刘喜冬 作品数:13 被引量:29 H指数:3 供职机构: 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所 更多>> 发文基金: 转基因生物新品种培育专项 国家自然科学基金 国家现代农业产业技术体系建设项目 更多>> 相关领域: 农业科学 生物学 经济管理 更多>>
ctsd、ctsl基因的多态性与'雪龙'黑牛胴体性状相关性研究 为了提高雪龙黑牛的胴体性状,进行新品种选育,以组织蛋白酶D、L(Cathepsin D,Cathepsin L)基因为候选基因,利用PCR-RFLP方法对114头雪龙黑牛F1代商品牛进行多态性检测,应用SAS 9.2软件... 陈晓杰 高雪 许尚忠 李俊雅 高会江 张路培 李姣 吴蒙 张立敏 陈翠 刘喜冬 周正奎 张猛 黄萌 刘利关键词:胴体性状 基于高密度SNP标记的肉牛人工选择痕迹筛查 被引量:1 2012年 近年来随着遗传改良工作的实施,人工选择大大提高了肉牛的生产性能并使其遗传基础发生巨大改变。文章基于Illumina BovineSNP50(54K)和BovineHD(770K)两款芯片数据,采用FST检验方法分析牛群的遗传分化,并筛查人工选择在牛的基因组留下的印记。通过全基因组范围内的扫描,共发现47 104个"离群"位点和3064个群体特异的人工选择"候选基因",如CLIC5、TG、CACNA2D1、FSHR等。通过基因注释对基因的生物学过程和分子功能进行富集分析。文章构建了我国肉牛的全基因组的选择信号图谱,为深入研究人工选择和理解生物进化提供线索,且研究结果也显示人工选择对基因组的影响在牛品种遗传改良中发挥了重要作用。 刘喜冬 王志鹏 樊惠中 李俊雅 高会江关键词:单核苷酸多态性 基因注释 基于高密度SNP芯片技术对中国西门塔尔牛SCD1基因与肉质性状的相关性分析 被引量:7 2012年 试验借助高密度SNP芯片技术在整个基因组范围内对223头中国西门塔尔牛群体进行基因分型,在SCD1基因上发现7个SNPs位点,对各SNP位点与西门塔尔牛肉质性状进行相关性分析。结果表明,SCD1基因的7个SNPs位点均与大理石花纹等级显著相关(P<0.05或P<0.01);A10050C、A13655G、C14790T和A15565G4个位点对剪切力影响显著(P<0.05);位点A13655G对肌内脂肪含量影响显著(P<0.05);位点A10050C、C14790T、A15565G不同基因型个体间脂肪颜色差异显著(P<0.05)。单体型分析结果显示,7个SNPs位点共构成6种单体型和14种单体型组合。单体型组合H3H6与高肌内脂肪含量极显著相关(P<0.01);单体型组合H6H6与优质大理石花纹极显著相关(P<0.01);单体型组合H4H6与高剪切力值显著相关(P<0.05);各单体型组合对肉色和脂肪颜色影响不显著。 张立敏 张猛 周正奎 刘利 刘喜冬 陈翠 陈晓杰 朱淼 袁峥嵘 李姣 许尚忠 高会江 高雪 张路培 李俊雅关键词:肉质性状 单体型 UCP3基因遗传多态性与中国西门塔尔牛生长及育肥性状的遗传效应分析 被引量:5 2012年 为了分析UCP3基因SNPs与中国西门塔尔牛生长及育肥性状的相关性。以118头中国西门塔尔育肥牛为研究材料,通过DNA测序和PCR-RFLP技术检测UCP3基因BglI酶切位点SNPs,并进行相关分析。UCP3-BglI酶切位点表现多态,且处于Hardy-Weinberg平衡状态。与部分育肥性状的相关分析表明,该位点与饲料转化率性状和平均日增重性状表现显著相关(P<0.05),其中AA基因型个体均值显著优于AB和BB基因型个体,料肉比较低,日增重较高;与部分生长性状的相关分析发现在15月龄体高、体长和胸围性状,12月龄体高性状,8月龄体长性状中UCP3-BglI多态位点差异显著,AA基因型个体表型值显著高于其他或其中一个基因型值(P<0.05);在宰后体尺性状测量性状中,UCP3-BglI多态位点对胴体长、胴体胸深和后腿宽和背膘厚性状影响显著。其中AA和AB基因型个体胴体长、胴体胸深和背膘厚性状的表型值显著高于BB基因型个体(P<0.05);在后腿宽性状中,AB个体表型值显著高于AA和BB个体(P<0.05)。初步认为,AA基因型与优良的生长育肥性状显著相关,对A等位基因的选择有利于优良性状的改良。 陈翠 张立敏 陈晓杰 刘喜冬 李姣 张路培 高会江 高雪 李俊雅 许尚忠关键词:生长性状 UCP2基因遗传多态性与西门塔尔牛生长相关性状的遗传效应分析 被引量:11 2012年 本研究旨在分析UCP2基因SNPs及其单倍型与肉牛饲料转化率和体尺等生长相关性状的相关性。以118头西门塔尔牛为试验材料,利用DNA池和PCR-RFLP方法检测UCP2基因G118A、C161T、C215G、C305T位点多态性,构建单倍型并与生长性状进行相关分析。结果表明,G118A、C161T和C305T位点均与饲料转化率显著相关(P<0.05),其中杂合个体均值显著高于纯合个体且料肉比较高,而纯合个体之间差异不显著。位点C161T和C305T对胸围和腹围发挥主要影响作用,在差异显著表型性状中,TT基因型显著大于CC基因型个体。所构建的单倍型与单个SNP分析结果较为一致。综合考虑饲料转化率、平均日增体质量、胸围和腹围,建议将C161T和C305T位点的纯合个体TT基因型作为提高肉牛生长性状的候选分子标记。 陈翠 张立敏 陈晓杰 刘喜冬 张猛 李姣 袁峥嵘 张路培 高雪 高会江 李俊雅 许尚忠关键词:UCP2 生长性状 单倍型 内蒙古敖汉旗地区基础母牛存栏量调查方案的研究 对畜禽存栏量的调查是农业统计调查的重要内容之一,其统计调查方法主要是抽样调查。本研究旨在通过实例抽样调查,拟出合适的抽样方法对全国的基础母牛存栏量进行调查估计。采用二阶PPS(sampling with probabil... 刘喜冬 王延晖 李俊雅 高会江 许尚忠关键词:分层抽样 3种不同方法对肉牛胴体性状预测能力的比较研究 2012年 本研究为了寻求一种对肉牛胴体性状预测准确性较高的方法,运用DPS数据处理系统和SAS软件比较偏最小二乘回归、GM(1,N)灰色系统和BP神经网络3种常用的预测模型对肉牛胴体性状的预测能力。选择肉牛7个宰前生长性状(体高、体长、胸围、腹围、管围、宰前活体质量、平均日增体质量),对2个重要的胴体性状(胴体质量和净肉质量)进行预测。结果表明:偏最小二乘回归方法在肉牛胴体性状预测方面准确性最高;GM(1,N)灰色系统和BP神经网络预测准确度偏低。本研究还将3种预测结果相结合,取其均值,大大提高了预测的准确性。这一研究将为肉牛生产实践提供一定的科学参考。 张立敏 张猛 周正奎 刘喜冬 陈翠 陈晓杰 李姣 袁峥嵘 高雪 高会江 许尚忠 李俊雅关键词:偏最小二乘回归 BP神经网络 胴体性状 垂体特异性转录因子1基因遗传多态性与中国西门塔尔牛生长及育肥性状的遗传效应分析 被引量:1 2012年 本研究旨在分析垂体特异性转录因子(Pit-1)基因SNPs与中国西门塔尔牛生长和育肥性状的相关性。试验以118头中国西门塔尔牛为材料,利用DNA测序和PCR-RFLP方法检测Pit-1基因HinfⅠ酶切位点多态性,并进行相关分析。结果表明,HinfⅠ酶切位点与料重比和平均日增重性状呈显著相关(P<0.05),其中BB基因型个体显著优于AA基因型个体,饲料转化率较低,平均日增重较高;在8、15月龄体高性状,12、15月龄体长性状,8、12、15月龄胸围性状和8月龄腹围性状中,HinfⅠ酶切位点多态差异显著,BB基因型个体表型值显著高于AA基因型(P<0.05);在宰后体尺性状测量性状中,Pit-1基因HinfⅠ多态位点对胴体长、胴体胸深和腰部肉厚性状影响显著,其中BB基因型个体表型值显著大于AA和AB基因型个体(P<0.05)。初步认为,BB基因型与优良的生长育肥性能显著相关,对B等位基因的选择有利于优良性状的改良。 陈翠 张立敏 陈晓杰 刘喜冬 李姣 张路培 高雪 高会江 李俊雅 许尚忠关键词:生长性状 内蒙古敖汉旗地区基础母牛存栏量调查方案的研究 被引量:1 2012年 对畜禽存栏量的调查是农业统计调查的重要内容之一,其统计调查方法主要是抽样调查。本研究旨在通过实例抽样调查,拟出合适的抽样方法对全国的基础母牛存栏量进行调查估计。采用二阶PPS(sampling with probability proportionalto size)抽样、分层等比例抽样、分层二阶典型抽样对内蒙古敖汉旗肉牛存栏量进行调查,比较3种方法的准确度。结果表明,在此3种方法10%的样本量下进行比较时,3种抽样方法按相对误差大小顺序排列为:分层二阶典型抽样<分层等比例抽样<二阶PPS抽样,其相对误差分层二阶典型抽样比分层等比例抽样、二阶PPS抽样分别小60.38%、92.83%;置信区间按大小顺序排列为:分层二阶典型抽样<分层等比例抽样<二阶PPS抽样。总体而言,分层二阶典型抽样的准确度相对较高,相对误差最小,仅为0.0412。故在实际应用当中,分层二阶典型抽样目前较为适用。 刘喜冬 王延晖 高会江 许尚忠 李俊雅关键词:分层抽样 内蒙古敖汉旗地区基础母牛存栏量调查方案的研究 对畜禽存栏量的调查是农业统计调查的重要内容之一,其统计调查方法主要是抽样调查[1]。本研究旨在通过实例抽样调查,拟出合适的抽样方法对全国的基础母牛存栏量进行调查估计。采用二阶PPS(sampling with proba... 刘喜冬 王延晖 李俊雅 高会江 许尚忠关键词:分层抽样 文献传递