乔才元
- 作品数：2 被引量：8H指数：2
- 供职机构：中国科学院植物研究所系统与进化植物学国家重点实验室更多>>
- 发文基金：教育部科学技术研究重点项目国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学更多>>
- 长苞铁杉nrDNA内转录间隔区及5.8 S的二级结构分析研究被引量：6
- 2007年
- 核糖体RNA及相邻区域的二级结构研究,作为一个重要的工具,已在一些分类等级上被应用于系统发育的分析。以长苞铁杉为实验材料,通过克隆、测序,利用最小自由能原理预测nrDNA内转录间隔区及5.8S转录本的二级结构,分析它们的结构特点,探讨假基因化拷贝与功能拷贝结构上的差异。分析结果表明:(1)ITS1区的二级结构主要由几个延展的发夹结构组成,配对的亚重复单位在松科植物特有的保守序列处有部分重叠,未配对的亚重复单位通常能自身折叠,保守序列的部分碱基出现在发夹结构的环中;(2)假基因化拷贝二级结构的自由能比正常拷贝高;(3)与正常拷贝的二级结构相比,假基因化拷贝在进化速率很低的5.8S功能区发生较大的变异,且在5.8 S末端没有和26 S连接配对。
- 阚显照乔才元高卉朱国萍
- 关键词：长苞铁杉内转录间隔区RRNA假基因
- 长苞铁杉nrDNA ITS区假基因化拷贝的克隆及序列分析研究被引量：3
- 2007年
- NrDNA作为一个重要的工具,在许多分类等级上被广泛地应用于系统发育的分析。以长苞铁杉(Nothotsuga longibracteata)为实验材料,通过nrDNA ITS区特异拷贝的克隆及假基因化分析,在序列水平上探讨假基因化的特征,进而探讨引起多拷贝基因家族假基因化的分子机制。实验结果表明:假基因化拷贝的序列长度为1 745 bp,比其它拷贝短11 bp-12 bp;GC含量明显偏低,特别是5.8 S区和ITS2区的GC含量分别比其它克隆低6.15%-6.17%和5.75%-6.15%;5.8 S区和ITS2区序列变异大,遗传距离(d)分别为0.0718+0.0221和0.0691+0.0178;在系统发育的分析中出现异常的长枝现象。
- 阚显照乔才元朱国萍杨福生
- 关键词：长苞铁杉核RDNA假基因
