胡海兵
- 作品数：2 被引量：27H指数：1
- 供职机构：上海交通大学农业与生物学院更多>>
- 相关领域：医药卫生农业科学更多>>
- 基于高通量测序技术的冠心病患者肠道菌群多样性研究被引量：26
- 2016年
- 为了分析冠心病人群肠道菌群结构和多样性特征,探究冠心病人群与健康人群肠道菌群结构差异。研究共采集50例冠心病患者和35例健康人粪便样本,提取粪便样本总DNA;根据细菌16SrDNA V3~V5区设计引物进行扩增,利用Illumina Miseq平台进行高通量测序;测序结果经过Reads拼接,OTUs（operational taxonomic units）聚类,物种注释,α多样分析,主成分分析,最终得到样品物种信息。在冠心病组和健康组中,拟杆菌门（Bacteroidetes）和厚壁菌门（Firmicutes）的丰度最高,其中拟杆菌门分别占到46.94%和61.96%,厚壁菌门分别占到41.51%和30.58%;丰度较高的是变形菌门（Proteobacteria）、梭杆菌门（Fusobacteria）、放线菌门（Actinobacteria）。此外,两组菌群结构差异性表现为：冠心病组的拟杆菌门明显低于对照组（P=0.015〈0.05）;而冠心病组的厚壁菌门显著高于对照组（P=0.009〈0.01）。α多样性分析结果显示,两组人群各样本在细菌种群多样性方面没有明显差异。OTUs比对结果表示,Veillonella、Veillonella dispar、Scardovia、Mogibacterium致病菌在冠心病组显著增高,而Bacteroidetes门下Parabacteroides、Bacteroides uniformis、Bacteroides caccae等有益菌则显著降低。主成份分析显示,综合PC1、PC2、PC3因素冠心病组和对照组样本被较好的区分开,表明健康组和冠心病组菌群结构存在显著差异。这些结果表明,冠心病患者与健康人群在肠道菌群多样性方面没有明显差异,但在菌群结构上存在较大差异;同时冠心病人肠道菌群致病菌数量多于健康人群,而拟杆菌类有益菌低于健康人群。
- 胡海兵崔立郭靓骅王春艳华修国余强尹桂芝
- 关键词：肠道菌群冠心病宏基因组高通量测序
- 猪胸膜肺炎放线杆菌(APP)1型感染小鼠模型的建立及其病理学观察被引量：1
- 2015年
- 为了针对我国目前流行菌株猪胸膜肺炎放线杆菌1型(App-S1)菌进行致病性研究,同时成功建立实验动物感染模型并完成病理学观察。本实验选取25只昆明小鼠随机均分为5组,4个试验组分别腹腔注射4×104、4×105、4×106、4×107 cfu/mL的App-S1菌液1mL/只,对照组注射生理盐水1mL/只。不同浓度菌液攻毒的小鼠3d内出现不同的临床表现,部分小鼠出现典型的肺炎、心外膜炎等症状并伴随有死亡现象。其证明了App-S1对实验动物昆明小鼠具有致病性,同时经计算得出了App-S1对昆明小鼠的LD50为4.48×105.85cfu/mL。将死亡小鼠进行剖检,选取病灶组织器官、分离细菌并经PCR鉴定为与攻毒App-S1相同的阳性菌株,同时制作切片,进行病理学观察分析。这些结果表明App-S1腹腔接种SPF级昆明小鼠可以复制出典型的胸膜肺炎病例,同时能够成功地人为构建实验动物感染模型,对今后App-S1致病性及其临床诊断方面的研究具有借鉴意义。
- 刘雨潇胡海兵李树清崔立
- 关键词：动物模型病理学观察
