田秋菊
- 作品数：4 被引量：3H指数：1
- 供职机构：山东农业大学农学院作物生物学国家重点实验室更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金转基因生物新品种培育专项更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 小麦ent-柯巴基焦磷酸合酶基因TaCPS1的克隆与荧光定量分析
- 2016年
- ent-柯巴基焦磷酸合酶(ent-copalyl diphosphate synthase,CPS)是植保素合成途径中的关键酶。本研究利用mRNA差异显示技术,从小偃麦异附加系种质SN6306中得到一个与抗白粉病相关的Ta CPS1基因。该基因ORF长2 394 bp,编码797个氨基酸。对其进行生物信息学分析表明,该序列推导的蛋白无信号肽,主要由亲水性氨基酸组成,可能存在于细胞质中;其具有类异戊二烯合成酶超家族的保守结构域。荧光定量分析结果表明,SN6306中的Ta CPS1基因在白粉病菌E09诱导处理72 h时,表达量上调了大约45倍,但感病亲本烟农15(YN15)基本不受诱导。在茉莉酸甲酯诱导下,Ta CPS1基因表达量升高将近15倍;在水杨酸诱导下,Ta CPS1基因表达量升高将近2.4倍。推测Ta CPS1基因可能参与小麦抗白粉病机制中的水杨酸和茉莉酸激素调节途径。
- 郭庆东李全权田秋菊钱艳丽许田杨艳林王洪刚封德顺
- 关键词：小麦白粉病抗性
- 中间偃麦草TiAP1基因的克隆及生物信息学分析
- 2017年
- 本研究从烟农15和中间偃麦草杂交所得的小偃麦异附加系SN6306中克隆得到TiAP1基因的全长序列,该序列全长1 272 bp,预测编码423个氨基酸。通过Blast P分析,发现其属于天冬氨酸蛋白酶家族。生物信息学分析发现,TiAP1蛋白含有信号肽且位于第16和17个氨基酸之间,同时含有两个木聚糖酶抑制剂结构域,分别位于该蛋白的N端和C端。此外,通过TMHMM预测,发现该蛋白无跨膜螺旋结构,因此是胞外蛋白。为了检测基因的亲缘关系,构建系统进化树,发现TiAP1基因与乌拉尔图小麦以及粗山羊草相应基因有较近的亲缘关系。上述结果为研究TiAP1基因的功能奠定了基础。
- 田秋菊宋静杨艳琳许田王洪刚封德顺
- 关键词：基因克隆生物信息学分析白粉病
- 中间偃麦草天冬氨酸蛋白酶基因TiASP的克隆及功能分析
- 小麦白粉病是由活体营养专性寄生真菌禾本科布氏白粉菌(Blumeriagraminis f.sp.tritici)引起的一种世界性的气传性病害,主要危害小麦叶片,严重影响了小麦的品质与产量.
- 田秋菊宋静郭庆东鲍印广李兴锋王洪刚封德顺
- 小偃麦异附加系TaXTH基因的克隆与生物信息学分析被引量：3
- 2015年
- 本研究运用Gene Fishing技术,从经过PEG-6000模拟干旱处理的小偃麦异附加系种质SN6306的c DNA中获得了一个长度为586 bp的上调表达差异片段7154。通过NCBI数据库相似性比对,预测其为木葡聚糖内转糖苷酶/水解酶基因(XTH)的一段序列。经克隆和RT-PCR获得Ta XTH的全长c DNA和DNA序列,对其核酸和蛋白序列分析的结果表明,Ta XTH全长DNA序列为2 224 bp,含有3个外显子和2个内含子;其开放阅读框(ORF)长度为936 bp,编码311个氨基酸。Blast P分析结果显示,Ta XTH属于GH16蛋白家族。相似性比对分析结果表明,该蛋白与小麦近缘物种二穗短柄草中的同源蛋白一致性达到79%。从多序列联配及系统进化树分析结果中推断Ta XTH属于XTH类,具有典型的DEIDFEFLG保守基序。
- 黄春丽宋静李全权郭庆东田秋菊高居荣王洪刚封德顺
- 关键词：基因克隆生物信息学分析
