杨洪乾
- 作品数：4 被引量：8H指数：2
- 供职机构：中国药科大学生命科学与技术学院更多>>
- 相关领域：生物学医药卫生更多>>
- 蛋白质侧链预测研究进展被引量：1
- 2010年
- 蛋白质侧链构象的准确预测很大程度上决定了建模的质量以及利用计算机手段进行未知蛋白质准确预测的可行性。综述蛋白质侧链构象预测的研究进展,介绍蛋白质侧链构象的基本概念、侧链预测的基本过程、旋转异构体库的发展以及侧链预测软件的应用。
- 郭城杨洪乾方慧生
- 关键词：蛋白质侧链构象二面角
- 人类CCR5三维结构的同源模建被引量：3
- 2012年
- 趋化因子受体(Chemokine receptor)是GPCR(G-protein coupled receptors)的超级家族成员,在各种免疫反应中有着重要的作用。CCR5是CC亚族趋化因子RANTES,MIP-1a,和MIP-1b的特异性受体。该文采用同源模建的方法,并通过胞外环区优化,动力学优化和能量最小化的方法初步得到了一个较为合理的CCR5的结构模型。说明该文采用的模建流程方法,在跨膜蛋白的同源模建中有着重要的作用,能给实际工作带来很好的指导作用。
- 张莹杨洪乾李娟方慧生
- 关键词：趋化因子受体同源模建
- α-螺旋跨膜蛋白结构预测的研究进展被引量：3
- 2010年
- 在基因组数据中,有20%～30%的产物被预测为跨膜蛋白,但由于实验测定的困难,在PDB数据库中只有1%左右的跨膜蛋白结构。跨膜蛋白结构的缺乏,以及跨膜蛋白重要的生理功能,使得通过计算生物学的方法来获得新的结构显得尤为重要。这些方法主要涉及的内容有:膜蛋白跨膜片段和拓扑结构的预测分析,同源模建,从头预测等。在对前者的预测中,目前的预测方法都具有很好的预测精度,主要难点集中在后两者中。文章综述了近些年来跨膜蛋白结构预测的研究进展,并对目前流行的方法进行了介绍。
- 杨洪乾郭城方慧生
- 关键词：跨膜蛋白Α-螺旋拓扑结构
- 抗HIV微生物药物的筛选模型研究进展被引量：1
- 2010年
- 获得性免疫缺陷综合征(AIDS)是人类尚未攻克的一道难题,至今还没有根治的药物。本文主要对近年来的抗HIV微生物药物的筛选模型进行综述,主要介绍的是分子水平上的筛选模型。从药物作用靶位(包括逆转录酶、蛋白酶、gp120与CD4特异结合、HIV自身调控因子(Tat-TAR)、DNA的链转移、CC趋化因子受体、检测方法等方面进行概述。
- 杨洪乾方慧生顾觉奋
- 关键词：HIV微生物药物作用靶位抑制剂
