龚攀
- 作品数：8 被引量：21H指数：4
- 供职机构：中国农业科学院北京畜牧兽医研究所更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家现代农业产业技术体系建设项目国际科技合作与交流专项项目更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 鉴定紫花苜蓿MsPDS基因的VIGS沉默体系及其构建和鉴定方法
- 本发明公开一种鉴定紫花苜蓿MsPDS基因的VIGS沉默体系、应用及鉴定方法，涉及生物技术领域，所述VIGS沉默体系具有如SEQ ID NO.1所示的基因序列，是利用加入了酶切位点的特异性引物扩增的紫花苜蓿cDNA片段及V...
- 王赞龚攀刘希强王学敏高洪文
- 文献传递
- 一种启动子及其应用
- 本发明公开一种启动子，涉及植物分子生物学领域。其具有如SEQ ID NO：1‑5所示的任意一种核苷酸序列，本发明还涉及含有上述启动子的载体和重组细胞，以及启动子用于调控植物目的基因表达的用途。
- 王赞龚攀金含刘希强高洪文
- 文献传递
- 一种紫花苜蓿原生质体的制备方法
- 本发明公开了一种紫花苜蓿原生质体的制备方法，涉及生物技术领域，包括选择生长状况良好未开花的紫花苜蓿叶片作为制备原生质体的材料；将制备原生质体的材料进行预处理，得到具有多个叶条的叶片；将所述具有多个叶条的叶片进行酶解处理，...
- 王赞龚攀贾聪俊王学敏高洪文
- 文献传递
- 紫花苜蓿不同发育时期次生壁合成调控的转录组分析被引量：6
- 2018年
- 【目的】探讨紫花苜蓿次生壁合成的基因网络调控变化和表达模式,确定一些关键候选基因和转录因子,为紫花苜蓿次生壁加厚调控网络的分子机制研究奠定基础。【方法】对‘中苜1号’紫花苜蓿分枝期(S1)、现蕾期(S2)、初花期(S3)和盛花期(S4)的茎进行近红外光谱法测定次生壁主要物质含量和Illumina Hi SeqTM2500高通量转录组测序。以紫花苜蓿的近缘物种蒺藜苜蓿(Medicago truncatula)基因组作为参考基因组进行序列比对并组装构建转录本。利用FPKM法计算基因表达量,以Fold change(差异表达倍数)≥2或≤0.5(表达上调或下调)、FDR(false discover rate)≤0.05为筛选条件,在3个相邻时期转录组比较组合中(S2VS S1,S3 VS S2,S4 VS S3)筛选差异表达基因。通过Gene Ontology数据库和KEGG Pathway数据库对紫花苜蓿不同发育时期差异表达基因的功能和参与的代谢途径进行注释。【结果】共获得41 734个基因在紫花苜蓿不同发育时期的转录表达情况,27个功能注释与紫花苜蓿纤维素、木质素合成密切相关的基因差异表达,其变化趋势与纤维素和木质素含量测定结果基本一致,即随着生长发育时期的变化,表达水平逐渐提高。研究表明,初花期是紫花苜蓿次生壁合成调控的转折期,纤维素和木质素含量与其合成基因表达量在初花期均显著提高。MTR_2g016630(Ces)和MTR_7g103590(Ces A1)等纤维素合成酶基因表达水平在初花期显著上升,木质素合成途径中,MTR_1g064090(PAL1)、MTR_1g111240(C4H)和MTR_2g104960(CCR)基因表达量在初花期或盛花期相比分枝期上调表达倍数达到10倍以上。本研究中27个与植物生长发育相关的转录因子在紫花苜蓿不同发育时期差异性表达,其中NAC家族和MYB家族转录因子有18个,也有少量WRKY、BHLH、ERF、C3H等转录因子。【结论】获得‘中苜1号’紫花苜蓿在4个生长发育时期茎的基因表达谱数据,共获得54个差
- 刘希强张涵龚攀宫文龙王赞
- 关键词：紫花苜蓿发育时期次生壁转录因子
- 沙打旺EST-SSR分子标记开发及其遗传多样性分析被引量：4
- 2019年
- 沙打旺是一种高产优质、抗逆性强的多年生异花授粉豆科牧草,但分子标记的缺乏限制了其在遗传育种等方面的研究和利用。本研究旨在开发大量沙打旺EST-SSR分子标记,为沙打旺种质改良和遗传多样性分析提供参考资源。首先利用De novo转录组测序技术对两个沙打旺种质(CF019650, CF020070)进行RNA-seq测序,并对测序数据进行拼接获得总长度为190587631 bp的151516个unigenes。进一步在其中的30262个unigenes中检测到39163个EST-SSR位点,SSRs分布频率为25.85%。其中6635 (21.93%)条unigenes含有两个及以上SSR位点,复合SSRs有3514个(11.61%)。对所有EST-SSR位点进行引物设计,共得到22367对特异性引物。利用两个沙打旺种质(CF019650, CF020070)对随机合成的100对引物进行初步筛选,其中90对可扩增出目的特异性条带。随机选择其中51对引物对27个沙打旺种质的遗传多样性进行评估,结果表明:51对引物的平均等位基因数、平均多态性信息含量(PIC)、平均期望杂合度(He)和平均观测杂合度(Ho)分别为8.750、0.682、0.719和0.730。主成分及聚类分析结果揭示不同生态型(匍匐或直立)沙打旺种质的遗传分布具有明显的种质特异性,且聚类结果与其地理来源之间具有较高的相关性。新开发的EST-SSR分子标记可促进沙打旺遗传改良和基因组学研究,有助于沙打旺分子标记辅助育种、QTL定位和遗传变异分析。
- 宫文龙王赞赵桂琴马琳韦宝龚攀刘希强
- 关键词：沙打旺EST-SSR转录组
- 一种紫花苜蓿原生质体的制备方法
- 本发明公开了一种紫花苜蓿原生质体的制备方法，涉及生物技术领域，包括选择生长状况良好未开花的紫花苜蓿叶片作为制备原生质体的材料；将制备原生质体的材料进行预处理，得到具有多个叶条的叶片；将所述具有多个叶条的叶片进行酶解处理，...
- 王赞龚攀贾聪俊王学敏高洪文
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- 紫花苜蓿赤霉素受体基因的克隆及表达分析被引量：7
- 2016年
- 赤霉素受体(GID)是赤霉素信号转导途径的重要成员,直接影响着赤霉素对植物体效应的发挥。该研究利用同源克隆的方法,首次从紫花苜蓿中克隆得到1个赤霉素受体基因,命名为MsGID1b。序列分析发现,MsGID1b基因开放阅读框长度为1 053bp,编码350个氨基酸,推测其蛋白质分子量为39.839kD,是一个无信号肽和跨膜结构的亲水性蛋白。序列比对结果表明,MsGID1b基因与蒺藜苜蓿MtGID1b基因的核苷酸序列相似性为98%,氨基酸序列相似性为99%,且具有HSL家族典型的HGG和GXSXG保守结构域及GA、DELLA蛋白结合位点。荧光定量PCR分析表明,MsGID1b基因在紫花苜蓿各组织中的表达丰度依次为:根>盛花>初花>茎>叶>荚果;经GA3、ABA、NaCl、PEG和黑暗诱导后该基因表达上调,尤其是在GA3诱导下,MsGID1b基因的表达量一直维持在较高水平,表明MsGID1b基因可能参与紫花苜蓿的抗逆调控。
- 陈敏马琳贾聪俊刘希强龚攀王赞
- 关键词：紫花苜蓿同源克隆
- 紫花苜蓿花青苷合成的转录组分析被引量：4
- 2021年
- 为探究紫花苜蓿(Medicago sativa)花色形成的分子机制,本试验以紫花苜蓿及其白花突变体为研究材料,进行转录组测序。结果表明:紫花和白花之间共有差异表达基因4857个;代谢通路富集分析中,苯丙氨酸生物合成途径等6条代谢通路显著富集;研究还发现类黄酮合成通路中关键基因二氢黄酮醇4-还原酶(Dihydroflavonol 4-reductase,DFR)在白花突变体中的表达量显著下调,其启动子中存在MYB和bHLH等转录因子的结合位点;转录组以及荧光定量PCR的结果均表明:MYB,bHLH和WD40等基因的表达量都具有显著性差异。这些结果表明MYB转录因子或MBW复合物可能通过调控DFR的转录影响紫花苜蓿花色形成。本试验为探明紫花苜蓿花青苷合成的分子机制提供了理论基础。
- 潘新怡史昆龚攀韦宝吴欣明王赞
- 关键词：紫花苜蓿转录组花青苷转录调控
