计美珍
- 作品数：1 被引量：17H指数：1
- 供职机构：内蒙古工业大学理学院更多>>
- 发文基金：内蒙古自治区自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学更多>>
- 蛋白质磷酸化位点的识别被引量：17
- 2011年
- 磷酸化是蛋白质重要的翻译后修饰之一,磷酸化位点的理论识别是计算生物学的重要研究内容。磷酸化位点附近存在保守残基片段,而这种保守性又与激酶类型相关。选择注释数据相对较多的CK2,PKA和PKC三种激酶催化的磷酸化位点作为研究对象,以序列组分特征,残基位置特异性特征和残基的非近邻关联特征为参数,采用延森-香农离散量(Jensen-Shannon Divergence,JSD)作为各特征差异度量,再使用二次判别分析算法组合不同特征,对磷酸化位点进行预测。对CK2,PKA和PKC三种激酶磷酸化位点7-fold交叉检验,总精度分别达到了90%,90%和86%,这一结果要好于当前其它预测模型。
- 白海艳吕军张颖计美珍秦丹丹
- 关键词：二次判别分析
