周展
- 作品数：6 被引量：3H指数：1
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- 发文基金：国家自然科学基金浙江省自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生农业科学更多>>
- 癌症相关基因的系统发育地层学研究
- 2024年
- 目的结合“癌症返祖假说”,从系统发育地层学角度分析单细胞生物到多细胞生物的演化过程,研究癌症相关基因的进化年代特征,为癌症机制研究和治疗方案开发提供参考。方法利用系统发育地层追踪方法Phylostratr定位人类所有蛋白质编码基因的进化起源,分析管家基因、癌症驱动基因、抑癌基因、原癌基因、中性基因和分化基因的进化年代特征,通过对数优势比、超几何分布比较不同功能类别基因及人类所有蛋白质编码基因的系统发育地层分布差异。利用TCGA获取肿瘤样本和正常样本基因表达数据,利用转录组年龄指数方法进行比较分析。结果人类20291条蛋白质编码基因根据序列比对结果中最远同源序列物种所在的地层被划分到27个地层中。鉴定4159个管家基因、527个癌症驱动基因、87个抑癌基因、134个原癌基因、10755个中性基因和4274个分化基因在系统发育地层拓扑结构中的分布特征,结果显示不同功能基因的系统发育地层分布与人类所有蛋白质编码基因相比有显著差异,其中癌症相关基因具有更古老的系统发育地层分布。胆管癌、结肠癌、肺腺癌、肝癌、头颈鳞状细胞癌、肾嫌色细胞癌的转录组年龄指数分析显示,肿瘤组织中高度保守的古老基因呈现更高表达。结论癌症相关基因在系统发育地层中具有更古老的进化起源,暗示其在物种进化过程中具有更保守的功能。肿瘤组织中高度保守的古老基因表达增强的现象,可用于探索肿瘤基因表达模式,为抗肿瘤药物新靶点发现及药物研究提供新思路。
- 王偲琪谷迅周展
- 肿瘤细胞膜蛋白体细胞突变分析被引量：1
- 2015年
- 目的筛选肿瘤细胞特异性膜蛋白胞外突变(特异性膜表面蛋白突变),以期寻找癌症精准医疗的作用靶点。方法收集7042个肿瘤样本的体细胞突变信息,通过对体细胞突变位点进行基因定位分析,筛选出全部特异性膜蛋白胞外突变,并统计分析这些突变的整体分布情况,鉴定特异性膜蛋白胞外突变频率较高的基因、突变位点以及肿瘤类型。结果对7042个肿瘤样本的4938362个体细胞突变,共筛选出97193个特异性膜蛋白胞外突变,统计分析结果显示这些突变涉及4347个基因,包括65532个基因位点。进一步分析鉴定出发生特异性膜蛋白胞外突变频率较高的5个基因(MUC16、LRP1B、CSMD3、RYR2、USH2A),1个突变位点(17∶37868208)以及6个肿瘤类型(结直肠癌、黑素瘤、子宫癌、脑胶质瘤、肺癌和胃癌)。结论建立了特异性膜蛋白胞外突变信息库,并得到了该类突变的整体分布情况,为寻找癌症精准医疗的作用靶点提供了信息参考。
- 吴姗姗周展陈枢青
- 关键词：作用靶点体细胞突变
- 抗体偶联药物的文献计量分析
- 2016年
- 目的检索和分析国内外与抗体偶联药物(antibody-drug conjugates,ADCs)相关的文献资料,了解ADCs的研究进展和现状。方法设计检索策略和文献纳入排除标准,检索截止至2016年1月Pubmed、Web of Science以及CNKI数据库中有关ADCs的全部文献,利用End Note X7软件进行整理,采用文献计量学方法,对文献类型、发表年份、第一作者、研究机构、发表期刊、被引频次、研究内容和专利情况进行计量分析。结果纳入的国内外相关文献共645篇,其中,外文495篇,中文150篇。21世纪后,报道ADCs的文献大幅增加,以美国发文量最多。发文量最多的第一作者是Krop IE和Younes A,载文量最多的期刊为《癌症临床研究》。文献最高被引686次。研究内容主要涉及靶点选择、定点偶联及"弹头"药物等。结论 ADCs是肿瘤研究领域的热点,已经取得了突破性进展,但依旧存在着很大的改进空间,仍需更深入的探索。
- 徐瑛周婕周展陈枢青
- 关键词：ADCS文献计量分析靶向治疗
- 肿瘤精准医疗的手段——个性化抗体偶联药物被引量：2
- 2016年
- 体细胞突变是肿瘤形成的重要原因和造成肿瘤异质性的关键因素,传统方法并未充分利用这一点对恶性肿瘤进行针对性治疗。精准医疗(precision medicine)是建立在深入了解个体基因组信息和体细胞突变信息的基础上,利用生物信息学和医学技术进行精确诊断,并借助靶向药物等进行精准治疗,为一种全新的个性化医疗模式,在恶性肿瘤的治疗中日益凸显出其临床价值。癌细胞因基因突变产生特异性抗原,是抗体类靶向药物的理想靶点。个性化抗体偶联药物(personalized antibody-drug conjugates,PADC)是将细胞毒性小分子偶联到突变特异性抗体上的一类药物,与传统抗体偶联药物(ADC)不同,其仅特异性识别患者癌细胞上的突变新抗原,与正常细胞无交叉结合。因此PADC能将小分子毒物特异靶向到癌细胞,实现增效减毒的效果,有望成为肿瘤精准医疗的重要手段。本文从体细胞突变产生肿瘤特异性抗原、发现新生抗原到特异性抗体制备、PADC的制备及定点清除肿瘤细胞几方面进行阐述,描绘出PADC作为肿瘤精准医疗手段的蓝图。
- 韦小越周展陈枢青
- 关键词：体细胞突变个性化
- 在线人类孟德尔遗传数据库的分析
- 2017年
- 目的 对在线人类孟德尔遗传数据库（OMIM）进行分析,加深对其的了解,为使用该数据库的研究人员提供参考。方法将OMIM数据库中19 414个遗传表型所对应的基因变异与1000 Genome Project,GO-ESP,ExAC等人类基因组或外显子组数据库进行比对,得到这些基因变异在各人群中的突变频率,对其进行统计学生物学分析。结果 19414个基因变异中,大约97.5%的基因变异的突变频率不高于1%,为罕见突变,320个基因变异的突变频率在3个数据库中均大于1%,为可信度较高的常见突变;19414个基因变异对应的表型中,127个表型为polymorphism,584个表型为susceptibility,而在320（1.6%）个常见突变对应的表型中有62个polymorphism,88个susceptibility,分别占48.8%和15.1%。结论OMIM中大部分基因变异为罕见突变;polymorphism和susceptibility在常见突变对应的表型中富集,在突变频率为10%~100%的变异中富集程度更高。
- 吴静成吕兴正雷雅静周婕周展陈枢青
- 关键词：单基因遗传病基因频率
- 生物反应器悬浮培养禽偏肺病毒制备弱毒疫苗工艺的优化
- 2022年
- 目的对生物反应器悬浮培养禽偏肺病毒(avian metapneumovirus,aMPV)制备弱毒疫苗的工艺进行优化。方法采用分批培养的方法优化悬浮BHK-21细胞在生物反应器内培养及aMPV增殖工艺,并对制备的疫苗进行动物安全性及攻毒保护试验。结果采用1.0×10^(6)cells/mL的初始接种密度培养BHK-21悬浮细胞,细胞能快速度过延滞期进入对数生长期,培养72 h细胞密度可达1.6×10^(7)cells/mL。调整细胞密度为3.0×10^(6)cells/mL,按照感染复数MOI=0.1的剂量接种病毒,病毒含量可达10^(8.67)TCID_(50)/mL。制备的疫苗安全性良好,可有效保护番鸭,保护率为100%。结论优化了生物反应器培养aMPV的工艺,可获得较高的病毒效价,为aMPV疫苗的规模化生产提供了参考。
- 蒋天华周庆丰严专强周展
- 关键词：BHK-21细胞生物反应器
