孙景贤
- 作品数：14 被引量：19H指数：3
- 供职机构：大连海洋大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金辽宁省自然科学基金中央级公益性科研院所基本科研业务费专项更多>>
- 相关领域：农业科学生物学天文地球更多>>
- 用于鉴别紫海胆-中间球海胆杂交种的PCR引物及鉴别方法
- 本发明公开一种用于鉴别紫海胆‑中间球海胆杂交种的PCR引物，核苷酸序列如下：上游引物：5' ttttatctcctccctttttatytct 3'；下游引物：5' cctcwaaagtagttaagattgggac 3...
- 常亚青湛垚垚孙景贤张伟杰
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- 准确区分紫海胆-中间球海胆和紫海胆上市性腺的方法
- 本发明公开一种准确区分紫海胆‑中间球海胆和紫海胆上市性腺的方法，是以15种小分子代谢物的相对含量标准区间值为标志区分紫海胆‑中间球海胆杂交种上市性腺与紫海胆上市性腺，首先取待区分的海胆上市性腺并经过前期处理制成样本，通过...
- 常亚青湛垚垚宋坚孙景贤赵谭军
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- 棘皮动物线粒体基因组研究进展被引量：1
- 2021年
- 线粒体基因组是存在于真核生物线粒体中的重要遗传物质,可独立进行复制、转录和蛋白质合成。与核基因组相比,线粒体基因组具有长度相对较短、点突变率高等特点,被认为是研究生物系统进化的重要对象之一。近年来,在海洋生物研究中,线粒体基因组已被广泛应用于遗传分析、种质鉴定、分子标记挖掘以及系统进化研究等领域并取得了丰富的成果。棘皮动物在全球海洋中分布广泛,属无脊椎动物的高等类群,也是无脊椎动物向脊椎动物进化的重要节点生物。目前已有97个物种完成了线粒体基因组的测序。棘皮动物的线粒体基因组包含37个基因,其中ND6基因均分布于轻链。海胆和海星的基因排列顺序最为保守。棘皮动物在绝大多数情况下会使用ATG作为起始密码子,使用TAA和TAG作为终止密码子。根据现有的线粒体基因组数据和分析方法可以阐明绝大多数棘皮动物的分类与系统进化关系,但仍有一些物种的分析结果缺乏足够的可信度。棘皮动物线粒体基因组研究尚有很多方面仍需进一步开展。
- 孙景贤赵谭军尹文露刘丽常亚青湛垚垚
- 关键词：棘皮动物线粒体基因组系统发育
- 中间球海胆丙酮酸激酶(PK)基因克隆及其对海水酸化的响应被引量：5
- 2020年
- 为明确中间球海胆Strongylocentrotus intermedius丙酮酸激酶(Pyruvate kinase,PK)基因(SiPK)的序列特征、组织表达规律及其对海水酸化胁迫的响应方式,采用cDNA末端快速扩增RACE技术方法获得了SiPK的cDNA全长序列,同时探究了该基因在不同海水酸化[自然海水(对照组)、ΔpH=-0.3(SA1)、ΔpH=-0.4(SA2)、ΔpH=-0.5(SA3),ΔpH表示与自然海水pH的差值]胁迫条件下的响应方式。结果表明:中间球海胆PK序列全长为3616 bp,其中,包含一个编码537个氨基酸的开放阅读框(1614 bp)和两个非编码区片段(5′非编码区长度为91 bp,3′非编码区长度为1911 bp);系统进化分析发现,中间球海胆PK氨基酸序列与紫球海胆Strongylocentrotus purpuratus PK的亲缘关系最近;实时荧光定量PCR(qRT-PCR)发现,成体中间球海胆PK基因在4种组织中均有表达,其相对表达量依次为性腺>管足>体腔液>肠;总PK酶活性检测显示,中间球海胆4种组织中的总PK酶活性依次为管足>性腺>体腔液>肠;海水酸化胁迫试验显示,与对照组相比,随着海水酸化程度的加重,中间球海胆肠组织中PK基因的相对表达量呈先极显著降低后极显著升高的趋势(P<0.01),但肠组织中总PK酶活性则呈极显著升高的趋势(P<0.01),性腺组织中PK基因的相对表达量随海水pH的降低而极显著降低(P<0.01),但该组织中总PK酶活性却呈现先升高后降低的趋势(P<0.05),管足和体腔液组织中PK基因的相对表达量和总PK酶活性均随海水pH的降低总体呈降低的趋势(P<0.05)。研究表明,中间球海胆可通过调节PK基因的表达及总PK酶活性响应海水酸化胁迫。
- 尹文露崔东遥李莹莹孙景贤李雯琪常亚青湛垚垚
- 关键词：中间球海胆丙酮酸激酶基因克隆酶活性
- 中间球海胆乳酸脱氢酶基因克隆及其对海水酸化的响应被引量：10
- 2019年
- 为明确中间球海胆乳酸脱氢酶(LDH)基因序列及表达特征,研究其对海水酸化胁迫的响应,实验利用cDNA末端快速扩增(RACE)技术获得中间球海胆LDH基因(命名为SiLDH)的全长cDNA,并且比较了海水酸化胁迫下,中间球海胆不同组织SiLDH基因表达及总LDH活性的变化情况。结果显示:①SiLDH基因的cDNA全长为1 499 bp,包含133 bp的5′非编码区,349 bp的3′非编码区和1 017 bp编码338个氨基酸的开放阅读框(ORF)。SiLDH编码蛋白的相对分子量为36.40 ku,理论等电点为6.55,属于无信号肽的非跨膜、温和疏水蛋白。②生物信息学分析显示,SiLDH蛋白序列与紫球海胆LDH X4蛋白序列一致性最高(90.88%)。③实时荧光定量PCR(qRT-PCR)发现,SiLDH基因在检测的4种组织中均有表达,相对表达量从高到低为性腺>管足>肠>体腔液;总LDH活性检测显示,中间球海胆总LDH活性从高到低为性腺>管足>体腔液>肠;④海水酸化处理60 d后发现,与自然海水组(pH 8.06±0.01)相比,SiLDH基因在中间球海胆性腺、管足和肠道中呈现总体降低趋势,在体腔液中则呈现随海水pH降低先降低后显著升高的趋势;总LDH活性在性腺、管足和体腔液中呈现随海水pH降低而降低的趋势,在肠道中则呈现随海水pH降低先降低后显著升高的趋势。研究表明,中间球海胆面对海水酸化时可能通过调节SiLDH基因的表达和LDH活性来缓解海水酸化带来的负面影响。
- 崔东遥任丽媛邢冬飞孙景贤李莹莹常亚青湛垚垚
- 关键词：中间球海胆乳酸脱氢酶基因克隆基因表达酶活性
- 水产动物Akt基因研究进展被引量：2
- 2019年
- Akt(RAC-alpha serine/threonine-protein kinase)是一种丝氨酸(Ser)或苏氨酸(Thr)蛋白激酶,也称为蛋白激酶B(PKB),可以磷酸化多种转录因子,在细胞增殖、细胞免疫应答、细胞代谢调控、细胞发育及存活等过程中发挥重要作用。目前有关水产动物Akt基因及其生物学功能的研究处于起步阶段,资料尚缺乏,本研究中就近年来水产动物Akt基因的序列特征、进化特点、参与的主要通路,以及参与调控鱼类的胚胎发育过程、甲壳类与贝类的免疫防御过程等生物功能等进行综述,指出今后可利用同源克隆或基因组数据挖掘技术获得更多水产动物的Akt基因信息,以便系统和全面地了解该基因在水产动物中的系统进化特点和规律,深入探究不同生理、病理条件下,不同水产动物的Akt基因的响应规律及该基因与其下游靶基因的互作机制,进一步筛选和挖掘能够调控水产动物Akt基因表达的表观遗传调控因子。本研究结果可为充分认识和利用水产动物Akt基因的生物学功能提供更为丰富的资料和线索。
- 刘丽孙景贤常亚青崔东遥李莹莹李开全湛垚垚
- 关键词：AKT基因蛋白激酶B水产动物
- 用于鉴别紫海胆-中间球海胆杂交种的PCR引物及鉴别方法
- 本发明公开一种用于鉴别紫海胆‑中间球海胆杂交种的PCR引物，核苷酸序列如下：上游引物：5'ttttatctcctccctttttatytct3'；下游引物：5'cctcwaaagtagttaagattgggac3'；鉴别...
- 常亚青湛垚垚孙景贤张伟杰
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- 不同海水酸化模式对马粪海胆胚胎和浮游幼体骨针发育的影响（英文）
- 2018年
- 为了比较CO_2引起的海水酸化和HCI引起的海水酸化对棘皮动物的影响,本研究以中国北方海岸带土著种-马粪海胆(Hemicentrotus pulcherrimus)为对象,分析比较了两种海水酸化模式对马粪海胆胚胎和骨针发育的影响。根据IPCC对2100年海水酸化程度的预测,在实验室条件下,建立了自然海水组(pH=8.06±0.01)和六个海水酸化处理组(三个CO_2处理组和三个HCI处理组)。结果表明:(1)与自然海水组相比,酸化处理组马粪海胆胚胎的卵裂率呈现随海水pH下降而延长的趋势,与HCI酸化处理相比,CO_2处理对马粪海胆胚胎卵裂率的影响更为严重;(2)两种海水酸化模式下,马粪海胆浮游幼体四腕浮游幼体均出现对称性缺失和骨针外露现象;(3)与自然海水组相比,两种海水酸化模式对马粪海胆四腕浮游幼体骨针发育具有不同影响,HCI酸化处理组浮游幼体呈现骨针变短现象,而CO_2处理组四腕幼体的骨针则出现变长现象;(4)扫描电镜结果显示,海水酸化可影响马粪海胆浮游幼体骨针的钙化结构,当海水△pH=-0.5时,CO_2处理组马粪海胆浮游幼体骨针的腐蚀程度要比HCI处理组更为严重。本研究结果提示,不同的海水酸化模式对马粪海胆胚胎和骨针发育有不同程度的影响,相比强酸(HCI)引起的海水酸化而言,CO_2引起的海水酸化对马粪海胆的影响更为严重。
- 李家祥杨梦羽孙景贤崔东遥李莹莹常亚青胡婉彬段立柱张伟杰湛垚垚
- 关键词：马粪海胆胚胎发育浮游幼体
- 光棘球海胆TGFBR2基因的克隆及其对海水酸化的响应被引量：1
- 2020年
- 为了探究光棘球海胆(Mesocentrotus nudus)转化生长因子-βⅡ型受体(Transforming growth factor-βreceptor typeⅡ,TGFBR2)基因的序列信息及其响应海水酸化的模式和规律。本研究利用同源克隆和cDNA末端快速扩增技术(RACE)首次获得光棘球海胆TGFBR2基因(MnTGFBR2)的cDNA全长序列。结果显示:该基因全长为2260 bp,其中5’非编码区长度为227 bp,3’非编码区长度为254 bp,开放阅读框长度为1776 bp,编码一个含592个氨基酸的多肽。MnTGFBR2蛋白理论分子量为66.11 kD,理论等电点为5.30。同源性及系统进化分析显示,Mn TGFBR2蛋白与紫球海胆(Strongylocentrotus purpuratus)TGFBR2蛋白聚为最近的一支,二者序列一致性高达95.97%。实时荧光定量PCR(qRT-PCR)结果显示,MnTGFBR2在管足、围口膜、体腔液、肠和性腺5种组织中均有表达,其相对表达量从高到低依次为:管足>围口膜>体腔液>肠>性腺。海水酸化处理实验发现,随着酸化时间的延长,与自然海水组相比,当海水pH值下降0.3个单位时,光棘球海胆性腺组织和肠组织中MnTGFBR2的相对表达均呈先极显著降低(p<0.01)后升高的趋势;当海水pH值下降0.4个单位时,光棘球海胆性腺组织中MnTGFBR2的相对表达呈先极显著降低(p<0.01)后升高再降低的趋势,而肠组织中MnTGFBR2的相对表达则一直呈现极显著降低趋势(p<0.01);当海水pH值下降0.5个单位时,光棘球海胆性腺组织中MnTGFBR2的相对表达呈先极显著降低(p<0.01)再升高的趋势,而肠组织中MnTGFBR2的相对表达则呈显著降低(p<0.05)的趋势。
- 李莹莹崔东遥程操孙景贤刘丽赵谭军尹文露常亚青湛垚垚
- 关键词：光棘球海胆基因克隆
- 中间球海胆（Strongylocentrotus Intermedius）与紫海胆（Anthocidaris crassispina）管足中mi RNA的比较分析
- 微小RNA（miRNA）是一类内源性小的非编码RNA,其在调节真核生物的许多生物过程中起关键作用。中间球海胆（Strongylocentrotus Intermedius）和紫海胆（Anthocidaris crassi...
- 李莹莹崔东遥孙景贤湛垚垚常亚青
- 关键词：中间球海胆紫海胆MICRORNA
- 文献传递
