马云龙
- 作品数:1 被引量:10H指数:1
- 供职机构:中国农业大学动物科学技术学院农业部动物遗传育种与繁殖重点实验室更多>>
- 发文基金:教育部留学回国人员科研启动基金国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:农业科学更多>>
- 利用高密度SNP检测不同猪品种间X染色体选择信号被引量:10
- 2012年
- 在家猪的培育过程中,许多重要的经济性状受到过高强度的人工选择,高密度SNP标记为通过选择信号检测追踪这些性状经历的选择提供了可能,并能根据选择信号利用生物信息学寻找到与选择相关的基因。X染色体由于其特殊性,在传统的遗传分析中许多针对常染色体的方法往往不适用,需要采取特殊的方法,选择信号检测可以作为一种行之有效的方法对X染色体进行分析。文章利用长白、松辽黑猪和大白3个猪品种,通过品种间选择信号检测方法 XP-EHH,利用高密度SNP标记对X染色体进行选择信号检测,并通过生物信息学分析寻找选择信号区域内重要基因。在长白、松辽黑猪和大白3个品种中分别检测出29、13和15个选择信号区域,每个选择信号区域平均包含3.59、4.92、4.07个SNPs,长白和松辽黑猪、长白和大白有部分重叠选择信号区域,大白和松辽黑猪没有发现重叠选择信号区域。生物信息学分析发现各品种选择信号区域内有与繁殖、免疫等性状相关基因,其中部分在猪中尚未见报道,可作为研究猪相关性状的重要候选基因。
- 马云龙张勤丁向东
- 关键词:X染色体