为弄清长江河口区江豚（ Neophocaena asiaeorientalis ）种群数量和分布情况，于2012年6月8-11日和2012年9月12-19日对这一水域作了2次较大覆盖面的目视考察和9次遗骸搜寻。6月的考察目击到江豚5群8头，9月的考察未目击江豚个体。依据样带法估算，长江河口水域6月份的江豚种群数量约为61头。全年共获得7头江豚遗骸，并搜集到其他5例死亡信息。对其中5头外表完整、特征保留良好的遗骸所作的鉴定结果显示，2头为长江亚种（ N. asiaeorientalis asiaeorientalis），3头为东亚亚种（ N. asiaeorientalis sunameri）。调查表明，崇明岛西端和青草沙附近水域是长江亚种活动的热点水域，可作为重点监护区域。
