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章张

作品数：6 被引量：71H指数：4
供职机构：中国科学院北京基因组研究所更多>>
发文基金：中国科学院战略性先导科技专项国家高技术研究发展计划更多>>
相关领域：生物学医药卫生经济管理更多>>

合作作者

文献类型

  • 5篇期刊文章
  • 1篇会议论文

领域

  • 3篇生物学
  • 1篇经济管理
  • 1篇医药卫生

主题

  • 4篇数据共享
  • 3篇基因
  • 2篇生物信息
  • 2篇生物信息学
  • 2篇基因组
  • 2篇大数据
  • 1篇新型冠状病毒
  • 1篇信息库
  • 1篇人类遗传资源
  • 1篇生命
  • 1篇数据管理
  • 1篇数据管理系统
  • 1篇数据汇交
  • 1篇数据资源
  • 1篇水稻
  • 1篇抗逆
  • 1篇抗逆基因
  • 1篇抗逆性
  • 1篇基因组科学
  • 1篇冠状

机构

  • 6篇中国科学院
  • 3篇中国科学院大...
  • 1篇华中农业大学

作者

  • 6篇章张
  • 3篇唐碧霞
  • 3篇赵文明
  • 2篇肖景发
  • 2篇朱军伟
  • 2篇王彦青
  • 2篇张思思
  • 2篇桑健
  • 2篇李茹姣
  • 2篇陈婷婷
  • 2篇陈焕新
  • 1篇陈梅丽
  • 1篇薛勇彪
  • 1篇宋述慧
  • 1篇田东梅
  • 1篇郝丽丽
  • 1篇陈旭
  • 1篇郝丽丽
  • 1篇马利娜

传媒

  • 3篇遗传
  • 1篇大数据
  • 1篇计算生物学
  • 1篇第六届全国生...

年份

  • 1篇2021
  • 1篇2020
  • 1篇2018
  • 1篇2016
  • 1篇2015
  • 1篇2014
共 6 条 记 录，以下是 1-6
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排序方式：
GSA-Human:人类遗传资源数据管理的公共系统被引量：6
2021年
GSA-Human是人类遗传资源数据汇交、存储、管理与共享的数据库系统,可提供人类遗传资源数据的上传、下载、浏览、检索等公共服务,并有效支撑了国家重点研发计划科技项目数据的汇交与管理工作。系统具有符合《中华人民共和国人类遗传资源管理条例》数据安全管理策略,提供公开访问和受控访问相结合的数据使用模式。公开访问数据允许用户自由下载与获取;受控访问数据采用申请-审核的模式,即需要通过数据管理委员会(Data Access Committee,DAC)的授权方可获得下载和使用权限。系统自上线以来,截至2021年7月,汇集数据总量已超5.27 PB。
张思思张思思陈婷婷陈旭唐碧霞陈婷婷董丽莉朱军伟孙艳玲唐碧霞翟爽孙玉彬陈焕新杜政霖肖景发章张鲍一明王彦青陈焕新
关键词：数据汇交数据共享
Biocuration in aid of translating big data into big discovery
Background: Biocuration involves the integration of the scientific literature as well as large-scale omics dat...
章张
关键词：BIGCOMMUNITYCURATION
面向国际的生命组学大数据管理体系建设被引量：4
2016年
组学数据是生命科学研究中的一类极其重要的大数据,特别是二代测序技术的发展推动了组学大数据的爆炸式增长。通过借鉴国际数据中心建设的成功经验,分析国内组学产出数据及数据库建设、数据管理现状及应用需求,构建了面向国际的生命组学大数据管理体系,涵盖组学原始序列归档库、基因组序列数据库、基因表达数据库、基因组变异数据库、DNA甲基化数据库系统等,初步形成中国组学数据资源的存储、共享与应用体系。
赵文明张思思唐碧霞陈婷婷郝丽丽桑健李茹姣肖景发章张
关键词：大数据数据共享生物信息学基因组
2019新型冠状病毒信息库被引量：51
2020年
2019年12月在中国武汉开始爆发的新型肺炎已造成全球25个国家/地区的31516人感染、638人死亡(截止2020年2月7日16时),引起该肺炎的病毒被世界卫生组织命名为2019新型冠状病毒(2019-nCoV)。为促进2019-nCoV数据共享应用并及时向全球公众提供病毒的相关信息,国家生物信息中心(CNCB)/国家基因组科学数据中心(NGDC)建立了2019新型冠状病毒信息库(2019nCoVR,https://bigd.big.ac.cn/ncov)。该信息库整合了来自德国全球流感病毒数据库、美国国家生物技术信息中心、深圳(国家)基因库、国家微生物科学数据中心及CNCB/NGDC等机构公开发布的2019-nCoV核苷酸和蛋白质序列数据、元信息、学术文献、新闻动态、科普文章等信息,开展了不同冠状病毒株的基因组序列变异分析并提供可视化展示。同时,2019nCoVR无缝对接CNCB/NGDC的相关数据库,提供新测序病毒株系的基因组原始测序数据、组装后序列的在线汇交、管理与共享、国际数据库同步发布等数据服务。本文对2019nCoVR数据汇交、管理、发布及使用等进行全面阐述,以方便用户了解该信息库各项功能及数据状况,为加速开展病毒的分类溯源、变异演化、快速检测、药物研发以及新型肺炎的精准预防与治疗等研究提供重要基础。
赵文明宋述慧宋述慧陈梅丽马利娜马利娜李茹姣李茹姣郝丽丽田东梅田东梅唐碧霞王彦青朱军伟陈焕新章张鲍一明
生命与健康大数据中心资源被引量：12
2018年
生命与健康多组学数据是生命科学研究和生物医学技术发展的重要基础。然而,我国缺乏生物数据管理和共享平台,不但无法满足国内日益增长的生物医学及相关学科领域的研究发展需求,而且严重制约我国生物大数据整合共享与转化利用。鉴于此,中国科学院北京基因组研究所于2016年初成立生命与健康大数据中心(BIG Data Center,BIGD),围绕国家人口健康和重要战略生物资源,建立生物大数据管理平台和多组学数据资源体系。本文重点介绍BIGD的生命与健康大数据资源系统,主要包括组学原始数据归档库、基因组数据库、基因组变异数据库、基因表达数据库、甲基化数据库、生物信息工具库和生命科学维基知识库,提供生物大数据汇交、整合与共享服务,为促进我国生命科学数据管理、推动国家生物信息中心建设奠定重要基础。
张源笙夏琳桑健李漫刘琳李萌伟牛广艺曹佳宝滕徐菲周晴章张
关键词：大数据数据共享数据资源生物信息学
基于RiceWiki的水稻抗逆基因审编与分析
2015年
在中国,审编是一个新领域,对各种生物学信息进行审编是今后的发展趋势。本文收集了文献中耐盐、耐旱、耐热、耐寒、抗植株矮小、抗倒伏、抗白叶枯病、抗稻瘟病这8种水稻抗逆基因,共计500个。以RiceWiki为平台,对搜集的水稻抗逆基因进行审编,发布到RiceWiki上,并对搜集的500个基因进行了分析。首先分析了抗逆基因之间的蛋白互作,得到了61个蛋白质间的78个蛋白互作。共表达分析表明有明显共表达趋势的蛋白对占21.61%,进一步表明了这些抗逆基因编码的蛋白可以互作。最后,利用argiGO对GO富集度进行了分析,结果表明和压力相关的GO语义的显著性水平较高。
张烨陈玲玲章张
关键词：抗逆性
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