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刘昕

作品数：1 被引量：2H指数：1
供职机构：中国科学院遗传与发育生物学研究所更多>>
发文基金：中国科学院知识创新工程国家高技术研究发展计划更多>>
相关领域：自动化与计算机技术更多>>

合作作者

文献类型

  • 1篇中文期刊文章

领域

  • 1篇自动化与计算...

主题

  • 1篇生物信息
  • 1篇生物信息学
  • 1篇分子标记
  • 1篇PCR
  • 1篇并行计算

机构

  • 1篇中国科学院
  • 1篇中国科学院研...
  • 1篇中国科学院遗...

作者

  • 1篇曹宗雁
  • 1篇迟学斌
  • 1篇郎显宇
  • 1篇刘昕

传媒

  • 1篇计算机应用

年份

  • 1篇2011
共 1 条 记 录，以下是 1-1
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排序方式：
超大规模序列比对计算的并行优化被引量：2
2011年
针对生物信息学研究中的超大规模序列比对计算问题进行了研究,解决了现有的e-PCR软件包在处理小麦基因引物扩增比对任务中存在的内存瓶颈、I/O瓶颈和计算时间瓶颈问题,利用数据和任务分割的基本方法,使其最关键的引物与模板的比对计算能够大规模并行,进而采用基于主从通信模式的MPI通信框架进行编程实现,并从任务的缩减、负载平衡、容错和多作业并发等方面进行了优化,最终在百万亿次超级计算机上顺利实现了千核级大规模并行计算,在数十日内即可完成原本预期需要数年的小麦序列扩增比对计算。
曹宗雁郎显宇刘昕迟学斌
关键词：并行计算生物信息学分子标记
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