吕翎娜 作品数:20 被引量:20 H指数:3 供职机构: 首都医科大学附属北京胸科医院 更多>> 发文基金: 国家科技重大专项 北京市自然科学基金 北京市优秀人才培养资助 更多>> 相关领域: 医药卫生 更多>>
用于扩增结核分枝杆菌耐药相关基因的引物对组合产品 本发明涉及一种用于扩增结核分枝杆菌耐药相关基因的引物对组合产品,其选自如下引物对组合中的任一组或两组:第一组,包括核苷酸序列分别如SEQ ID NO:1‑10所示的引物对中的一对、多对或全部;第二组,包括核苷酸序列分别如... 孙照刚 李自慧 潘丽萍 吕翎娜 孙琪 张洪静 许绍发 张宗德 夏学良文献传递 与人类蛋白SMAD2相互作用的结核蛋白及其应用 本发明公开了与人类蛋白SMAD2相互作用的结核蛋白及其应用。本发明提供了人类蛋白SMAD2在如下任一中的应用:(A1)诊断结核病;(A2)制备用于诊断结核病的产品。本发明利用基于MTB结核分枝杆菌蛋白质组芯片的蛋白‑蛋白... 曹廷明 吕翎娜 张宗德文献传递 结核分枝杆菌IS6110和IS1081微滴数字PCR检测体系的建立和应用 2018年 目的建立结核分枝杆菌IS6110和IS1081微滴数字PCR(droplet digital PCR,ddPCR)检测体系,并用于不同类型临床样本的检测。方法常规提取13株结核分枝杆菌和14株非结核分枝杆菌临床分离株DNA,9例结核分枝杆菌阳性肺结核患者和4例其他肺部疾病患者痰DNA,12例结核分枝杆菌阳性肺结核患者和7例健康者血浆DNA。设计合成IS6110和IS1081扩增引物和检测探针,建立ddPCR检测体系。应用该体系检测分枝杆菌、痰和血浆3种DNA样本中靶标拷贝数,进行统计学分析。结果建立了能同时检测IS6110和IS1081的ddPCR体系,该体系检测2个靶标的线性范围分别为0.5~8733和0.2~2893拷贝/μl反应体系。该体系具有较好的重复性(r〉0.95),以非结核分枝杆菌为对照检测结核分枝杆菌的灵敏度和特异度均为100%。在痰和血浆DNA样本检测中,2个靶标拷贝数在肺结核组均显著高于对照组。结论结核分枝杆菌特异性核酸的ddPCR体系,可用于肺结核患者临床分离株、痰和血浆样本的微量核酸检测,对提高结核病病原学诊断能力有重要意义。 李自慧 吕翎娜 杜博平 潘丽萍 贾红彦 孙琦 张宗德关键词:结核分枝杆菌 聚合酶链式反应 IS6110 结核分枝杆菌IS6110和IS1081微滴数字PCR检测体系的建立和应用 被引量:6 2018年 目的建立结核分枝杆菌IS6110和IS1081微滴数字PCR(droplet digital PCR,dd PCR)检测体系,并用于不同类型临床样本的检测。方法常规提取13株结核分枝杆菌和14株非结核分枝杆菌临床分离株DNA,9例结核分枝杆菌阳性肺结核患者和4例其他肺部疾病患者痰DNA,12例结核分枝杆菌阳性肺结核患者和7例健康者血浆DNA。设计合成IS6110和IS1081扩增引物和检测探针,建立dd PCR检测体系。应用该体系检测分枝杆菌、痰和血浆3种DNA样本中靶标拷贝数,进行统计学分析。结果建立了能同时检测IS6110和IS1081的dd PCR体系,该体系检测2个靶标的线性范围分别为0.5~8 733和0.2~2 893拷贝/μl反应体系。该体系具有较好的重复性(r>0.95),以非结核分枝杆菌为对照检测结核分枝杆菌的灵敏度和特异度均为100%。在痰和血浆DNA样本检测中,2个靶标拷贝数在肺结核组均显著高于对照组。结论结核分枝杆菌特异性核酸的dd PCR体系,可用于肺结核患者临床分离株、痰和血浆样本的微量核酸检测,对提高结核病病原学诊断能力有重要意义。 李自慧 吕翎娜 杜博平 潘丽萍 贾红彦 孙琦 张宗德关键词:结核分枝杆菌 聚合酶链式反应 IS6110 结核分枝杆菌膜囊泡的分离及其功能初探 目的分离体外培养的结核分枝杆菌分泌的膜囊泡,检测其形态和粒径分布,初步探索结核分枝杆菌膜囊泡对巨噬细胞中细胞因子释放的作用。方法 7H9培养基复苏、扩大培养结核分枝杆菌实验室参考株H37Rv至对数期,菌体全部接种于苏通培... 吕翎娜 贾红彦 廖莎 武剑楠 孙照刚 张宗德关键词:结核分枝杆菌 细胞因子 文献传递 用于扩增结核分枝杆菌耐药相关基因的引物对组合产品 本发明涉及一种用于扩增结核分枝杆菌耐药相关基因的引物对组合产品,其选自如下引物对组合中的任一组或两组:第一组,包括核苷酸序列分别如SEQ ID NO:1‑10所示的引物对中的一对、多对或全部;第二组,包括核苷酸序列分别如... 孙照刚 李自慧 潘丽萍 吕翎娜 孙琪 张洪静 许绍发 张宗德 夏学良文献传递 不同毒性结核分枝杆菌感染巨噬细胞后基因组DNA甲基化水平的变化 2017年 目的比较不同毒性MTB感染巨噬细胞后基因组DNA甲基化水平的变化。方法以对数生长期的MTB实验室标准株H37Rv和H37Ra分别感染经佛波酯(50ng/m1)诱导分化的人单核巨噬细胞系(THP-1)作为实验组:THP-1/Ra组和THP-1/Rv组,同时设置未感染MTB的对照组。分别提取3份细胞样本的基因组DNA,采用简化甲基化测序(reducedrepresentationbisulfitesequencing,RRBS)方法进行甲基化测序。用生物信息学分析方法比较各样本DNA整体甲基化水平,重点分析样本间差异性甲基化区域(differentiallymethylatedregion,DMR),对DMR位于启动子区的相关基因进行功能注释、基因本体论(GO)聚类及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析,最终通过实时荧光定量PCR方法验证部分基因的表达。两样本间差异分析采用t检验。结果THP-1/Rv组、THP-1/Ra组以及对照组中甲基化C碱基以CG类型为主,占全部甲基化c碱基类型(CG、CHG、CHH)的98%以上;3组样本中基因启动子区的所有c碱基平均甲基化水平分别为7.72%、7.38%和7.58%;CpG岛(CGI)所有c碱基平均甲基化水平分别为9.90%、9.57%和9.80%。与THP-1/Ra组相比,THP.1/Rv组基因组DNA上定位到58个差异DMR,其区域平均长度为152bp。对DMR位于启动子区的相关基因进行GO聚类及KEGG通路分析,发现6个高度富集于13条通路的基因,其中DNA损伤诱导转录子4(DDIT4)和转录激活蛋白I(AP-1)在THP-1/Ra组和THP-1/Rv组的表达具有显著差异。结论MTB感染巨噬细胞系后细胞基因组未出现整体甲基化水平的增加或降低,而部分区域出现甲基化差异,且不同毒性MTB感染组表现出区域甲基化水平的差异。此外,DDIT4和AP.1可能是2个新的与MTB毒性相关的基因。 吕翎娜 贾红彦 李自慧 刘忠泉 张宗德关键词:分枝杆菌 结核 巨噬细胞 DNA甲基化 与人类蛋白NRF1相互作用的结核蛋白及其应用 本发明公开了与人类蛋白NRF1相互作用的结核蛋白及其应用。本发明提供了人类蛋白NRF1在如下任一中的应用:(A1)诊断结核病;(A2)制备用于诊断结核病的产品。本发明利用基于MTB结核分枝杆菌蛋白质组芯片的蛋白‑蛋白互作... 曹廷明 吕翎娜 张宗德文献传递 与活动性结核病相关的外泌体分子标识 本发明公开了与活动性结核病相关的外泌体分子标识。本发明公开的分子标识——RFPL3S、ENO4、NTS、ZNF705A、POSTN、RBM11、TSEN15、MMRN1、PWP1、TRHDE、PRKX、ERCC8、EFC... 吕翎娜 张宗德 陈非 李翠丹 张秀丽 丁楠 王敬慧 贾红彦 潘丽萍文献传递 结核分枝杆菌耐药相关基因扩增多重PCR体系的建立与评估 被引量:8 2017年 目的建立结核分枝杆菌耐药相关基因多重PCR反应体系,评估该体系以临床分离株DNA和痰菌DNA为模板扩增耐药相关基因的成功率。方法常规提取结核分枝杆菌临床分离株(47株)及涂阳肺结核患者(21例)痰菌DNA。根据目前研究已发现的结核分枝杆菌耐药相关基因合成引物,建立2个多重PCR体系以扩增目的基因。扩增片段经测序证实后,计算该体系用于两种样本的扩增成功率。结果针对临床常用8种抗结核药物,选取结核分枝杆菌rpoB、katG、inhA、embB、gyrA、rpsL、rrs、eis共8个耐药相关基因设计合成引物。建立2个多重PCR体系扩增8个耐药基因,该体系扩增47株结核分枝杆菌临床分离株DNA和21例菌阳肺结核患者痰菌DNA的成功率分别为100.0%(47/47)和76.2%(16/21)。结论本研究建立了高效扩增8个结核分枝杆菌耐药基因的多重PCR体系,结果对进一步研发结核病耐药分子诊断产品具有重要意义。 李自慧 潘丽萍 孙琦 吕翎娜 杜博平 张洪静 孙照刚 张宗德关键词:基因测定 核酸扩增技术