陈振玺
- 作品数：7 被引量：12H指数：2
- 供职机构：中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所更多>>
- 发文基金：中央级公益性科研院所基本科研业务费专项福建省自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学农业科学轻工技术与工程化学工程更多>>
- 入侵植物假臭草ITS序列分析被引量：1
- 2013年
- 对来自海南、广东和福建的12个假臭草居群54个样本的内转录间隔区Internal transcribed spacer(ITS)序列变异进行检测。结果共发现12个单倍型,且所有居群均共享一个单倍型。分子差异性分析(AMOVA)显示,居群内的遗传变异小(-4.57%),遗传分化低(G ST=-0.061,FST=-0.04569,NST=-0.031),无明显的谱系结构(N ST>GST,p>0.01),且居群间平均基因流(Nm=1.18>1)高,说明假臭草居群内基因交流频繁。ITS序列的失配曲线表明假臭草近期发生过多次入侵扩张,对假臭草的防治应遵循检疫与治理并重的原则,降低其对入侵地的生态环境危害。
- 王奇志黄敏陈振玺邱宠华龙瑞敏
- 关键词：假臭草内转录间隔区
- 杧果FPPS基因的鉴定和序列分析
- 2016年
- 法尼基焦磷酸合成酶(Farnesyl Pyrophosphate Synthase,FPPS,EC∶2.5.1.1)是倍半萜合成中的一个关键酶,在植物萜类合成过程中有关键作用。以杧果FPPS基因为研究对象,以拟南芥FPPS基因为参考,通过BLAST方法从番木瓜、金钱橘、甜橙、苹果、小果野蕉、桃子、白梨、葡萄、中华猕猴桃、无油樟基因组数据中获得了FPPS基因,共19条FPPS基因序列,对其进行了系统进化分析和生物信息学分析。系统进化结果显示:双子叶植物纲果树与单子叶植物纲果树关系较远,同是双子叶植物纲的果树关系较近,同科果树亲缘关系更近。生物信息学分析结果显示:氨基酸序列中,酸性蛋白占94.7%,稳定性蛋白占84.2%,有信号肽的蛋白占5.3%,有导肽的蛋白占10.5%,所有蛋白均为有明显跨膜现象的亲水性蛋白;所有FPPS基因亚细胞定位于线粒体中,均有蛋白活性位点。
- 盖江涛朱敏党志国陈华蕊陈振玺王鹏
- 关键词：杧果萜类系统进化生物信息学
- 在基因家族背景下对四种植物中DGAT2的鉴定和序列分析被引量：4
- 2015年
- 二酰甘油酰基转移酶2(Diacylglycerol O-acyltransferase 2,DGAT2)是植物中三羧酸甘油酯(TAG)合成途径的限速酶,其编码基因属于酰基转移酶基因超家族。本研究依托植物全基因组数据库Phytozome,通过BLAST搜索获得了蓖麻(Ricinus communis L.)、拟南芥(Arabidopsis thaliana Heynh.)、毛果杨(Populus tricho-carpa Torr.&A.Gray.)和木薯(Manihot esculenta Crantz.)4种双子叶植物酰基转移酶基因超家族所编码的73条多肽序列,并从中鉴定出5条DGAT2序列。理化性质和跨膜结构域分析表明,5条DGAT2序列均为疏水性跨膜蛋白,其中木薯DGAT2为一次跨膜蛋白且在叶绿体膜中大量分布,这与其他植物的DGAT2序列存在差异;木薯DGAT2蛋白在进化过程中发生了功能分化且可能与木薯的抗逆作用有关。
- 陈振玺王鹏盖江涛王奇志
- 关键词：DGAT2三酰甘油限速酶基因家族
- 植物油脂生物合成基因挖掘
- 油脂是植物中的能量储存物质,也是人类营养的重要来源。近年来,一些特殊结构的植物油脂因可以作为工业原料和生物能源物质,而受到生化学界的广泛关注。在植物种子等组织或器官中,三羧酸甘油酯(triacylglycerol,TAG...
- 王鹏陈振玺盖江涛
- 植物油脂生物合成基因挖掘
- 油脂是植物中的能量储存物质,也是人类营养的重要来源.近年来,一些特殊结构的植物油脂因可以作为工业原料和生物能源物质,而受到生化学界的广泛关注.在植物种子等组织或器官中,三羧酸甘油酯(triacylglycerol,TAG...
- 王鹏陈振玺盖江涛
- 关键词：植物油脂生物合成基因
- 文献传递
- 茄科植物PAL基因家族的鉴定和序列分析被引量：7
- 2015年
- 苯丙氨酸解氨酶(PAL,phenylalanine ammonia-lyase[EC:4.3.1.24])是植物次生代谢尤其是苯丙烷途径的关键酶,与植物抵抗病原菌入侵密切相关,具有重要的植物生理学意义;其催化产物是辣椒素等植物天然产物的前体。采用BLASTP方法,依托全基因组数据库,获得了番茄、马铃薯、本氏烟草、辣椒等4种茄科植物及杨树、拟南芥的PAL基因家族成员共27条序列,并对其进行初步的生物信息学分析、理化性质分析及结构分析。结果表明:在进化过程中,茄科植物烟草、番茄、马铃薯和辣椒的亲缘关系较近,拟南芥、杨树与茄科植物的亲缘关系较远;酸性蛋白质占96.3%,所有蛋白均为亲水性稳定蛋白、有明显跨膜现象、无信号肽;所有PAL亚细胞定位于细胞质中,具有活性位点的蛋白占96.3%。本研究结果为进一步研究茄科植物中PAL代谢机理提供理论支持。
- 盖江涛陈振玺王鹏
- 关键词：苯丙氨酸解氨酶PAL基因家族氨基酸茄科
- 假臭草EST-SSRs标记的开发
- 2014年
- 从NCBI的dbEST数据库中下载假臭草同族植物的EST序列,经EST序列处理及SSR位点查询,首次设计了27对假臭草EST-SSRs引物,以海南省文昌市假臭草DNA为模板,采用单因素和L16(45)正交试验对其EST-SSRs PCR反应体系进行优化。建立了假臭草EST-SSRs最佳20μLPCR反应体系:Mg2+浓度为2.75 mmol/L,模板DNA用量为35 ng,Tag DNA聚合酶为2.25 U,dNTPs浓度为0.3 mmol/L,引物浓度为0.6μmmol/L。并用14个不同来源的假臭草样本对其体系进行验证实验,结果均能获得稳定的、清晰明亮的扩增谱带。假臭草EST-SSRs标记的开发为深入研究其遗传多样性提供了基础。
- 黄敏陈振玺刘建福王奇志
- 关键词：假臭草引物设计
