地差别不明显;花期避雨棚内、外的光合有效辐射(PAR)和水汽压亏缺(Vp)与Pn关系最密切;果实生长期避雨棚内对Pn影响最大的是PAR和蒸腾速率(E),露地则是叶温(Tl)和气温(Ta)。【结论】避雨栽培可有效提高芒果花期冠层日均温度和降低相对湿度,对芒果光合作用无负面影响,我国南方多雨芒果产区可利用避雨设施进行芒果高产、优质栽培。
- 许文天武红霞罗纯姚全胜马小卫周毅刚王松标
- 关键词:芒果避雨栽培生态因子光合作用
- 避雨对‘热农1号’杧果果实发育和采后耐贮性的影响被引量:6
- 2015年
- 为了让避雨设施栽培进一步在杧果生产上应用,以3 a生的‘热农1号’杧果为试材,研究了避雨对杧果两性花率、果实生长发育、产量和采后耐贮性的影响。结果表明:避雨栽培下杧果平均两性花率为35.9%,显著高于对照;花穗寒害率为42.7%,比对照降低24.6%;果实平均增产75.7%,显著高于对照,且果实采后烂果率和病情指数得到有效控制;果实大小和单果质量略有降低,最终座果率、内在品质均与对照无显著差异。避雨设施栽培在南方多雨产区具有一定的应用和推广价值。
- 许文天武红霞罗纯姚全胜马小卫周毅刚王松标
- 关键词:杧果避雨果实生长发育耐贮性