周波
- 作品数：3 被引量：12H指数：2
- 供职机构：国际水稻研究所更多>>
- 发文基金：湖南省自然科学基金国家高技术研究发展计划湖南省农业科学院科技创新项目更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 水稻抗稻瘟病基因的复等位分布特征及其在基因挖掘中的应用被引量：8
- 2015年
- 稻瘟病是制约水稻稳产的重要病害之一,寄主抗病基因的利用是稻瘟病防控最经济和有效的手段。迄今为止,水稻中已经克隆了27个抗稻瘟病基因,从它们在水稻基因组中的位置分布来看,这27个抗病基因分布于14个遗传座位,意味着每个遗传座位平均分布约2个等位基因;从等位基因的序列同源性来看,位于同一遗传座位的复等位基因的序列呈现高度一致。进一步分析发现,相对于有功能的抗病基因,有些感病材料的等位基因呈现为典型的序列突变导致的假基因化,或者表现为明显的序列或结构差异。稻瘟病抗病基因的复等位分布特征,为同源克隆,尤其是等位基因挖掘提供了非常好的参考信息。对目前稻瘟病抗性基因的克隆进展、抗病基因的结构分类和它们在染色体中的位置进行了阐述和讨论,同时介绍了基于复等位基因分布特征的等位基因挖掘技术在抗病基因克隆中的应用,并进行了实例介绍和前景分析。
- 朱小丽陶跃之周波
- 关键词：稻瘟病抗性基因复等位基因
- 菲律宾稻瘟病菌生理小种中AVR-Pita及其同源基因的序列与功能分析被引量：3
- 2018年
- 根据已克隆的AVR-Pita及其同源基因序列设计4对引物,对来自菲律宾的74个稻瘟病单孢菌株DNA进行PCR扩增和序列分析,研究了与水稻抗病基因Pi-ta互作的稻瘟病菌无毒基因AVR-Pita及其同源基因序列多态性与进化关系。结果显示,在42个菌株中扩增出AVR-Pita1基因目的条带,31个菌株中扩增出AVR-Pita3基因目的条带,55个菌株中扩增出AVR-Pita4基因目的条带,但所有供试菌株均未扩增出AVR-Pita2基因目的条带。对PCR产物进行测序分析,发现AVR-Pita1基因在菲律宾的生理小种中存在序列多态性,可划分为5个单倍型,共有10个多态性位点;AVR-Pita3和AVR-Pita4基因序列较保守,序列比对后没有发现多态性。对不同单基因系接种鉴定,发现除第3种AVR-Pita1单倍型外,含有AVR-Pita1单倍型1、2、4及5的生理小种均不能与Pi-ta基因互作,从而使Pi-ta单基因系IRBLta-CT2在接种后表现为感病。以上试验结果说明AVR-Pita1基因变异性较强,且序列改变后会导致基因功能的变化。
- 甘玉姿肖贵邓启云吴俊柏斌卢向阳周波
- 关键词：稻瘟病菌功能分析
- 水稻稻瘟病抗性基因Pik-2的遗传变异及进化分析被引量：1
- 2020年
- Pik位点是水稻第11染色体上稻瘟病抗性基因成簇分布的热点区域,对该位点抗性基因在水稻品种中多样性分布的研究,有助于揭示该基因的进化规律和进一步挖掘其等位基因。对来自不同国家和地区的400份非洲稻和400份亚洲稻稻种抗稻瘟病基因Pik-2编码区序列进行了测序分析,发现非洲稻和亚洲稻品种Pik-2编码区碱基变异非常丰富,非洲稻种中出现了113个变异位点,亚洲稻种中有78个碱基位点发生多样性变异,其中两者均在1879位点显示出极高的变异频率;根据其碱基变异特点,非洲稻种和亚洲稻种分别呈现出17和12种单倍型。单倍型的地区分布研究显示,非洲稻的分布呈现出大聚集、小分散的特点,而亚洲稻的分布来源就显得非常广泛。不同单倍型的系统进化分析表明,大多类群中同时包含非洲稻与亚洲稻的单倍型,暗示非洲稻与亚洲稻在相互独立的进化过程中在Pik-2 LRR结构域各自形成了相似的单倍型。
- 牛玉芳肖贵吴俊柏斌周波周波
- 关键词：稻瘟病抗病基因
