范新阳
- 作品数：18 被引量：14H指数：2
- 供职机构：云南农业大学动物科学技术学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金云南省应用基础研究基金云南省教育厅科学研究基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 那米鸡早期生长发育规律研究被引量：6
- 2021年
- 【目的】研究那米鸡的生长发育规律。【方法】选用Gompertz、Logistic和Von Bertalanffy 3种常用的非线性曲线模型对那米鸡0~210日龄体质量进行了生长曲线拟合与分析。【结果】那米鸡体质量的累积生长曲线呈现"S"形,表明其生长发育正常;表现为60日龄之前生长速度较慢,60~120日龄阶段为该鸡的生长旺盛期,120日龄以后生长速度逐渐减缓。60日龄以前,公鸡、母鸡的体质量累积生长曲线基本一致,60日龄以后,公鸡生长速度明显快于母鸡。3种曲线模型均能较好的拟合公、母鸡的生长发育,拟合度均达0.99以上,其中Gompertz模型对公鸡的拟合值与实际值最为接近,Von Bertalanffy模型对母鸡的拟合值与实际值最接近,表明Gompertz模型对那米鸡公鸡体质量的拟合度更高(R~2=0.998),Von Bertalanffy模型对母鸡体质量的拟合度更高(R~2=1.000)。【结论】本研究揭示了那米鸡的生长发育规律,表明运用Gompertz和Von Bertalanffy模型对那米鸡进行生长曲线的拟合与分析是可行的,可为那米鸡的饲养管理及选育利用提供依据。
- 胡瑀邓俊邱立华范新阳黄静王荣平苗永旺
- 关键词：生长发育
- 牛科物种FEZF2基因分子特征、功能预测及进化分析
- 2022年
- 【目的】揭示牛科物种FEZF2基因的功能及其差异。【方法】从NCBI和Ensembl数据库下载牛科主要家畜FEZF2基因序列及用于比较的非牛科物种的同源序列,采用生物信息学和比较基因组学方法对牛科家畜FEZF2基因的结构、编码蛋白的理化特征、氨基酸组成、基序和保守结构域、高级结构、参与的生物学路径、分子功能及进化关系进行比较分析。【结果】牛科动物间FEZF2基因转录区的结构存在差异,表现为非翻译区和内含子的序列长度不一致,但它们的编码序列(coding sequence,CDS)结构模式一致,与非牛科动物的CDS结构具有共线性关系。牛科动物FEZF2蛋白都是在核内发挥生物学功能的亲水性蛋白,无信号肽序列及跨膜结构域,都含有1个COG5048保守的锌指结构域。预测显示:FEZF2蛋白参与的生物学过程主要与神经元发育调节有关,分子功能主要是与染色质结合、转录激活或抑制有关。牛科与非牛科哺乳动物的FEZF2序列都存在1个连续的甘氨酸序列重复区,水牛、牦牛、绵羊和山羊均为13G型,但普通牛和瘤牛存在12G和13G两个等位基因。各牛科物种FEZF2蛋白在氨基酸组成、序列一致性、理化特征、基序、结构域和高级结构上存在相似性,但在牛科的不同属间存在一定差异。系统发育分析显示:牛科同属动物的FEZF2蛋白遗传关系较近。【结论】本研究揭示牛科家畜间FEZF2基因CDS的结构模式高度一致;FEZF2作为核内功能蛋白可能参与了牛科物种的神经元发育和机体免疫等过程的基因表达调控。
- 保志鹏涂兴调张自芳谷丽娇范新阳钱林东苗永旺
- 关键词：分子特征基因功能
- 水牛瘦素受体基因密码子使用偏好性分析
- 2017年
- 试验选取27头河流型水牛和41头沼泽型水牛,以从NCBI数据库中下载的家牛、野牦牛、野牛、绵羊、山羊、小鼠和人的序列作对照,对编码瘦素受体(leptin receptor,LEPR)基因的密码子偏好性及水牛与其他物种间密码子使用的差异和进化关系进行了深入分析。结果发现,所有的密码子在河流型水牛和沼泽型水牛LEPR基因中均有使用,两种类型水牛偏好使用的密码子有28个,其中使用偏好性较强的密码子为AGA(RSCU≥2),表明河流型水牛和沼泽型水牛LEPR基因密码子使用特征相似。水牛及参考物种LEPR基因均偏好使用以A/U结尾的密码子,但水牛与其他参考物种间偏好使用密码子的种类和数目有差异。密码子使用偏好聚类分析表明,河流型水牛与沼泽型水牛亲缘关系最近,先聚为一类,然后与家牛、野牦牛和野牛聚为一类,再与绵羊、山羊、小鼠和人等物种聚为一类。在密码子使用频率上,河流型水牛LEPR基因与酵母密码子偏好性差异小于与大肠杆菌和小鼠密码子偏好性差异,从而揭示酵母更适合作为水牛LEPR基因的外源表达系统。
- 范新阳欧阳依娜王鹏武张永云滕晓红苗永旺
- 关键词：河流型水牛沼泽型水牛
- 阿克鸡和武定鸡的蛋品质研究
- 2024年
- 为了阐明云南省地方鸡品种阿克鸡、武定鸡的蛋品质特征,试验以43周龄海兰褐蛋鸡为对照,采用常规方法测定阿克鸡组、武定鸡组、海兰褐蛋鸡组鸡蛋的蛋品质,并采用主成分分析法对蛋品质指标进行降维分析,以评定不同鸡种蛋品质的优劣。结果表明:海兰褐蛋鸡组蛋重(64.50 g)最大,显著高于武定鸡(54.97 g)组和阿克鸡(54.59 g)组(P<0.05);3组间蛋比重差异显著(P<0.05);武定鸡组和海兰褐蛋鸡组蛋壳厚度显著高于阿克鸡组(P<0.05);武定鸡组蛋壳强度显著高于阿克鸡组和海兰褐蛋鸡组(P<0.05);武定鸡组和阿克鸡组蛋形指数、蛋黄重、蛋黄比率、哈氏单位均显著高于海兰褐蛋鸡组(P<0.05)。3组间水分、粗脂肪和三酰甘油含量差异显著(P<0.05),粗灰分、钙、磷含量差异不显著(P>0.05);海兰褐蛋鸡组粗蛋白含量显著高于阿克鸡组(P<0.05),武定鸡组与阿克鸡组和海兰褐蛋鸡组比较均差异不显著(P>0.05);阿克鸡组总胆固醇含量显著低于武定鸡组(P<0.05),海兰褐蛋鸡组与武定鸡组和阿克鸡组比较均差异不显著(P>0.05)。蛋品质的各个指标均具有相关性,但不同鸡种的指标间相关性差异不同,阿克鸡、武定鸡和海兰褐蛋鸡的蛋重与其他指标均呈负相关,蛋壳厚度和蛋形指数也为负相关,但蛋白高度、哈氏单位、蛋黄比率、蛋壳强度、蛋黄重、蛋黄色泽、蛋形指数指标两两之间均为正相关。当特征值>1时有2个成分,此时主成分累计百分比达到88.566%;提取到的2个主成分的方程分别为:F1=-0.388 7×Z_(蛋重)+0.347 3×Z_(蛋壳强度)+0.291 8×Z_(蛋形指数)+0.400 9×Z_(蛋黄色泽)+0.155 9×Z_(蛋白高度)+0.449 7×Z_(蛋黄重)+0.430 2×Z_(蛋黄比率)+0.265 8×Z_(哈氏单位),F2=-0.168 9×Z_(蛋重)-0.081 9×Z_(蛋壳强度)-0.496 5×Z_(蛋形指数)-0.262 2×Z_(蛋黄色泽)+0.595 7×Z_(蛋白高度)-0.078 9×Z_(蛋黄重)+0.030 1×Z_(蛋黄比率)+0.536 0×Z_(哈氏单位);综合�
- 朱伟和风黄丽鸽韩春柳范新阳和胜苗永旺
- 关键词：武定鸡海兰褐蛋鸡蛋品质主成分分析
- 河流型与沼泽型水牛CSN3基因密码子使用特征分析被引量：3
- 2017年
- 本研究以54头河流型水牛和70头沼泽型水牛为研究对象,并以从NCBI数据库中下载的普通牛、野牦牛、野牛、绵羊、小鼠和人的序列作对照,对乳成分中重要的κ-酪蛋白(kappa casein)编码基因CSN3的密码子使用偏好性及水牛与其他物种间CSN3基因密码子使用的差异和进化关系进行了深入分析。结果表明:两种类型水牛CSN3基因密码子使用特征相似,河流型水牛CSN3基因共有26个偏好使用的密码子,而沼泽型水牛共有27个;其中,两类水牛偏好性较强的密码子均为GUU、UCA、AGU、CCA、AGG、GGU和GGA(RSCU≥2),河流型水牛对Asp的两种密码子GAU、GAC没有使用偏好性,而沼泽型水牛偏好使用GAC;河流型水牛编码Asp和Cys的同义密码子RSCU值为1,而沼泽型水牛只有编码Cys的同义密码子RSCU值为1。研究发现,所有物种CSN3基因均偏好使用以A/U结尾的密码子,但不同物种之间偏好使用密码子种类和数目均有差异。在密码子使用频率上,水牛CSN3基因与其他牛科物种的差异小于与小鼠、人的差异。密码子使用偏好聚类分析表明,河流型与沼泽型水牛亲缘关系最近,聚为一类,然后依次与其他牛、绵羊、小鼠和人等物种相聚。
- 范新阳邱立华罗国祥张永云滕晓红苗永旺
- 关键词：河流型水牛沼泽型水牛密码子偏好性聚类分析
- 槟榔江水牛胃型LYZ C基因分离鉴定及功能生物信息学分析
- 2018年
- 【目的】溶菌酶是一种由动物产生的抗微生物酶,构成动物体先天免疫系统的一部分,在反刍动物的皱胃中还具有消化功能。迄今,普通牛溶菌酶C基因家族的分子遗传特征已被深入解析,但有关水牛溶菌酶C的研究报道较少。【方法】采用PCR产物直接测序技术,对槟榔江水牛胃型溶菌酶C基因编码区进行了分段扩增测序、序列组装和开放阅读框的确定,并结合已发表的其他牛科物种同源序列进行了生物信息学分析。【结果】序列分析表明:水牛胃型溶菌酶C基因编码区长444 bp,编码1个由147个氨基酸残基组成的多肽,包含1个N端信号肽和1段由129个氨基酸组成的成熟肽。水牛胃型溶菌酶C成熟肽分子量为14.41 ku,等电点为6.32,含有1个alpha-lactalbumin/lysozyme C保守结构域(19~145AA),不含有跨膜结构域,为亲水蛋白,在胞外发挥生物功能;在三维结构上与普通牛的溶菌酶模板(2z2f.1.A)有99.22%的一致性;在基于氨基酸序列构建的系统树上,水牛与普通牛、瘤牛、野牦牛和野牛聚在一起,且有较高的支持率(88%)。【结论】槟榔江水牛与其他牛科物种的胃型溶菌酶具有相似的功能。
- 黄静保志鹏范新阳张永云杜平康定富苗永旺
- 关键词：槟榔江水牛皱胃生物信息学分析基因功能
- 牛科物种类胰岛素生长因子结合蛋白3的研究进展被引量：1
- 2017年
- 类胰岛素生长因子结合蛋白3(IGFBP-3)是调控类胰岛素生长因子(IGFs)的一个重要的蛋白,它可以调节IGFs与其受体的结合能力,从而影响IGFs的生物活性。IGFBP-3的作用分为IGF依赖性和IGF非依赖性两种类型。越来越多的研究结果揭示IGFBP-3在生物体内作用的复杂性。文章综述了IGFBP-3与IGFs之间的相互作用机制、IGFBP-3基因的结构、IGFBP-3的多态性及其对泌乳、后躯发育等性状的影响。
- 范新阳苗永旺
- 关键词：泌乳性状基因多态性
- 德宏奶水牛PRL基因克隆、分子特征及组织差异表达分析
- 2022年
- 【目的】分离鉴定德宏奶水牛催乳素(prolactin,PRL)基因,并分析其分子特征和组织mRNA表达差异。【方法】采用PCR技术对德宏奶水牛PRL基因完整编码序列(CDS)进行分离鉴定,并利用生物信息学方法和半定量RT-PCR技术分别对水牛PRL进行分子特征以及泌乳期和非泌乳期的组织差异表达分析。【结果】水牛PRL基因CDS长690 bp,编码229个氨基酸。水牛PRL蛋白为亲水性分泌蛋白,无跨膜结构域,含有1个信号肽序列(AA1~30)、5种功能修饰位点和1个prolactin_like结构域(AA32~229),且参与了JAK-STAT和PI3K-AKT-mTOR信号通路。PRL的转录区结构及其编码蛋白的结构和保守结构域在牛科物种中高度相似。水牛PRL基因在所检测的11个组织中均有表达,其中,在乳腺中的表达量呈泌乳期极显著高于非泌乳期(P<0.001)。【结论】水牛PRL与其他牛科物种的PRL功能一致。PRL参与JAK-STAT和PI3K-AKT-mTOR乳蛋白合成信号通路,且水牛PRL在乳腺和肺脏等多种组织中均发挥功能,推测其参与水牛乳蛋白和乳脂合成。
- 谷丽娇黄丽鸽盛丹范新阳苗永旺
- 关键词：PRL基因分子特征基因功能
- 牛科家养动物催产素(OXT)基因研究进展
- 2023年
- 催产素(oxytocin,OXT)系全球首个被测序并人工合成的9肽神经内分泌激素,能以神经递质和激素两种形式发挥功能。以激素发挥功能时,需要与催产素受体(oxytocin receptor,OXTR)结合形成复合物方可发挥生理功能。OXT存在于机体多个组织器官,具有广泛的生物学功能,尤其在哺乳动物泌乳过程中发挥重要的调控作用。本文综述了牛科物种OXT基因结构及其编码多肽的分子特征、OXT与OXTR间的定位与相互识别过程、OXT调控泌乳过程的机制及其在动物生产中的应用,并对其下一步研究进行了展望,以期为深入解析OXT基因的结构与功能提供参考。
- 蒋发俊范新阳苗永旺
- 关键词：动物生产
- 水牛胃型LYZ c基因多态性及功能生物信息学分析
- 2017年
- 胃型LYZ c的主要功能是裂解反刍动物胃中的微生物,释放营养物质,为机体提供养分。为了揭示水牛胃型LYZ c基因的遗传特征,采用PCR产物直接测序技术,对66头河流型和158头沼泽型水牛样品胃型LYZ c基因完整编码区序列进行了变异检测,并结合已发表的牛科物种同源序列进行了比较基因组学和生物信息学分析。在水牛群体内共发现9个SNP位点,分别为c.87G>T、c.196G>A、c.228G>A、c.336G>C、c.351T>C、c.396C>T、c.423C>T、c.424G>A和c.438C>G,其中SNP87、SNP196、SNP336和SNP351仅存在于河流型水牛中,其他5个SNP为河流型和沼泽型水牛共享;SNP196和SNP424为异义替换,引起p.G66S和p.V142I氨基酸替换,但它们对水牛LYZ c的功能没有影响。在水牛胃型LYZ c基因中,共定义7种单倍型,确定了3种LYZ c变异体,其中变异体Buffalo1、Buffalo 2为两类水牛共享,Buffalo 3为河流型水牛独有。水牛这3种变异体之间在氨基酸组成、理化特性与结构上基本一致。水牛与普通牛胃型LYZ c蛋白的上述特征也极相似,但水牛胃型LYZ c的等电点比普通牛更低。结果揭示水牛胃型LYZ c蛋白可能更适合胃中的酸性环境,具有分解胃中微生物的功能。
- 范新阳张永云邱立华陈涛周芳廷哈福苗永旺
- 关键词：水牛C基因生物信息学分析
