陈旭
- 作品数：20 被引量：83H指数：6
- 供职机构：福建农林大学园艺学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金福建省自然科学基金教育部“新世纪优秀人才支持计划”更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 龙眼DCL家族基因的启动子分析及时空表达被引量：7
- 2017年
- 为了解龙眼DCL基因的功能,该试验对龙眼基因组数据提取的DlDCL1、DlDCL2、DlDCL3和DlDCL4基因序列进行启动子顺式作用元件及其受miRNA调控的分析;并以龙眼胚性愈伤组织为材料,研究了DlDCLs不同基因成员在非生物胁迫和外源激素处理下的表达情况。结果显示:(1)龙眼DCL基因启动子中除了TATA和CAAT外,还具有大量的光反应元件、激素应答元件、胁迫响应元件、组织特异性调控元件及植物生长发育相关的顺式调控元件,提示龙眼DCL基因启动子转录活性可能受到光、激素信号及逆境胁迫因素的诱导。(2)对调控龙眼DCL基因的miRNA进行筛选,结果显示DlDCL1受miR162和miR1024调控,DlDCL4受miR390和miR396调控。(3)实时荧光定量PCR显示,在一定浓度范围内,外源激素GA3、ABA和ETH均能下调DlDCLs基因的表达,而高浓度ETH处理则显著上调DlDCLs的表达。(4)高浓度蔗糖(6%)处理时DlDCL2、DlDCL3和DlDCL4显著上调表达,而低浓度(0.1%)处理时DlDCL1显著上调表达;不同温度处理下,DlDCL1在34℃时显著上升,DlDCL3随着温度的提高相对表达量逐渐减低;而DlDCL2和DlDCL4表达量差异不明显;NaCl胁迫处理下,DlDCLs在1h处理时表达量下调,但在其他不同时间点则上调表达。研究表明,龙眼DCL基因在外源激素及非生物胁迫处理下,并非是简单的一对一响应,而是存在较为复杂的响应机制。
- 陈晓慧白玉李汉生陈旭林玉玲赖钟雄
- 关键词：龙眼启动子实时荧光定量PCR
- 龙眼漆酶家族成员全基因组结构与功能分析被引量：18
- 2018年
- 为了解龙眼漆酶（DlLAC）家族的生物学功能,采用生物信息学分析方法进行龙眼基因组LAC基因成员鉴定,蛋白结构域及特性、启动子顺式作用元件、分子进化树分析、体胚发生过程和组织器官特异表达的FPKM分析以及可能互作的mi RNA预测.结果显示：DlLAC家族基因包含42个基因成员,分为7大类;基因家族成员内含子数量1-8个不等,以5个为主,其中DlLAC15-1中存在600 bp短串联重复序列;DlLAC蛋白结构域共存在5种类型,均属于铜蓝蛋白,以3个铜蓝氧化酶结构域为主;DlLAC蛋白均为分泌型蛋白,亚细胞定位预测在胞外,包含2个以上糖基化位点,具有多个保守的motif;5端调控序列预测分析,DlLAC可能具有多个转录起始位点;DlLACp启动子序列均包含大量非生物胁迫应激响应元件、胚乳特异表达元件及MYB结合位点,推测MYB可能通过DlLAC进而调控龙眼胚胎发育.DlLAC9-1p、DlLAC12p、DlLAC17-2p含黄酮类化合物合成调控的MYB结合位点,可能参与龙眼生长发育过程中种子成熟和果皮成色的色素合成途径;DlLAC家族成员可能参与不同体胚发育过程和不同组织器官形态建成.42个龙眼漆酶成员共有28个受miRNA调控,13个成员受miR397调控,可能与木质素合成相关,8个成员受miR1535调控.非miR397调控的成员可能发挥其他重要的生物学功能.本研究表明,DlLAC家族成员在龙眼生长发育过程中除了参与木质素合成以外,还可能参与胚胎发育、胚乳发育、色素合成、组织器官特异表达等重要生物学功能,表现其功能上的多样性.
- 徐小萍陈晓慧吕科良陈旭陈裕坤林玉玲赖钟雄
- 关键词：龙眼功能分析
- 不同果肉质地枇杷果实发育过程中果胶代谢及相关基因表达分析被引量：7
- 2020年
- 【目的】研究红肉枇杷与白肉枇杷果实生长发育过程中果胶代谢和相关基因表达的动态规律,旨在探索枇杷果肉质地软化与果胶代谢的关系,为枇杷果肉品质改良、栽培选育等提供理论基础。【方法】以主栽红肉品种东湖早、早钟6号和白肉品种贵妃、白梨两类质地差异较大的果实为试材,测定不同发育时期的3种形态果胶含量以及果胶甲酯酶(Pectin methyl-esterase,PME)、多聚半乳糖醛酸酶(Polygalacturonase,PG)、果胶裂解酶(Pectate lyase,PL)、β-半乳糖苷酶(Beta-galactosidase,β-Gal)活性及其基因相对表达量。【结果】在果实发育后期,东湖早、早钟6号枇杷果实水溶性果胶(Water soluble pectin,WSP)含量显著低于贵妃、白梨,离子结合果胶(Ionic soluble pectin,ISP)及共价结合果胶(Covalent soluble pectin,CSP)含量差异不显著;PME活性随果实成熟软化先上升后下降,PG、β-Gal活性整体逐渐上升,且在果实发育后期,白肉枇杷果实PG、β-Gal活性显著高于红肉枇杷。相关基因表达量的变化趋势表现不同,白肉枇杷PL、PG、β-Gal基因相对表达量在果实成熟后期均显著高于红肉枇杷。【结论】果胶代谢参与了枇杷果实成熟软化进程,WSP含量、PG及β-Gal活性差异是导致枇杷果肉质地差异形成的生理因素;红肉枇杷和白肉枇杷果实成熟后期质地品质的差异可能是果胶降解相关基因相互协调作用的结果,其中PL、PG、β-Gal是关键基因。
- 高欢欢牛先前杨桂平郭傲陈旭郑国华
- 关键词：枇杷
- 枇杷MADS-box全基因组鉴定及其在果实成熟过程中的潜在作用被引量：1
- 2022年
- 利用生物信息学方法,从全基因组水平鉴定枇杷MADS-box基因家族成员,并对其系统进化关系、保守结构域、基因结构、基因复制和启动子顺式作用元件进行分析;同时,结合转录组数据和qRT-PCR结果,分析鉴定出的MADS-box基因家族成员在不同品种和不同成熟阶段的表达情况.本研究共鉴定出89个枇杷MADS-box基因(命名为EjMADS1~EjMADS89),其N端都含有MADS结构域.系统发育树显示,Ⅰ型MADS-box基因有31个,Ⅱ型有58个.Ⅱ型MADS-box基因可划分为14个亚族,同属于一个亚家族的基因有着相似的保守基序.MADS-box基因以不同密度分布在第1~17号染色体上,存在12对串联重复基因.转录组分析表明,在果实成熟过程中,有8个MADS-box基因在果实成熟期间差异表达,其中,EjMADS26、EjMADS43和EjMADS41这3个基因序列分别与其他调控果实成熟的SEP亚族基因高度相似,且它们的启动子中都含有赤霉素和脱落酸响应元件.另外,EjMADS37和EjMADS05在不同品种间(特早熟/中晚熟)有明显表达差异.综上,推测EjMADS26、EjMADS43、EjMADS41、EjMADS37和EjMADS05对果实成熟有一定的调控作用.
- 刘楠寇燕李小婷陈旭高欢欢张晶王超郑嘉敏郑嘉敏
- 关键词：枇杷全基因组MADS-BOX基因果实成熟
- 公园不同植物配置群落空气负离子变化特征被引量：14
- 2019年
- 【目的】分析公园内不同植物配置类型负离子浓度变化特征,为营造利于人们身心健康的活动场所提供理论依据。【方法】以福州市闽江公园南园为研究样地进行了1周年(2017年9月至2018年8月)的定点检测,选择30个样点,凝练成8个植物配置类型和1个对照点(CK)。研究不同植物配置类型负离子浓度日、逐日、月和季节的变化特征,应用森林空气离子指数法进行分析及评价。【结果】(1)负离子浓度日变化大都呈V/U字型曲线波动,不同植物配置类型之间的负离子日平均总浓度比较:常绿阔叶林>落叶阔叶林>竹林>混交林>棕榈林>草地>常绿针叶林>灌木丛>对照点;(2)不同植物配置负离子浓度逐日变化均受外界气象因素影响较大,负离子浓度会因气象因子的变化,产生较大的波动;(3)负离子浓度月变化曲线均呈现U字型趋势,不同植物配置类型之间负离子年平均总浓度比较:竹林>落叶阔叶林>常绿阔叶林>棕榈林>混交林>常绿针叶林>灌木丛>草地>对照点;(4)同一植物配置类型不同季节负离子浓度在秋季最高,其次是夏季,春季和冬季负离子浓度相近;(5)不同植物配置类型空气质量排序由高到低为:竹林>落叶阔叶林>常绿阔叶林>棕榈林>混交林>常绿针叶林>灌木丛>草地>对照。【结论】在日变化过程中,一天在7∶00～9∶00为负离子浓度最高时段,常绿阔叶林、落叶阔叶林、常绿针叶林、混交林、竹林群落空气负离子浓度均在3 000个·cm^(-3)以上,空气质量评价指数属于优等,是户外活动最佳时间段和最佳的活动场所。
- 冯燕珠陈旭陈旭郭傲郑国华
- 关键词：空气负离子植物配置空气质量
- 龙眼胚性愈伤组织DlCK2-α基因克隆、亚细胞定位及其表达特性分析
- 2019年
- 【目的】克隆龙眼DlCK2-α基因,并对其表达特性进行分析。【方法】该试验通过RACE技术对DlCK2-α进行克隆,并在此基础上进行生物信息学分析和亚细胞定位以及蛋白质结构和功能的预测。对调控DlCK2-α的miRNA及顺式作用元件进行预测,并进行亚细胞定位观察。采用QRT-PCR技术对其在龙眼体胚不同阶段胚性培养物和不同光质的表达特性进行研究。【结果】DlCK2-α基因含有开放阅读框1002 bp,共编码333个氨基酸(GenBank登录号:MG181952);DlCK2-α属亲水性蛋白,不含有信号肽和跨膜结构域,但是含有一个典型的STKc_CK2_alpha保守结构域,预测含有32个磷酸化位点;miRNA预测结果显示,共有miR2615a等10条miRNA可能调控DlCK2-α;顺式作用元件预测显示多个光响应与应激响应元件可能调控DlCK2-α;GFP荧光定位观察显示其定位于细胞质。QRT-PCR结果显示,DlCK2-α在黑暗条件下的表达量高于光处理下的表达量。在体胚不同发育阶段,DlCK2-α在不完全胚性紧实结构中的表达量最低,球形胚中表达量最高,整体呈先降后升趋势。【结论】DlCK2-α基因在龙眼光信号转导和体胚发育调控中发挥重要作用。
- 李珊珊徐小萍陈旭陈晓慧李汉生林玉玲赖钟雄
- 关键词：龙眼酪蛋白激酶亚细胞定位QRT-PCR
- 1-MCP对水仙花开放过程ACC氧化酶活性的影响
- 2022年
- 以多花水仙金盏银台3年生水仙花种球为试材,研究乙烯作用抑制剂1-甲基环丙烯(1-MCP)处理对水仙花开放过程中ACC氧化酶活性的影响,以期为水仙花花期调控研究提供理论依据。试验分别设置处理1(1-MCP处理):在水仙花抽穗高6~7 cm时用1-MCP包裹水仙花剑茎,处理2(乙烯利+1-MCP处理):在种植前15 d将种球用乙烯利熏烟处理后,待水仙花抽穗高6~7 cm时用1-MCP包裹水仙花剑茎,处理3(CK):水仙花直接种植,不作任何处理。在花期采用酶联免疫分析法测定各处理水仙花不同开花时期和不同部位器官ACC氧化酶活性。结果表明:1-MCP处理的水仙花ACC氧化酶活性从花苞期到初花期呈下降趋势,从初花期到盛花期活性稍有上升,后又下降,但相对稳定,初花期、盛花期和衰老期ACC氧化酶活性差异不显著。与1-MCP处理相比,乙烯利+1-MCP处理的水仙花ACC氧化酶活性一直处在相对较高的水平,在盛花期到衰老期呈现显著上升趋势且维持在一个较高水平值;CK处理水仙花的ACC氧化酶活性从花苞期到初花期显著增加,而在后3个时期无显著性变化,但其均比1-MCP处理和乙烯利+1-MCP处理的ACC氧化酶活性高。衰老期乙烯利烟熏后再进行1-MCP处理显著提高水仙花全花及子房部位ACC酶活性,1-MCP处理和乙烯利+1-MCP处理的水仙花花瓣ACC氧化酶活性有所提高。
- 陈旭潘腾飞熊新月寇燕刘楠高欢欢郑国华
- 关键词：水仙花1-MCPACC氧化酶花期调控
- 龙眼体胚发生过程中DCL基因的分子特性及表达分析被引量：6
- 2017年
- 从龙眼转录组unigene序列筛选获得龙眼DCL基因(命名为DlDCL)全长序列,并结合生物信息学及实时荧光定量等方法,对龙眼DCL基因进行研究,以明确DlDCLs在龙眼体胚、不同生长组织部位中的表达规律及其对激素和光质应答反应,为进一步研究龙眼体胚过程中DlDCLs基因的调控研究奠定基础。结果表明:(1)龙眼转录组数据存在DlDCL1、DlDCL2、DlDCL3和DlDCL4四个DCL家族成员,且基于Unigene的FPKM值发现不同基因在体胚发生阶段具有差异表达。(2)生物信息学分析发现,DlDCLs成员间基本理化性质较为类似,均为亲水性不稳定蛋白、不含信号肽、可进行跨膜运动,但也存在一定差异,如DlDCL2为碱性蛋白,而其他3个成员为酸性蛋白;亚细胞定位预测显示,DlDCLs均定位于细胞核中,但DlDCL2也存在定位于叶绿体中;对DCL蛋白结构域预测显示,DCL是高度保守的蛋白。(3)系统进化树分析显示,不同物种的DCL分为4个分支,同源的DCL蛋白都聚为一类,且DlDCLs与柑橘DCL亲缘关系更为接近。(4)实时荧光定量PCR分析表明,DlDCLs在龙眼非胚性愈伤组织和体胚发生过程中的表达模式差异较大,但DlDCLs在愈伤组织阶段均有较高的表达量,推测DlDCLs在体胚发生过程可能具有功能的独立和协作。DlDCL1和DlDCL2在叶片、花器官等组织部位中的相对表达量较高,暗示DlDCL1和DlDCL2可能参与到光合作用和花器官的发育;DlDCLs还受2,4-D、MeJA、SA激素和光质诱导,表明DlDCLs可能参与激素和光质调控。
- 陈晓慧白玉陈旭李汉生林玉玲赖钟雄
- 关键词：龙眼体胚发生分子特性
- 龙眼miR156家族及其调控靶标SPL的生物信息学和表达模式被引量：2
- 2020年
- 为了解miR156基因家族的进化特性及其在龙眼早期体胚发生过程中的调控作用,对植物miR156家族成员的成熟体和前体序列进行多重比对和进化特性分析,并对龙眼miR156基因家族成员进行了前体(pre-miRNA)二级结构预测、靶基因预测及裂解位点验证,利用qPCR技术探究龙眼体胚发生早期miR156a与靶基因SPL6/9/16调控模式.结果表明,龙眼miR156家族含有13条成熟体序列和6条前体序列.Mfold预测显示,pre-miR156家族6个成员的序列均能形成典型稳定的茎环二级结构,它们的最小折叠自由能(ΔG)在-43.30--62.60 kal/mol;成熟序列的碱基保守性高.系统发育进化树分析显示,龙眼miR156家族与水稻、拟南芥的miR156亲缘关系更为接近.靶基因预测显示,龙眼miR156a的靶基因是SPL2、SPL6、SPL9、SPL16、SPL18;利用改良的RLM-RACE在龙眼愈伤组织中检测到SPL6/9/16的断裂片段,miR156a在与靶基因mRNA互补的第10个核苷酸处切割靶标mRNA.实时荧光定量PCR显示,在龙眼体胚发生早期miR156a在0-9 d表达平稳,仅在球形胚(globular embryos,GE)阶段显著下调,SPL6/9/16表达量持续上调,在GE阶段表达量最高,提示SPL6/9/16的大量积累对龙眼球形胚形态建成具有重要作用.本研究表明植物miR156基因家族成熟体序列高度保守,且miR156a的下调表达与靶基因SPL6/9/16的大量积累可能对龙眼球形胚的建成具有重要意义.
- 蒋梦琦苏立遥黄倏祺陈旭徐小萍张梓浩赖钟雄林玉玲
- 关键词：龙眼体胚发生SPL
- eTM、microRNA319及其调控靶标在龙眼体胚发生早期的表达模式被引量：4
- 2020年
- MicroRNA319作为最保守的miRNA家族之一,在植物器官形态建成、激素信号转导、抵抗外界胁迫等途径中均有重要作用.为了解miR319在植物体胚中的调控途径,利用龙眼转录组数据库筛选miR319成熟体(miR319)和前体序列(pre-miR319),并通过DNAMAN 6.0和Mfold分析miR319的定位和pre-miR319的二级结构;进而采用TAPIR和psRNAtarget预测选定的miR319成员的内源诱捕靶标(endogenous target mimics,eTM)及候选靶标,并通过RLM-RACE验证靶标裂解位点,最后分析eTM、miR319及其靶标在龙眼体胚发生早期的表达模式.结果显示,龙眼4个miR319成员有1个定位于miR319a scafflod517,有3个定位于miR319a scaffold225.因此,以miR319a scaffold225为研究对象,将其命名为pre-miR319a,其上的成熟体分别命名为miR319a-3p.1、miR319a-5p.1和miR319a-5p.2.裂解位点显示龙眼miR319a 3个成员中,miR319a-3p.1的靶基因为TCP2和TCP4(Dlo_022819.1,Dlo_026743.1),miR319a-5p.1的靶基因为吲哚-3-甘油磷酸合成酶(IGS)和ABI3-5抑制因子,miR319a-5p.2未验证到靶基因.qPCR显示,在龙眼早期体胚发生过程中,miR319a 3个成员的表达模式基本一致,呈显著上调趋势.另外,除eTM8637外,其余eTM的表达模式与其相应的miR319a成员基本呈现为负相关趋势,均为下调趋势.miR319a-3p.1与其靶基因基本呈现为负调控趋势,miR319a-5p.1与ABI3-5抑制因子在龙眼早期体胚发生后期呈现负调控,与IGS没有明显负相关.本研究初步验证了"eTM-miR319a-靶基因"信号途径可能参与到龙眼早期体胚发生的形态建成.
- 苏立遥陈旭黄倏祺蒋梦琦厉雪张梓浩赖钟雄林玉玲
- 关键词：龙眼靶基因体胚发生
