王宇杰
- 作品数：2 被引量：1H指数：1
- 供职机构：武汉大学物理科学与技术学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：理学更多>>
- RNA碱基对的分子动力学模拟
- 2014年
- RNA作为一种重要的生物大分子,其很多生物功能都与其结构有关.RNA碱基对的热力学性质和动力学性质是预测RNA结构的基础.本文采用全原子分子动力学方法模拟了RNA碱基对G—C在3种不同温度下的打开及闭合情况,统计分析了其打开和闭合几率.研究结果表明,随着温度的升高,碱基对G—C处于闭合状态的几率逐渐降低,处于打开状态的几率逐渐增加,而碱基对打开闭合状态的转换频率随着温度的升高而逐渐增加,并且形成碱基配对的3组原子间的氢键距离分布变宽.
- 张勇王宇杰张文炳
- 关键词：分子动力学模拟自由能热力学
- 丁型肝炎病毒(HDV)天然序列和G11C突变序列的转录折叠动力学研究被引量：1
- 2016年
- 在转录折叠条件下,丁型肝炎病毒(HDV)的自剪切活性的发挥受到转录过程中形成的中间态结构、转录速率、突变位点等的影响.本文采用转录折叠动力学方法研究了HDV的天然(wild-type,wt)序列在不同转录速率下的转录折叠动力学行为,并分析了G11C突变对转录过程的影响.研究结果表明,虽然HDV的天然序列和G11C突变序列的转录折叠过程都存在快慢两条路径,但是对于HDV的天然序列,增大转录速率可以降低其慢速折叠路径上的RNA占据几率,而对于G11C突变序列,增大转录速率反而使得更多的RNA经过慢速路径形成天然态结构,并且在转录完全结束以后,HDV的天然序列要比G11C突变序列更快速地形成天然态结构.
- 邹彦娟龚沙王宇杰张文炳
- 关键词：HDV突变
