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郭秀丽

作品数:1 被引量:47H指数:1
供职机构:青岛农业大学农学与植物保护学院茶叶研究所更多>>
发文基金:山东省科技发展计划项目山东省自然科学基金国家科技支撑计划更多>>
相关领域:农业科学更多>>

文献类型

  • 1篇中文期刊文章

领域

  • 1篇农业科学

主题

  • 1篇特性分析
  • 1篇密码子
  • 1篇密码子偏好性
  • 1篇密码子使用
  • 1篇基因
  • 1篇CBF1基因
  • 1篇茶树

机构

  • 1篇青岛农业大学

作者

  • 1篇丁兆堂
  • 1篇杨路成
  • 1篇王玉
  • 1篇郭秀丽

传媒

  • 1篇遗传

年份

  • 1篇2012
1 条 记 录,以下是 1-1
排序方式:
茶树CBF1基因密码子使用特性分析被引量:47
2012年
转录因子CBF(C-repeat-binding factor)广泛存在于各种植物中,是植物抗逆过程中一个重要的调节因子。文章运用CHIPS、CUSP和CodonW在线程序对茶树(Camellia sinensis)CBF1基因(CsCBF1)序列进行分析,并与茶树基因、模式植物基因组和其他植物CBF基因进行比较,对了解CsCBF1基因密码子使用特性,并为其选择合适的表达系统具有重要意义。结果表明:CsCBF1基因与70个茶树基因对密码子的使用有明显的差异,CsCBF1基因偏好使用以G/C结尾的密码子,而筛选的70个茶树基因偏好使用以A/T结尾的密码子。在密码子使用频率上,CsCBF1基因与拟南芥(Arabidopsis thaliana)、烟草(Nicotiana tobacum)的差异小于与小麦(Triticum aestivum)、玉米(Zea mays)的差异;因此,拟南芥、烟草更适合作为CsCBF1基因的外源表达宿主。通过分析40种植物CBF基因编码特点可知大部分CBF基因偏好使用以G/C结尾的密码子,这可能与基因的特殊功能有关。
郭秀丽王玉杨路成丁兆堂
关键词:茶树CBF1基因密码子偏好性
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