程明星
- 作品数：4 被引量：7H指数：2
- 供职机构：中国农业科学院油料作物研究所更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 水稻抗褐飞虱基因的遗传定位及在品种改良中的应用
- 褐飞虱(Nilaparvata lugens St(a)l，BPH)是水稻种植地区危害最严重的害虫之一，由于褐飞虱的危害每年都给水稻生产造成了巨大的经济损失。目前为止，各国科学家在栽培稻和野生稻中共定位到了27个抗褐飞虱...
- 程明星
- 关键词：水稻种植抗性育种QTL定位
- 甘蓝型油菜作图群体亲本基因组及性状QTL密集区变异特点被引量：2
- 2017年
- 为了解作图群体亲本间基因组和密集QTL区的遗传变异,促进QTL定位与克隆,本研究对一个甘蓝型油菜(Brassica napus)重组自交系(recombinant lnbred lines,RIL)群体双亲M083和888-5(二者株高、分枝数、开花时间、菌核病抗性等性状差异显著)的基因组进行深度测序和分析。研究结果表明:在M083和888-5中分别检测到SNP个数为1 941 397和2 046 009,In Del个数为410 961和428 572,结构变异个数为90 384和88 456,拷贝数变异个数为46 655和46 008。对包含开花时间、菌核病抗性、株高等多个性状主效QTL密集的A02染色体进行分析发现,在包括上述性状QTL密集的6.4~6.9Mb的0~8.5Mb基因组区间内,两品系SNPs和In Dels变异数量/密度总体呈相反的趋势;片段丢失也有热点区,888-5和M083均在两个共同区域高频发生,其中一个为QTL密集区;倒位在染色体上的分布虽然也是不均匀的,但两品种间发生区域不同,且与QTL无关。本文关于基因组变异(SNPs、In Dels、除倒位外的结构变异)热点区和QTL密集区重复的结论对性状控制位点精细定位、基因克隆及育种亲本选择有一定的指导意义。
- 程明星童超波程晓晖刘越英刘立江柴国华黄军艳刘胜毅
- 关键词：油菜亲本QTL
- 甘蓝型油菜RIL群体株高性状的全基因组关联分析被引量：4
- 2016年
- 为提高甘蓝型油菜株高的分子标记辅助育种效率,挖掘与株高相关的功能基因以构建理想株型,利用单个重组自交系（RIL）群体在3个环境下的株高表型数据及7 877个SNP标记的基因型分型数据进行全基因组关联分析。在2个或2个以上环境下同时检测到5个与株高显著相关的SNP（Bn-scaff_15794_3-p62430、Bn-A02-p9599263、Bn-A02-p9409799、Bn-A02-p9993945和Bn-A02-p9636219）,均位于A02染色体上。比较利用连锁分析方法的QTL定位结果,发现标记Bn-A02-p9599263和Bn-scaff_15794_3-p62430分别位于QTL（q PH2-2和q PH2-4）峰值处,标记Bn-A02-p9636219和Bn-A02-p9993945分别落在QTL（q PH2-3和q PH2-4）2-LOD的置信区间内,标记Bn-A02-p9409799距离QTL（q PH2-2）的置信区间0.3c M。利用关联分析定位的区间（69.5~80.7c M）比利用连锁方法定位的QTL区间（60.7~95.9c M）缩小了24c M。依据参考基因组信息,在标记Bn-scaff_15794_3-p62430附近2kb处找到1个与株高性状相关的候选基因（GSBRNA2T00090973001）。结果表明,单个RIL群体进行全基因组关联分析可以对连锁QTL分析结果进行补充,缩小QTL置信区间。
- 黄静程明星唐敏强张凤启张园园童超波刘越英程晓晖董彩华黄军艳刘胜毅
- 关键词：甘蓝型油菜近等基因系株高全基因组关联分析
- 甘蓝型油菜类甜蛋白基因家族成员的鉴定及起源分析
- 由核盘菌引起的菌核病是导致甘蓝型油菜产量损失的重要原因之一。类甜蛋白(TLP)作为病程相关蛋白第五家族,在植物抗病防御系统中发挥关键作用。本研究在甘蓝型油菜基因组中鉴定获得70个类甜蛋成员,进一步分析了拟南芥、水稻、玉米...
- 白泽涛何贻洲黄军艳程明星曹慧慧柯涛刘胜毅
- 关键词：甘蓝型油菜融合基因共线性
- 文献传递
