蓝洋
- 作品数：3 被引量：19H指数：2
- 供职机构：重庆师范大学生命科学学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金重庆市教育委员会科学技术研究项目更多>>
- 相关领域：生物学更多>>
- R语言在生物科学研究绘图中的应用被引量：15
- 2019年
- R语言具有强大的数据分析处理和可视化绘图功能,可以在Window、Linux以及Mac系统上使用,并且根据其编写新代码或调整已有代码可轻松实现科研中数据呈现与图形绘制的要求.然而其代码学习较为艰难、R-package使用复杂,所以未受到科研新手的青睐.基于生物科学相关领域的背景,整理汇集已出版的文献、公共数据库以及国家统计局中提供的数据,使用R语言、R编辑器RStudio并载入相关的R-package绘制出地图、热图、关联网络图、韦恩图和柱形图等高质量的图片,并提供相应的脚本与说明,以方便生物科研人员直接更改使用.本研究对生物科研中合理、直观地表述研究结果提供了良好的范例,并进行了详细讨论,且与其他绘图软件作了比较,以期R语言能够成为生物科学领域科研工作者入门学习、研究应用中绘制图片的首选工具.
- 蓝洋何秀朱诚勖张玉娟
- 关键词：地图韦恩图R语言
- 化学计量基因组学研究进展
- 2017年
- 化学计量基因组学是一个新兴的研究领域,研究基因组、转录组、蛋白质组及代谢组等组学数据中生物大分子的元素使用偏好。不同生物大分子的元素组成与数量不同,当元素供应受到限制,自然选择偏好性利用某些单体(氨基酸或核苷酸)来合成生物大分子(DNA、RNA和蛋白质等),从而减少元素成本。随着高通量测序技术和组装技术的大量应用,越来越多的宏基因组、宏转录组数据被公开报道,以及新的分析手段的应用,使得该领域蓬勃发展。作为一门新兴的交叉学科,化学计量基因组学整合了化学计量学、生态学、进化生物学、基因组学和生物信息学,为研究分子进化和生态系统的互作以及后基因组时代数据的挖掘提供了一个全新的视角。本文从蛋白质和核酸的元素使用偏好性方面综述了化学计量基因组学的最新研究成果,并探讨了新的研究方向,以期为该领域的研究和应用提供有益参考。
- 蓝洋胡江涛张玉娟
- 关键词：物种分类
- 我国昆虫学领域研究竞争态势分析——基于2009—2016年国家自然科学基金的视角被引量：4
- 2019年
- 基于2009-2016年昆虫学受国家自然科学基金资助的情况,构建昆虫学竞争力指数(ENCI)和综合竞争力指数(EBRCCI)两个计量公式,基于R语言分析和数据可视化中国内地各省市及依托单位间的昆虫学基础研究竞争力,并用CiteSpace知识图谱分析各研究单位文献产出.结果表明,昆虫学受自然科学基金资助整体良好,但各子学科资助不均衡,其中昆虫系统及分类学和昆虫生理生化优势明显;而从省市视角上来看各省市的基础研究竞争力不平衡;依托单位层面,"核心"和"重点"单位受资助力度更大;各依托单位受资助力度与文献产出存在正相关.通过量化探究中国内地各省市及依托单位间的昆虫学基础研究竞争力水平,该研究明晰了昆虫学的整体研究态势、分支学科情况、省市与依托单位差异,并可为昆虫学热点研究与政策扶持提供参考意义.
- 肖续杨娜蓝洋张可张玉娟
- 关键词：国家自然科学基金昆虫学
