徐少林
- 作品数：5 被引量：10H指数：2
- 供职机构：暨南大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学环境科学与工程更多>>
- 广东省大沙河水库轮虫群落结构的时空异质性分析被引量：5
- 2017年
- 于2010年1月至12月对广东省大沙河水库中的河流区、过渡区和湖泊区进行逐月采样,采集浮游动物并测定水体理化指标,以探讨热带大型富营养化水库轮虫群落结构的时空异质性。在三个采样点,形态学分类共鉴定出25种轮虫,其中19种来自游泳亚目的 6个科,8个属,4种来自簇轮亚目的 1个科,2个属,剩余2种来自胶鞘亚目的 2个科,2个属。数据分析表明:1)大沙河水库轮虫群落结构变化具有明显的季节特征,可分为枯水一期(1—4月),丰水期(5—9月)和枯水二期(10—12月),Indval分析显示不同季节的指示种不同且均不少于三种;2)轮虫群落结构和多样性(Shannon-Hill number)不具有明显的空间异质性,但轮虫多样性和物种数具有显著的季节差异(p=0.004,p=0.007);3)环境变量对轮虫群落结构的解释率为41.269%,水体理化变量解释率31.935%,其中温度解释率16.512%,水库水文变量对轮虫群落结构变化解释率9.334%,水体理化变量对轮虫群落结构有重要的影响。
- 徐少林李慧明顾杨亮韩博平
- 关键词：轮虫群落结构空间异质性
- 广东流溪河水库盔型溞(Daphnia galeata)休眠种群与现生种群的单倍型多样性和遗传分化被引量：3
- 2017年
- 休眠卵库作为淡水枝角类生物与遗传信息的储藏库,从沉积物休眠卵库中萌发的枝角类对现生种群的数量与种群遗传结构有着直接的影响.分别采集流溪河水库盔型溞的现生种群和沉积物表层(0~10 cm)的休眠卵,扩增现生种群与休眠卵的线粒体细胞色素C氧化酶亚基I基因,构建了单倍型网络.休眠种群相比现生种群有着较高的单倍型多样性和核酸多样性,初期现生种群分别为0.562、0.00104,末期现生种群分别为0.726、0.00331,休眠种群分别为0.815、0.00761.流溪河盔型溞现生种群与休眠种群存在双向基因流,现生种群到休眠种群的有效迁移率为490.9,休眠种群到现生种群的有效迁移率为527.5.通过构建贝叶斯系统树验证了休眠种群和现有种群中并不存在隐种或者亚种的分化,休眠种群与现生种群之间没有出现较大的遗传分化,现生种群遗传多样性来自于休眠种群,水库的休眠种群更能反映种群真实的遗传多样性.休眠种群与现生种群之间的基因流与休眠卵库大小无关,与休眠卵的萌发有关.
- 黄琦徐少林徐磊韩博平
- 关键词：基因流
- 一种第三代测序浮游动物基因组DNA提取方法与应用
- 本发明公开了一种第三代测序浮游动物基因组DNA提取方法与应用。该方法包括如下步骤：(1)向缓冲液GA中加入18％～20％(V/V)β－巯基乙醇，然后加入浮游动物进行研磨，得到组织缓冲液；(2)向组织缓冲液中加入蛋白酶PK...
- 韩博平刘平徐少林
- 文献传递
- 一种第三代测序浮游动物基因组DNA提取方法与应用
- 本发明公开了一种第三代测序浮游动物基因组DNA提取方法与应用。该方法包括如下步骤：(1)向缓冲液GA中加入18％～20％(V/V)β－巯基乙醇，然后加入浮游动物进行研磨，得到组织缓冲液；(2)向组织缓冲液中加入蛋白酶PK...
- 韩博平刘平徐少林
- 文献传递
- 盔型溞(Daphnia galeata)四个地理种群遗传多样性及分化的RADP分析被引量：2
- 2015年
- 利用RAPD技术对采自云南和广东省的盔形溞的四个不同地理种群(拉市海、程海、洱海和流溪河水库)遗传多样性进行了分析。从20条寡聚核苷酸中筛选出了12条扩增产物稳定的随机引物。在4个群体180个个体中共检测到72个可重复位点,其中多态位点65个,多态率超过90%。四个种群的遗传多样性指数(Shannon指数)介于0.405—0.440之间,其中以流溪河水库群体遗传多样性最高,拉市海群体遗传多样性最低。四个不同地理的盔形溞种群间的遗传分化系数Gst为0.23。分子方差分析(AMOVA)表明,四个地理种群内的分子变异为71%,种群之间为29%,说明4个地理种群之间的遗传分化水平较高;云南三个种群内变异为70%,种群之间的变异为30%,说明距离较近云南省内的3个湖泊种群内存在较大的遗传变异,以上分子方差分析中P值为0.001,表明差异极显著(P<0.01)。Jaccard距离和Nei’s无偏遗传距离分析显示,地理距离最近的程海种群(CH)与拉市海种群(LS)并未首先聚在一起,而是与洱海种群(EH)聚在一起,之后与地理距离最远的流溪河种群(LX)相聚;种群分化与距离之间的弱相关性支持资源垄断假说。
- 谢理丽徐磊任晶晶徐少林韩博平
- 关键词：种群分化RAPD分析
