宋虎
- 作品数:3 被引量:4H指数:1
- 供职机构:西南民族大学生命科学与技术学院更多>>
- 发文基金:国家科技支撑计划中央高校基本科研业务费专项资金更多>>
- 相关领域:农业科学生物学更多>>
- 麦洼牦牛Hoxa10基因克隆、原核表达及组织表达谱被引量:3
- 2013年
- 从麦洼牦牛肾脏组织提取总RNA,以已公布牛Hoxa10编码区序列设计引物,RT-PCR法克隆麦洼牦牛Hoxa10基因;构建原核表达载体pET-32a(+)-Hoxa10,并在大肠杆菌表达系统中表达,SDS-PAGE检测融合蛋白;采用RT-PCR检测该基因在麦洼牦牛各组织中的表达分布。结果表明:从麦洼牦牛肾脏中克隆Hoxa10基因的CDs区,大小为285bp,编码94个氨基酸残基,与牛、猪和绵羊的Hoxa10同源性高;经IPTG诱导,pET-32a(+)-Hoxa10在BL21中可表达1个大小约为28ku的特异蛋白;在牦牛各组织中,肾脏和肺脏中表达较高,但在心脏表达量极低或不表达。
- 李宇熊显荣兰道亮宋虎李键
- 关键词:HOX基因表达谱原核表达麦洼牦牛
- 麦洼牦牛HOXA6基因编码区的克隆、组织表达特征及生物信息学分析被引量:1
- 2013年
- 利用分子克隆技术成功获得麦洼牦牛HOXA6基因编码区序列,并结合内参基因通过实时相对定量PCR法检测HOXA6基因在麦洼牦牛各组织中的表达分布。采用生物信息学方法对该基因及其编码的蛋白进行基本理化性质、疏水性、二级结构等分析,并构建原核重组表达系统。结果表明,该基因包含一个大小为702 bp的开放阅读框,编码233个氨基酸;所编码的蛋白属于亲水性蛋白,二级结构主要由无规则卷曲和α螺旋为主。HOXA6基因的编码产物氨基酸进化树表明,HOXA6基因进化极其保守,牦牛HOXA6与牛、绵羊、马等物种氨基酸遗传距离较近。对其编码区序列比对显示,该序列具有高度保守性,与其他物种同源性较高。
- 李宇熊显荣宋虎李键
- 关键词:麦洼牦牛克隆生物信息学分析
- 麦洼牦牛NPM1基因的克隆及生物信息学分析
- 2014年
- 采用分子克隆技术获得麦洼牦牛NPMl基因编码区序列,并通过普通PCR法检测NPM1基因在麦洼牦牛各组织中的表达分布,同时采用生物信息学方法对该基因及其编码蛋白的基本理化性质进行预测分析。结果表明:麦洼牦牛NPM1基因包含一个长度为885bp的开放阅读框,编码294个氨基酸,与普通牛NPM1基因序列的的同源性为99.4%,且与家犬(93.1%)、人(93.2%)也有较高同源性。根据DNAStar翻译出氨基酸序列,发现麦洼牦牛NPM1基因编码氨基酸序列第239位和261位发生了突变,分别由R变为K和L变为P;所编码的蛋白属于亲水性蛋白,二级结构主要有α-螺旋和无规卷曲;Interpro在线工具对牦牛NPM1基因编码蛋白进行结构域预测,第12~118位间有完整的核质蛋白核心结构域。系统进化树表明麦洼牦牛与黄牛、家犬及人遗传距离最近。
- 宋虎熊显荣李宇李键
- 关键词:麦洼牦牛克隆生物信息学分析