张小燕
- 作品数：2 被引量：15H指数：2
- 供职机构：淮北师范大学生命科学学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 中药体内代谢基因组研究被引量：6
- 2016年
- 基因作为中药体内代谢及药效发挥的基础,以基因表达、调控及修饰为研究方向,进行中药多组分、多环节、多靶点的体内代谢研究,有助于中药体内代谢过程、作用靶点和分子机制研究取得突破性进展。人作为一个超级生物体,1%的基因遗传自父母,其余99%的基因来自分布人体各部位,主要源自肠道菌群的微生物,即人体自身基因组和"第二基因组"分别从遗传和"环境"角度对中药体内代谢产生影响。该文以典型研究案例为线索,探讨中药体内代谢基因组相关研究,主要包括中药基因组和肠道宏基因组研究,以及基于上述(宏)基因组个体差异引发的个体化医疗。
- 肖水明白瑞张小燕
- 关键词：中药体内代谢中药基因组学个体化医疗
- 基于本草基因组学应用流式细胞术和高通量测序技术检测人参基因组大小被引量：9
- 2017年
- 人参(Ginseng)是五加科植物人参(Panax ginseng C.A.Mey.)的干燥根和根茎。由于其基因组数据的缺乏制约了人参基础研究和产业发展。本实验以水稻(Oryza sativa ssp.Nipponbare)和大豆(Glycine max(L.)Merrill)为内参,通过流式细胞术检测人参基因组大小约为3.42 Gb;同时,分别构建人参基因组插入片段大小为250 bp和500 bp的鸟枪法(shotgun)文库,利用Illumina Hiseq X Ten平台进行双端PE 150高通量测序,过滤原始测序数据后获得183.82 Gb高质量数据,K-mer分析法预估人参基因组大小为3.35 Gb,测序深度为54.87 X。本研究采用流式细胞术结合K-mer分析法测定人参基因组大小,为人参全基因组测序以及本草基因组学的研究提供基础数据。
- 张小燕刘志香廖保生廖保生肖水明徐江
- 关键词：人参基因组大小流式细胞术高通量测序
