刘洪
- 作品数：2 被引量：5H指数：2
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- 发文基金：上海市科技兴农重点攻关项目上海市基础研究重大（重点）项目上海市自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 草莓钙依赖蛋白激酶基因的克隆与表达分析被引量：2
- 2011年
- 以EST测序结合RACE技术,从久香草莓的茎尖中分离得到一个新基因,BLASTX分析显示这是一个钙依赖蛋白激酶编码基因,与GenBank中的FaCDPK1同源,命名为FaCDPK2,GenBank登录号为HQ829293.采用半定量RT-PCR对FaCDPK2基因在不同组织中的表达分析表明,FaCDPK2全长3 775 bp,读码框1 659bp,由12个外显子组成,编码552个氨基酸残基,在第89-349位是保守的蛋白激酶结构域,C端含4个EFhand钙结合域.该基因编码蛋白与拟南芥CPK28序列一致性为86.25%,与草莓FaCDPK1序列一致性为43.99%.表达分析显示该基因表达范围较广,在所分析的七种草莓组织材料中,以花中表达水平最高,在果实中的表达可能受成熟的诱导.
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- 关键词：克隆基因结构进化树RT-PCR
- 生长素合成相关基因YUC1和YUC2在两种倍性草莓中的比较被引量：3
- 2013年
- 【目的】为了研究FMO酶编码基因在草莓生长发育过程中的可能功能,【方法】以二倍体森林草莓‘黑龙江3号’为材料,基于八倍体栽培草莓‘久香’中已克隆基因序列,利用同源克隆技术获得了2个FMO酶编码基因:FvYUC1和FvYUC2基因;并运用DNAMAN软件和RT-PCR技术,分析比较了同源YUC基因在这两种倍性草莓中的分子特征和表达模式特征。【结果】同源性分析结果表明:在两种倍性草莓中YUC1氨基酸序列的一致性为99.31%,YUC2为99.02%;FvYUC1和FvYUC2之间的序列一致性为60.82%。定量RT-PCR分析表明,YUC1和YUC2在栽培草莓和森林草莓的各个组织中均表达,但表达模式差异很大,YUC1的优势表达组织在森林草莓中是幼叶、在栽培草莓中是根;而YUC2在森林草莓中的优势表达组织是匍匐茎,在栽培草莓中是小绿果。【结论】森林草莓和栽培草莓中存在高度保守的YUC同源基因,但它们在这两种倍性草莓中的主要功能可能有较大变异,将森林草莓功能基因研究结果推导至栽培草莓必须谨慎。
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- 关键词：同源克隆
