吴萌
- 作品数：9 被引量：2H指数：1
- 供职机构：中国医学科学院北京协和医学院医学信息研究所更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金中央高校基本科研业务费专项资金国家社会科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学自动化与计算机技术更多>>
- 黑色素瘤单病种本体构建研究
- 2021年
- 利用百科知识、临床指南、科技文献、专家经验等多源异构资源进行本体顶层范畴界定,借助Ontofox、Protégé等本体工具采集并组织黑色素瘤疾病、分子异常、症状、解剖结构、药物、干预与操作、并发症等顶层范畴的概念和术语,构建黑色素瘤单病种本体并对其评估,开发本体展示和检索工具,为相关领域研究提供参考。
- 康宏宇李勤李勤吴萌李姣李姣
- 关键词：单病种黑色素瘤本体构建知识检索
- 一种本体构建方法、装置及计算机可读介质
- 本申请公开一种本体构建方法、装置及计算机可读介质，本申请通过采用适合的模型自动为待构建的目标本体进行主题范围锁定，并自动在所锁定的主题范围内，对待构建的目标本体进行概念等内容范围的确定，以及通过概念术语的自动映射实现术语...
- 马鹤桐李姣王序文沈柳吴萌王嘉阳
- 临床药理学知识模型构建研究被引量：1
- 2018年
- 分析临床药理学知识表示与模型研究现状,阐述临床药理学知识模型构建技术路线、知识来源、模型框架和具体方法,以非小细胞肺癌为例介绍模型应用并对可行性进行验证,最后提出不足并展望未来发展方向。
- 沈柳侯丽康宏宇吴萌郑思李姣
- 关键词：临床药理学知识模型非小细胞肺癌
- 面向精准医学的基因突变数据分类与融合研究被引量：1
- 2018年
- 目的:通过调研现有的基因突变数据标准,包括分类标准、命名标准以及组织标准,制定一套整合式的基因突变数据分类体系以融合多来源异构的突变数据。方法:从Clin Var和COSMIC突变数据库中获取基因突变数据,根据数据特征对基因突变数据进行标准化融合。通过与已制定的分类体系进行映射,对融合后的基因突变数据进行标准化分类注释。结果:构建的基因突变分类体系包括术语34条,突变数据库包括突变概念746 504个,突变术语1 083 397个。结论:基因突变数据分类体系可提供一种有效的基因突变数据分类和突变数据整合方案,对推动突变数据的融合、标准化与共享和疾病的精准治疗具有重要意义。
- 吴萌李姣康宏宇侯丽
- 关键词：基因突变数据融合
- 抗癌药物基因组学知识表示模型构建被引量：1
- 2019年
- 目的:通过构建抗癌药物基因组学知识表示模型,丰富药物、基因、疾病以及个性化用药等之间的语义关系,为临床医生精准用药、联合用药等提供参考依据,为药学科研人员开展新药研发、老药新用等研究提供理论支持,为癌症患者查询药物知识提供服务支撑。方法:对DrugBank、RxNorm、FDA药品说明书等药物基因组数据进行整合和抽取,在通用药物基因组学知识表示模型的基础上,涵盖药物、基因、疾病3个基本维度,并拓展个性化用药、药物副作用等知识维度,设计知识表示框架,确立相关实体类型,发现和定义实体与实体之间的语义关系。在构建好的抗癌药物基因组学知识表示模型的基础上,以黑色素瘤相关药物为例,对知识表示模型进行填充,并对实体和实体间语义关系进行可视化表达。结果:实现了药物、基因、疾病、个性化用药、药物副作用5类实体的概念抽取,定义了实体间的15种语义关系,构建了黑色素瘤药物基因组学相关的136个知识三元组。结论:面向抗癌药物精准用药的药物基因组学知识表示模型可以确定癌症用药与基因突变、人群、药物副作用之间的关联和推动药物基因组学知识在临床研究中的应用。
- 康宏宇李姣吴萌侯丽
- 关键词：药物基因组学知识模型信息整合抗癌药物知识抽取知识整合
- 一种本体构建方法、装置及计算机可读介质
- 本申请公开一种本体构建方法、装置及计算机可读介质，本申请通过采用适合的模型自动为待构建的目标本体进行主题范围锁定，并自动在所锁定的主题范围内，对待构建的目标本体进行概念等内容范围的确定，以及通过概念术语的自动映射实现术语...
- 马鹤桐李姣王序文沈柳吴萌王嘉阳
- 面向继续医学教育的多模态围产保健知识图谱构建研究
- 2024年
- 目的/意义将多模态知识图谱应用于围产保健继续医学教育,以提高医护人员围产保健服务质量。方法/过程结合北京协和医院围产保健继续教育项目学员需求和课程主要特点构建顶层本体,对本体类、关系和属性进行设计和定义,利用不同粒度教学资源表示教学内容,利用Protégé软件构建围产保健知识图谱概念层和实例层。基于团队自主研发的医学知识服务平台MedKaaS,实现多模态实体进一步交互式构建,以及围产保健课程知识的可视化、检索和问答。结果/结论该多模态知识图谱实现了围产保健课程内容的语义化整合,有助于学员直观和有针对性地学习围产保健知识。
- 吴萌杨林沈柳张素菡王敏孙振凤徐晓巍刘娜娜王亚新侯丽李姣马良坤
- 关键词：知识图谱围产保健医学教育
- 国际生物医学科学数据审编研究热点探析
- 2017年
- 以2015-2016年两届国际生物医学审编会议上领域专家讨论的报告和会议论文集,以及PubMedCentral中近5年来有关Biocuration和Data Biocuration的研究文献为数据源,采用内容分析法对生物医学科学数据审编的研究主题进行分析、归纳和总结,重点从Biocuration的工作机制、生物医学数据标准构建与应用、集成与可视化、审编与应用、生物医学文本挖掘等方面进行梳理,以期为我国生物医学科学数据审编的发展提供国际经验。
- 侯丽吴萌侯震李姣
- 以细胞系为中心的基因-突变-疾病语义网络构建研究
- 2019年
- 阐述语义模型在生物医学领域的研究和应用现状,提出构建一个以细胞系为中心,包含基因、突变与疾病间语义关系的语义网络,详细介绍语义网络的设计流程、数据处理方法与步骤,比较、总结、验证所完成的语义网络与其他相关数据库的全面性、完整性与正确性。
- 吴萌李姣侯丽
- 关键词：知识图谱语义网
